MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	162417828
2	NC_010158	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	162417939
3	NC_010158	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010158	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010158	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010158	T	6	6	2385	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010158	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010158	T	7	7	2652	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	162417882
9	NC_010158	T	6	6	2705	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	162417882
10	NC_010158	A	7	7	2746	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	162417882
11	NC_010158	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010158	C	6	6	3548	3553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_010158	C	6	6	3629	3634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_010158	C	6	6	3794	3799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_010158	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010158	A	7	7	4094	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010158	T	8	8	4264	4271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010158	A	7	7	4413	4419	100 %	0 %	0 %	0 %	162417887
19	NC_010158	A	6	6	4550	4555	100 %	0 %	0 %	0 %	162417887
20	NC_010158	A	7	7	4699	4705	100 %	0 %	0 %	0 %	162417887
21	NC_010158	A	7	7	5910	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010158	A	7	7	5926	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010158	A	7	7	6093	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	162417857
24	NC_010158	A	7	7	6363	6369	100 %	0 %	0 %	0 %	162417857
25	NC_010158	T	6	6	8702	8707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010158	A	8	8	9076	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010158	T	6	6	9218	9223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010158	T	7	7	9231	9237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010158	T	7	7	9353	9359	0 %	100 %	0 %	0 %	162417840
30	NC_010158	A	6	6	9413	9418	100 %	0 %	0 %	0 %	162417840
31	NC_010158	A	6	6	9538	9543	100 %	0 %	0 %	0 %	162417840
32	NC_010158	A	6	6	10610	10615	100 %	0 %	0 %	0 %	162417912
33	NC_010158	C	6	6	11207	11212	0 %	0 %	0 %	100 %	162417858
34	NC_010158	T	6	6	11623	11628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010158	A	6	6	11740	11745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010158	T	6	6	11981	11986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010158	T	6	6	11993	11998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010158	A	6	6	12134	12139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010158	T	7	7	12260	12266	0 %	100 %	0 %	0 %	162417923
40	NC_010158	T	6	6	12313	12318	0 %	100 %	0 %	0 %	162417923
41	NC_010158	A	7	7	12354	12360	100 %	0 %	0 %	0 %	162417923
42	NC_010158	A	6	6	13100	13105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010158	C	6	6	13156	13161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_010158	C	6	6	13237	13242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_010158	C	6	6	13402	13407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_010158	T	6	6	13669	13674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010158	A	7	7	13702	13708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010158	T	8	8	13872	13879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010158	A	7	7	14021	14027	100 %	0 %	0 %	0 %	162417849
50	NC_010158	A	6	6	14158	14163	100 %	0 %	0 %	0 %	162417849
51	NC_010158	A	7	7	14307	14313	100 %	0 %	0 %	0 %	162417849
52	NC_010158	A	7	7	15518	15524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010158	A	7	7	15534	15540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010158	A	7	7	15701	15707	100 %	0 %	0 %	0 %	162417846
55	NC_010158	A	7	7	15971	15977	100 %	0 %	0 %	0 %	162417846
56	NC_010158	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010158	A	8	8	18684	18691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010158	T	6	6	18826	18831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010158	T	7	7	18839	18845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010158	T	7	7	18961	18967	0 %	100 %	0 %	0 %	162417829
61	NC_010158	A	6	6	19021	19026	100 %	0 %	0 %	0 %	162417829
62	NC_010158	A	6	6	19146	19151	100 %	0 %	0 %	0 %	162417829
63	NC_010158	A	6	6	20218	20223	100 %	0 %	0 %	0 %	162417833
64	NC_010158	C	6	6	20815	20820	0 %	0 %	0 %	100 %	162417864
65	NC_010158	A	6	6	24740	24745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010158	T	6	6	25390	25395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010158	T	7	7	27823	27829	0 %	100 %	0 %	0 %	162417866
68	NC_010158	T	7	7	29741	29747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010158	G	7	7	29905	29911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010158	A	6	6	29956	29961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010158	A	6	6	30679	30684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010158	T	6	6	34377	34382	0 %	100 %	0 %	0 %	162417826
73	NC_010158	T	6	6	35710	35715	0 %	100 %	0 %	0 %	162417913
74	NC_010158	T	6	6	35720	35725	0 %	100 %	0 %	0 %	162417867
75	NC_010158	A	6	6	36185	36190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010158	A	7	7	39976	39982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010158	T	7	7	40080	40086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010158	T	6	6	40815	40820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010158	T	6	6	42312	42317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010158	A	6	6	42417	42422	100 %	0 %	0 %	0 %	162417874
81	NC_010158	A	6	6	42465	42470	100 %	0 %	0 %	0 %	162417874
82	NC_010158	A	6	6	42737	42742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010158	T	6	6	42988	42993	0 %	100 %	0 %	0 %	162417907
84	NC_010158	T	6	6	43432	43437	0 %	100 %	0 %	0 %	162417907
85	NC_010158	T	6	6	43568	43573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010158	A	7	7	43585	43591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010158	C	7	7	43880	43886	0 %	0 %	0 %	100 %	162417841
88	NC_010158	T	6	6	45994	45999	0 %	100 %	0 %	0 %	162417900
89	NC_010158	T	6	6	46841	46846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010158	A	6	6	47464	47469	100 %	0 %	0 %	0 %	162417908
91	NC_010158	A	6	6	52313	52318	100 %	0 %	0 %	0 %	162417881
92	NC_010158	A	6	6	53701	53706	100 %	0 %	0 %	0 %	162417881
93	NC_010158	A	6	6	56149	56154	100 %	0 %	0 %	0 %	162417850
94	NC_010158	A	6	6	59007	59012	100 %	0 %	0 %	0 %	162417924
95	NC_010158	G	6	6	67371	67376	0 %	0 %	100 %	0 %	162417844
96	NC_010158	A	6	6	68136	68141	100 %	0 %	0 %	0 %	162417852
97	NC_010158	A	6	6	72771	72776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010158	G	6	6	72829	72834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010158	T	6	6	75833	75838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010158	G	6	6	77151	77156	0 %	0 %	100 %	0 %	162417822
101	NC_010158	T	6	6	77422	77427	0 %	100 %	0 %	0 %	162417822
102	NC_010158	T	6	6	80561	80566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010158	A	6	6	81049	81054	100 %	0 %	0 %	0 %	162417879
104	NC_010158	A	6	6	81693	81698	100 %	0 %	0 %	0 %	162417834
105	NC_010158	T	7	7	88141	88147	0 %	100 %	0 %	0 %	162417839
106	NC_010158	A	6	6	91160	91165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010158	A	8	8	92530	92537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010158	A	6	6	92680	92685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010158	A	6	6	93472	93477	100 %	0 %	0 %	0 %	162417845
110	NC_010158	A	7	7	93937	93943	100 %	0 %	0 %	0 %	162417845
111	NC_010158	T	6	6	94065	94070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010158	T	7	7	94141	94147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010158	A	7	7	94166	94172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010158	A	6	6	94242	94247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010158	A	6	6	94397	94402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010158	T	9	9	98242	98250	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
117	NC_010158	T	6	6	98300	98305	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
118	NC_010158	T	6	6	98401	98406	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
119	NC_010158	T	7	7	98599	98605	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
120	NC_010158	T	6	6	98901	98906	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
121	NC_010158	T	7	7	99063	99069	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
122	NC_010158	G	6	6	99255	99260	0 %	0 %	100 %	0 %	162417824
123	NC_010158	A	8	8	99955	99962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010158	A	6	6	100178	100183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010158	T	6	6	100199	100204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010158	A	6	6	100391	100396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010158	T	7	7	100413	100419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010158	T	6	6	102514	102519	0 %	100 %	0 %	0 %	162417930
129	NC_010158	T	6	6	102575	102580	0 %	100 %	0 %	0 %	162417930
130	NC_010158	T	8	8	103294	103301	0 %	100 %	0 %	0 %	162417921
131	NC_010158	T	6	6	103555	103560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010158	T	6	6	105829	105834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010158	A	6	6	108628	108633	100 %	0 %	0 %	0 %	162417875
134	NC_010158	A	6	6	109762	109767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010158	T	6	6	110996	111001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010158	A	6	6	112557	112562	100 %	0 %	0 %	0 %	162417859
137	NC_010158	A	7	7	112572	112578	100 %	0 %	0 %	0 %	162417859

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.