MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	162417828
2	NC_010158	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	162417939
3	NC_010158	T	7	7	2652	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	162417882
4	NC_010158	T	6	6	2705	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	162417882
5	NC_010158	A	7	7	2746	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	162417882
6	NC_010158	A	7	7	4413	4419	100 %	0 %	0 %	0 %	162417887
7	NC_010158	A	6	6	4550	4555	100 %	0 %	0 %	0 %	162417887
8	NC_010158	A	7	7	4699	4705	100 %	0 %	0 %	0 %	162417887
9	NC_010158	A	7	7	6093	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	162417857
10	NC_010158	A	7	7	6363	6369	100 %	0 %	0 %	0 %	162417857
11	NC_010158	T	7	7	9353	9359	0 %	100 %	0 %	0 %	162417840
12	NC_010158	A	6	6	9413	9418	100 %	0 %	0 %	0 %	162417840
13	NC_010158	A	6	6	9538	9543	100 %	0 %	0 %	0 %	162417840
14	NC_010158	A	6	6	10610	10615	100 %	0 %	0 %	0 %	162417912
15	NC_010158	C	6	6	11207	11212	0 %	0 %	0 %	100 %	162417858
16	NC_010158	T	7	7	12260	12266	0 %	100 %	0 %	0 %	162417923
17	NC_010158	T	6	6	12313	12318	0 %	100 %	0 %	0 %	162417923
18	NC_010158	A	7	7	12354	12360	100 %	0 %	0 %	0 %	162417923
19	NC_010158	A	7	7	14021	14027	100 %	0 %	0 %	0 %	162417849
20	NC_010158	A	6	6	14158	14163	100 %	0 %	0 %	0 %	162417849
21	NC_010158	A	7	7	14307	14313	100 %	0 %	0 %	0 %	162417849
22	NC_010158	A	7	7	15701	15707	100 %	0 %	0 %	0 %	162417846
23	NC_010158	A	7	7	15971	15977	100 %	0 %	0 %	0 %	162417846
24	NC_010158	T	7	7	18961	18967	0 %	100 %	0 %	0 %	162417829
25	NC_010158	A	6	6	19021	19026	100 %	0 %	0 %	0 %	162417829
26	NC_010158	A	6	6	19146	19151	100 %	0 %	0 %	0 %	162417829
27	NC_010158	A	6	6	20218	20223	100 %	0 %	0 %	0 %	162417833
28	NC_010158	C	6	6	20815	20820	0 %	0 %	0 %	100 %	162417864
29	NC_010158	T	7	7	27823	27829	0 %	100 %	0 %	0 %	162417866
30	NC_010158	T	6	6	34377	34382	0 %	100 %	0 %	0 %	162417826
31	NC_010158	T	6	6	35710	35715	0 %	100 %	0 %	0 %	162417913
32	NC_010158	T	6	6	35720	35725	0 %	100 %	0 %	0 %	162417867
33	NC_010158	A	6	6	42417	42422	100 %	0 %	0 %	0 %	162417874
34	NC_010158	A	6	6	42465	42470	100 %	0 %	0 %	0 %	162417874
35	NC_010158	T	6	6	42988	42993	0 %	100 %	0 %	0 %	162417907
36	NC_010158	T	6	6	43432	43437	0 %	100 %	0 %	0 %	162417907
37	NC_010158	C	7	7	43880	43886	0 %	0 %	0 %	100 %	162417841
38	NC_010158	T	6	6	45994	45999	0 %	100 %	0 %	0 %	162417900
39	NC_010158	A	6	6	47464	47469	100 %	0 %	0 %	0 %	162417908
40	NC_010158	A	6	6	52313	52318	100 %	0 %	0 %	0 %	162417881
41	NC_010158	A	6	6	53701	53706	100 %	0 %	0 %	0 %	162417881
42	NC_010158	A	6	6	56149	56154	100 %	0 %	0 %	0 %	162417850
43	NC_010158	A	6	6	59007	59012	100 %	0 %	0 %	0 %	162417924
44	NC_010158	G	6	6	67371	67376	0 %	0 %	100 %	0 %	162417844
45	NC_010158	A	6	6	68136	68141	100 %	0 %	0 %	0 %	162417852
46	NC_010158	G	6	6	77151	77156	0 %	0 %	100 %	0 %	162417822
47	NC_010158	T	6	6	77422	77427	0 %	100 %	0 %	0 %	162417822
48	NC_010158	A	6	6	81049	81054	100 %	0 %	0 %	0 %	162417879
49	NC_010158	A	6	6	81693	81698	100 %	0 %	0 %	0 %	162417834
50	NC_010158	T	7	7	88141	88147	0 %	100 %	0 %	0 %	162417839
51	NC_010158	A	6	6	93472	93477	100 %	0 %	0 %	0 %	162417845
52	NC_010158	A	7	7	93937	93943	100 %	0 %	0 %	0 %	162417845
53	NC_010158	T	9	9	98242	98250	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
54	NC_010158	T	6	6	98300	98305	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
55	NC_010158	T	6	6	98401	98406	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
56	NC_010158	T	7	7	98599	98605	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
57	NC_010158	T	6	6	98901	98906	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
58	NC_010158	T	7	7	99063	99069	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
59	NC_010158	G	6	6	99255	99260	0 %	0 %	100 %	0 %	162417824
60	NC_010158	T	6	6	102514	102519	0 %	100 %	0 %	0 %	162417930
61	NC_010158	T	6	6	102575	102580	0 %	100 %	0 %	0 %	162417930
62	NC_010158	T	8	8	103294	103301	0 %	100 %	0 %	0 %	162417921
63	NC_010158	A	6	6	108628	108633	100 %	0 %	0 %	0 %	162417875
64	NC_010158	A	6	6	112557	112562	100 %	0 %	0 %	0 %	162417859
65	NC_010158	A	7	7	112572	112578	100 %	0 %	0 %	0 %	162417859

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.