MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	ATCTAT	2	12	2192	2203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	162417807
2	NC_010157	GATGTC	2	12	5719	5730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162417767
3	NC_010157	TTTCCA	2	12	7739	7750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	162417783
4	NC_010157	TACATT	2	12	11427	11438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	162417763
5	NC_010157	ATTTTT	2	12	16098	16109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010157	TTAAAC	2	12	17867	17878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	162417812
7	NC_010157	TTATTT	2	12	20868	20879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010157	CAAGAT	2	12	22222	22233	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	162417764
9	NC_010157	AATTAC	2	12	25656	25667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010157	TGAGCG	2	12	27438	27449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	162417817
11	NC_010157	GAAGAT	2	12	27523	27534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	162417817
12	NC_010157	CAAGAA	2	12	27565	27576	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	162417817
13	NC_010157	TAGAAC	2	12	28687	28698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	162417754
14	NC_010157	TTGGTT	2	12	33641	33652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010157	TAACGT	2	12	35142	35153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	162417733
16	NC_010157	GTTACT	2	12	35435	35446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	162417759
17	NC_010157	TTATGT	2	12	35492	35503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	162417759
18	NC_010157	TTTTGC	2	12	40802	40813	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	162417757
19	NC_010157	GGTTAT	2	12	42895	42906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010157	AATTGA	2	12	43928	43939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010157	TGAATG	2	12	45757	45768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417751
22	NC_010157	AAGATT	2	12	48492	48503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	162417798
23	NC_010157	CCGGTT	2	12	53085	53096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417749
24	NC_010157	CCAATC	2	12	53109	53120	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162417749
25	NC_010157	TTTCCA	2	12	56625	56636	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	162417769
26	NC_010157	TGGAAA	2	12	57775	57786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	162417804
27	NC_010157	CAATTG	2	12	58854	58865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.