Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD
Total Repeats: 20
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_010157 | ATCTAT | 2 | 12 | 2192 | 2203 | 33.33 % | 50 % | 0 % | 16.67 % | 162417807 |
2 | NC_010157 | GATGTC | 2 | 12 | 5719 | 5730 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 162417767 |
3 | NC_010157 | TTTCCA | 2 | 12 | 7739 | 7750 | 16.67 % | 50 % | 0 % | 33.33 % | 162417783 |
4 | NC_010157 | TACATT | 2 | 12 | 11427 | 11438 | 33.33 % | 50 % | 0 % | 16.67 % | 162417763 |
5 | NC_010157 | TTAAAC | 2 | 12 | 17867 | 17878 | 50 % | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 162417812 |
6 | NC_010157 | CAAGAT | 2 | 12 | 22222 | 22233 | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 162417764 |
7 | NC_010157 | TGAGCG | 2 | 12 | 27438 | 27449 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 162417817 |
8 | NC_010157 | GAAGAT | 2 | 12 | 27523 | 27534 | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 0 % | 162417817 |
9 | NC_010157 | CAAGAA | 2 | 12 | 27565 | 27576 | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 16.67 % | 162417817 |
10 | NC_010157 | TAGAAC | 2 | 12 | 28687 | 28698 | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 162417754 |
11 | NC_010157 | TAACGT | 2 | 12 | 35142 | 35153 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 162417733 |
12 | NC_010157 | GTTACT | 2 | 12 | 35435 | 35446 | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 162417759 |
13 | NC_010157 | TTATGT | 2 | 12 | 35492 | 35503 | 16.67 % | 66.67 % | 16.67 % | 0 % | 162417759 |
14 | NC_010157 | TTTTGC | 2 | 12 | 40802 | 40813 | 0 % | 66.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 162417757 |
15 | NC_010157 | TGAATG | 2 | 12 | 45757 | 45768 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 162417751 |
16 | NC_010157 | AAGATT | 2 | 12 | 48492 | 48503 | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 0 % | 162417798 |
17 | NC_010157 | CCGGTT | 2 | 12 | 53085 | 53096 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 162417749 |
18 | NC_010157 | CCAATC | 2 | 12 | 53109 | 53120 | 33.33 % | 16.67 % | 0 % | 50 % | 162417749 |
19 | NC_010157 | TTTCCA | 2 | 12 | 56625 | 56636 | 16.67 % | 50 % | 0 % | 33.33 % | 162417769 |
20 | NC_010157 | TGGAAA | 2 | 12 | 57775 | 57786 | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 0 % | 162417804 |