MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	TTTTG	2	10	1257	1266	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010157	CAGCC	2	10	4309	4318	20 %	0 %	20 %	60 %	162417816
3	NC_010157	TTTGG	2	10	5785	5794	0 %	60 %	40 %	0 %	162417767
4	NC_010157	GGACC	2	10	6784	6793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010157	TGTAG	2	10	6827	6836	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010157	ATTAA	2	10	8019	8028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010157	AACAT	2	10	10141	10150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010157	GCTTG	2	10	11388	11397	0 %	40 %	40 %	20 %	162417763
9	NC_010157	TTTTA	2	10	16750	16759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010157	TAAAA	2	10	16889	16898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010157	GATGC	2	10	18588	18597	20 %	20 %	40 %	20 %	162417812
12	NC_010157	GCCGC	2	10	18831	18840	0 %	0 %	40 %	60 %	162417812
13	NC_010157	CCATC	2	10	22711	22720	20 %	20 %	0 %	60 %	162417764
14	NC_010157	GCATC	2	10	22984	22993	20 %	20 %	20 %	40 %	162417764
15	NC_010157	TTCAC	2	10	30564	30573	20 %	40 %	0 %	40 %	162417747
16	NC_010157	TTGTT	2	10	30873	30882	0 %	80 %	20 %	0 %	162417741
17	NC_010157	GCAGA	2	10	31773	31782	40 %	0 %	40 %	20 %	162417792
18	NC_010157	TAAAT	2	10	33086	33095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010157	TTTCT	2	10	33257	33266	0 %	80 %	0 %	20 %	162417775
20	NC_010157	CCAAG	2	10	34525	34534	40 %	0 %	20 %	40 %	162417806
21	NC_010157	TTTGG	2	10	35660	35669	0 %	60 %	40 %	0 %	162417759
22	NC_010157	CGTCT	2	10	35716	35725	0 %	40 %	20 %	40 %	162417759
23	NC_010157	CTGAA	2	10	36559	36568	40 %	20 %	20 %	20 %	162417759
24	NC_010157	GTACG	2	10	36877	36886	20 %	20 %	40 %	20 %	162417759
25	NC_010157	CATTC	2	10	37828	37837	20 %	40 %	0 %	40 %	162417809
26	NC_010157	AAAGT	2	10	38037	38046	60 %	20 %	20 %	0 %	162417809
27	NC_010157	ATTGC	2	10	39006	39015	20 %	40 %	20 %	20 %	162417808
28	NC_010157	GAATG	2	10	39247	39256	40 %	20 %	40 %	0 %	162417808
29	NC_010157	CTATA	2	10	46194	46203	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010157	TGGAT	2	10	50202	50211	20 %	40 %	40 %	0 %	162417777
31	NC_010157	GCCAT	2	10	50712	50721	20 %	20 %	20 %	40 %	162417777
32	NC_010157	TGGCT	2	10	50975	50984	0 %	40 %	40 %	20 %	162417777
33	NC_010157	CGGGG	2	10	53347	53356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010157	AAAAG	2	10	53590	53599	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010157	AGCGC	2	10	54391	54400	20 %	0 %	40 %	40 %	229270461
36	NC_010157	TCGCC	2	10	54899	54908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_010157	ATTAA	2	10	56905	56914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010157	AATCG	2	10	59688	59697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010157	CCTCA	2	10	59769	59778	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_010157	CTGTA	2	10	59965	59974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010157	GCTAA	2	10	63335	63344	40 %	20 %	20 %	20 %	162417814
42	NC_010157	ACCTT	2	10	67475	67484	20 %	40 %	0 %	40 %	162417736

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.