MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	CAGCC	2	10	4309	4318	20 %	0 %	20 %	60 %	162417816
2	NC_010157	TTTGG	2	10	5785	5794	0 %	60 %	40 %	0 %	162417767
3	NC_010157	GCTTG	2	10	11388	11397	0 %	40 %	40 %	20 %	162417763
4	NC_010157	GATGC	2	10	18588	18597	20 %	20 %	40 %	20 %	162417812
5	NC_010157	GCCGC	2	10	18831	18840	0 %	0 %	40 %	60 %	162417812
6	NC_010157	CCATC	2	10	22711	22720	20 %	20 %	0 %	60 %	162417764
7	NC_010157	GCATC	2	10	22984	22993	20 %	20 %	20 %	40 %	162417764
8	NC_010157	TTCAC	2	10	30564	30573	20 %	40 %	0 %	40 %	162417747
9	NC_010157	TTGTT	2	10	30873	30882	0 %	80 %	20 %	0 %	162417741
10	NC_010157	GCAGA	2	10	31773	31782	40 %	0 %	40 %	20 %	162417792
11	NC_010157	TTTCT	2	10	33257	33266	0 %	80 %	0 %	20 %	162417775
12	NC_010157	CCAAG	2	10	34525	34534	40 %	0 %	20 %	40 %	162417806
13	NC_010157	TTTGG	2	10	35660	35669	0 %	60 %	40 %	0 %	162417759
14	NC_010157	CGTCT	2	10	35716	35725	0 %	40 %	20 %	40 %	162417759
15	NC_010157	CTGAA	2	10	36559	36568	40 %	20 %	20 %	20 %	162417759
16	NC_010157	GTACG	2	10	36877	36886	20 %	20 %	40 %	20 %	162417759
17	NC_010157	CATTC	2	10	37828	37837	20 %	40 %	0 %	40 %	162417809
18	NC_010157	AAAGT	2	10	38037	38046	60 %	20 %	20 %	0 %	162417809
19	NC_010157	ATTGC	2	10	39006	39015	20 %	40 %	20 %	20 %	162417808
20	NC_010157	GAATG	2	10	39247	39256	40 %	20 %	40 %	0 %	162417808
21	NC_010157	TGGAT	2	10	50202	50211	20 %	40 %	40 %	0 %	162417777
22	NC_010157	GCCAT	2	10	50712	50721	20 %	20 %	20 %	40 %	162417777
23	NC_010157	TGGCT	2	10	50975	50984	0 %	40 %	40 %	20 %	162417777
24	NC_010157	AGCGC	2	10	54391	54400	20 %	0 %	40 %	40 %	229270461
25	NC_010157	GCTAA	2	10	63335	63344	40 %	20 %	20 %	20 %	162417814
26	NC_010157	ACCTT	2	10	67475	67484	20 %	40 %	0 %	40 %	162417736

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.