MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	AGCC	2	8	2756	2763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010157	TAAA	2	8	3912	3919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010157	CTTT	2	8	6328	6335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010157	TCAG	2	8	6440	6447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010157	CCCT	2	8	7132	7139	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_010157	GCCA	2	8	7469	7476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010157	CCGG	2	8	8145	8152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010157	TGTT	2	8	8213	8220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010157	CGAC	2	8	9043	9050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010157	ATAA	2	8	13002	13009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010157	TTAT	2	8	15316	15323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010157	ATAA	2	8	15371	15378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010157	CATT	2	8	16140	16147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010157	TTAA	2	8	16906	16913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010157	TGTT	2	8	32990	32997	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010157	GAAA	2	8	33035	33042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010157	AGGG	2	8	33218	33225	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010157	CGCA	2	8	33675	33682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010157	TTAT	2	8	34917	34924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010157	ATAA	2	8	42276	42283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010157	TGGA	2	8	44218	44225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010157	TACA	2	8	44263	44270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010157	GACG	2	8	44399	44406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010157	TTAT	2	8	44422	44429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010157	TTTA	2	8	44731	44738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010157	AATA	2	8	44747	44754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010157	TTAA	2	8	46178	46185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010157	CGGA	2	8	46657	46664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010157	GGGA	2	8	47286	47293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010157	CTTT	2	8	47615	47622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010157	CAGG	2	8	47758	47765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010157	AGAA	2	8	47800	47807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010157	CCCT	2	8	52282	52289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_010157	GGGC	2	8	53526	53533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010157	TTAT	3	12	53572	53583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010157	GCCA	2	8	54997	55004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010157	CACT	2	8	55033	55040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010157	CAGT	2	8	55483	55490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010157	ATCC	2	8	55710	55717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010157	TGAC	2	8	57335	57342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010157	TTAC	2	8	58490	58497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010157	CTTA	2	8	59050	59057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010157	CCTC	2	8	59911	59918	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_010157	CCTG	2	8	62785	62792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010157	ATAA	2	8	63979	63986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010157	ACAA	2	8	64445	64452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010157	GGGA	2	8	65662	65669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010157	CGCC	2	8	67895	67902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_010157	CTGG	2	8	68024	68031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010157	GTTC	2	8	68063	68070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.