MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	ACA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010157	TAA	2	6	754	759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010157	CAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010157	ATA	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010157	AAC	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010157	CAG	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010157	TAA	2	6	1354	1359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010157	TGC	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010157	CGC	2	6	2823	2828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010157	CAG	2	6	2844	2849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010157	CAC	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010157	TCA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010157	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010157	AAG	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010157	TCT	2	6	3874	3879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010157	TAT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010157	AAC	2	6	6146	6151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010157	CGC	2	6	6191	6196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010157	GAC	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010157	CTG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010157	TCG	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010157	CAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010157	CAC	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010157	TTA	2	6	6794	6799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010157	CCA	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010157	TGT	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010157	ATG	2	6	6970	6975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010157	AGC	2	6	6998	7003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010157	TCC	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010157	CAG	2	6	7153	7158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010157	CCA	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010157	CAC	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010157	CAG	2	6	7507	7512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010157	CTG	2	6	7523	7528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010157	GCT	2	6	7532	7537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010157	GGC	2	6	7635	7640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010157	CTT	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010157	GAA	2	6	8186	8191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010157	GCC	2	6	8273	8278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010157	GTG	2	6	8297	8302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010157	CAA	2	6	8379	8384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010157	GCC	2	6	8390	8395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010157	GCA	2	6	8471	8476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010157	TCT	2	6	8567	8572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010157	CAC	2	6	8767	8772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010157	ATC	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010157	TGA	2	6	8911	8916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010157	ATC	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010157	GTT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010157	GCG	2	6	9122	9127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010157	AGG	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010157	GAT	2	6	9239	9244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010157	TAC	2	6	9880	9885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010157	TAA	2	6	9916	9921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010157	TCC	2	6	10019	10024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010157	ATT	2	6	10033	10038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010157	ATT	2	6	10072	10077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010157	TAT	2	6	10105	10110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010157	TAA	2	6	10177	10182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010157	ACA	2	6	10224	10229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010157	AAT	2	6	10346	10351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010157	TTG	2	6	12114	12119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010157	AAG	2	6	12148	12153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010157	TGC	2	6	12168	12173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010157	AGC	2	6	12176	12181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010157	AAT	2	6	12199	12204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010157	CGA	2	6	12310	12315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010157	GTT	2	6	12415	12420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010157	ATT	2	6	12429	12434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010157	TAA	2	6	13034	13039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010157	TAA	2	6	13101	13106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010157	ACA	2	6	13276	13281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010157	ATG	2	6	13306	13311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010157	TGC	2	6	13344	13349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010157	AAT	2	6	13351	13356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010157	CAA	2	6	13748	13753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010157	AGA	2	6	15381	15386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010157	ATT	2	6	15579	15584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010157	CTT	2	6	15811	15816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010157	CTC	2	6	16006	16011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010157	TGA	2	6	16239	16244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010157	AAG	2	6	16245	16250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010157	TGC	2	6	16265	16270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010157	AGC	2	6	16273	16278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010157	AAT	2	6	16296	16301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010157	GTT	2	6	16512	16517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010157	ATT	2	6	16526	16531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010157	ATT	2	6	16565	16570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010157	CAA	2	6	16698	16703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010157	CTA	2	6	16731	16736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010157	TTA	2	6	16779	16784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010157	TAA	2	6	16794	16799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010157	TCA	2	6	16924	16929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010157	TCC	2	6	17861	17866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010157	CCT	2	6	20851	20856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010157	ACT	2	6	25630	25635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010157	TGC	2	6	25725	25730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010157	TTG	2	6	32703	32708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010157	CAA	2	6	32811	32816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010157	ATA	2	6	32960	32965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010157	GTG	2	6	33102	33107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010157	GTT	2	6	33133	33138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010157	AAT	2	6	33146	33151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010157	CAC	2	6	33158	33163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010157	ATC	2	6	33187	33192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010157	TCT	2	6	33199	33204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010157	TAT	2	6	33634	33639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010157	TAA	2	6	33683	33688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010157	CGC	2	6	34684	34689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010157	AAT	2	6	34698	34703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010157	TGT	2	6	34705	34710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010157	TAA	2	6	34712	34717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010157	TTA	2	6	34737	34742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010157	TAT	2	6	42132	42137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010157	AGT	2	6	42261	42266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010157	ATA	2	6	42674	42679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010157	AAT	2	6	42702	42707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010157	AAT	3	9	42780	42788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010157	CCT	2	6	42792	42797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010157	CTC	2	6	42840	42845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010157	TAA	2	6	42984	42989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010157	CGG	2	6	43033	43038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010157	ATT	2	6	43115	43120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010157	TGA	2	6	43520	43525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010157	TGC	2	6	43583	43588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010157	ATT	2	6	43589	43594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010157	GTT	2	6	43621	43626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010157	CTG	2	6	43833	43838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010157	ATT	2	6	43887	43892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010157	TGC	2	6	44042	44047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010157	AGA	2	6	44132	44137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010157	GAA	2	6	44157	44162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010157	GGT	2	6	44239	44244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010157	AGG	2	6	44254	44259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010157	CTT	2	6	44291	44296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010157	TAT	2	6	44501	44506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010157	TGT	2	6	44613	44618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010157	ATT	2	6	44636	44641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010157	CAG	2	6	44645	44650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010157	GTG	2	6	44709	44714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010157	TAT	2	6	46239	46244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010157	TAA	2	6	46247	46252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.