MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	GCT	2	6	183	188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417772
2	NC_010157	CGG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417772
3	NC_010157	GAC	2	6	280	285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417772
4	NC_010157	CGA	2	6	386	391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417772
5	NC_010157	GCC	2	6	617	622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417772
6	NC_010157	GCG	2	6	661	666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417772
7	NC_010157	GTG	3	9	794	802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417748
8	NC_010157	TGA	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417748
9	NC_010157	TTA	2	6	871	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417748
10	NC_010157	TCA	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417748
11	NC_010157	GTT	2	6	1130	1135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417748
12	NC_010157	AAT	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417748
13	NC_010157	ATC	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417742
14	NC_010157	AGC	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417742
15	NC_010157	ATC	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417742
16	NC_010157	GGT	2	6	1620	1625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417742
17	NC_010157	TGC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417742
18	NC_010157	GCA	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417742
19	NC_010157	TGC	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417742
20	NC_010157	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417742
21	NC_010157	TGG	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417742
22	NC_010157	GGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417742
23	NC_010157	TAC	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417807
24	NC_010157	GCA	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417807
25	NC_010157	TCA	2	6	2436	2441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417807
26	NC_010157	GCA	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417753
27	NC_010157	CAT	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417786
28	NC_010157	TGA	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417786
29	NC_010157	CCG	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417786
30	NC_010157	GTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417786
31	NC_010157	TTC	2	6	3997	4002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417816
32	NC_010157	TTC	2	6	4147	4152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417816
33	NC_010157	GTA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417816
34	NC_010157	ATT	2	6	4222	4227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417816
35	NC_010157	AAT	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417816
36	NC_010157	TCG	2	6	4440	4445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417816
37	NC_010157	TCA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417816
38	NC_010157	CTG	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417816
39	NC_010157	ACG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417816
40	NC_010157	TAA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417816
41	NC_010157	TGC	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417816
42	NC_010157	CCG	2	6	4824	4829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417816
43	NC_010157	CAT	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417816
44	NC_010157	TCA	2	6	4920	4925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417816
45	NC_010157	AGC	2	6	5007	5012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417767
46	NC_010157	AAC	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417767
47	NC_010157	CCG	2	6	5291	5296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417767
48	NC_010157	CAG	2	6	5318	5323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417767
49	NC_010157	CAT	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417767
50	NC_010157	AGC	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417767
51	NC_010157	TAA	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417767
52	NC_010157	AAG	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417767
53	NC_010157	AGC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417767
54	NC_010157	ATC	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417767
55	NC_010157	ATA	2	6	5574	5579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417767
56	NC_010157	CAA	2	6	5583	5588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417767
57	NC_010157	TCT	2	6	5593	5598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417767
58	NC_010157	CAC	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417767
59	NC_010157	AAC	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417767
60	NC_010157	CAG	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417767
61	NC_010157	AGC	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417767
62	NC_010157	CGC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417799
63	NC_010157	CAT	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417799
64	NC_010157	TCA	2	6	7706	7711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417783
65	NC_010157	CTT	3	9	7832	7840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417783
66	NC_010157	ATA	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417795
67	NC_010157	TCC	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417795
68	NC_010157	GAT	2	6	9391	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417795
69	NC_010157	ATA	2	6	9401	9406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417795
70	NC_010157	TCA	2	6	9425	9430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417795
71	NC_010157	TCA	2	6	9449	9454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417795
72	NC_010157	ATT	2	6	9577	9582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417795
73	NC_010157	ATA	2	6	9681	9686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417795
74	NC_010157	AGT	2	6	9768	9773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417795
75	NC_010157	TCT	2	6	9785	9790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417795
76	NC_010157	TAA	2	6	9867	9872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417795
77	NC_010157	ATT	2	6	10416	10421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417779
78	NC_010157	CCA	2	6	10533	10538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417779
79	NC_010157	GCA	2	6	10608	10613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417779
80	NC_010157	TTC	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417779
81	NC_010157	ATA	2	6	10757	10762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417779
82	NC_010157	ACG	2	6	11042	11047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417779
83	NC_010157	ATT	2	6	11068	11073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417779
84	NC_010157	GCG	2	6	11156	11161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417779
85	NC_010157	GTG	2	6	11178	11183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417779
86	NC_010157	TTC	2	6	11189	11194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417779
87	NC_010157	AGG	2	6	11334	11339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417779
88	NC_010157	ATC	2	6	11477	11482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417763
89	NC_010157	GTT	2	6	11496	11501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417763
90	NC_010157	CAA	2	6	11605	11610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417763
91	NC_010157	TGA	2	6	11664	11669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417763
92	NC_010157	ATT	2	6	11730	11735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417763
93	NC_010157	AAT	2	6	11798	11803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417737
94	NC_010157	AAG	2	6	11868	11873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417737
95	NC_010157	ATT	2	6	11879	11884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417737
96	NC_010157	AAT	2	6	11927	11932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417737
97	NC_010157	TAT	2	6	11933	11938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417737
98	NC_010157	TTA	2	6	11941	11946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417737
99	NC_010157	TAA	2	6	11995	12000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417737
100	NC_010157	CCA	2	6	12003	12008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417737
101	NC_010157	TCC	2	6	12026	12031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417737
102	NC_010157	ATT	2	6	12468	12473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417752
103	NC_010157	GCA	2	6	12475	12480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417752
104	NC_010157	CCG	2	6	12484	12489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417752
105	NC_010157	TTA	2	6	12508	12513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417752
106	NC_010157	TAT	3	9	12532	12540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417752
107	NC_010157	GAT	2	6	12642	12647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417752
108	NC_010157	GCT	2	6	12765	12770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417752
109	NC_010157	TCT	2	6	12850	12855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417752
110	NC_010157	AAT	2	6	13389	13394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417802
111	NC_010157	AAC	2	6	13403	13408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417802
112	NC_010157	GTC	2	6	13507	13512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417802
113	NC_010157	TAC	2	6	14100	14105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417819
114	NC_010157	CAT	2	6	14113	14118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417819
115	NC_010157	GAT	2	6	14287	14292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417819
116	NC_010157	TTA	3	9	14349	14357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417819
117	NC_010157	TTC	2	6	14369	14374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417819
118	NC_010157	ATA	2	6	14429	14434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417819
119	NC_010157	TGG	2	6	14441	14446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417819
120	NC_010157	AAG	2	6	14487	14492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417819
121	NC_010157	AAT	2	6	14527	14532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417819
122	NC_010157	AAG	2	6	14616	14621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417819
123	NC_010157	TTC	2	6	14645	14650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417819
124	NC_010157	ATT	2	6	14657	14662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417819
125	NC_010157	CAA	2	6	14668	14673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417819
126	NC_010157	AAT	2	6	14732	14737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417819
127	NC_010157	AAG	2	6	14742	14747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417819
128	NC_010157	ATT	2	6	14783	14788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417819
129	NC_010157	GGT	2	6	14814	14819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417819
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254	NC_010157	TGC	2	6	24149	24154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417811
255	NC_010157	TCA	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417811
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257	NC_010157	GCC	2	6	24287	24292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417811
258	NC_010157	TGT	2	6	24377	24382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417811
259	NC_010157	ATG	2	6	24479	24484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417811
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262	NC_010157	TAA	2	6	24851	24856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417778
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273	NC_010157	TCT	2	6	26072	26077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417750
274	NC_010157	CTG	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417750
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282	NC_010157	TCC	2	6	26677	26682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417750
283	NC_010157	CGA	2	6	26800	26805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417750
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377	NC_010157	CTT	2	6	34423	34428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417806
378	NC_010157	TTG	2	6	34445	34450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417806
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