MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	CG	3	6	424	429	0 %	0 %	50 %	50 %	162417772
2	NC_010157	TA	3	6	860	865	50 %	50 %	0 %	0 %	162417748
3	NC_010157	AT	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	162417748
4	NC_010157	AT	3	6	968	973	50 %	50 %	0 %	0 %	162417748
5	NC_010157	TA	3	6	2249	2254	50 %	50 %	0 %	0 %	162417807
6	NC_010157	TA	3	6	2256	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	162417807
7	NC_010157	AT	3	6	2612	2617	50 %	50 %	0 %	0 %	162417753
8	NC_010157	TC	3	6	4120	4125	0 %	50 %	0 %	50 %	162417816
9	NC_010157	GA	4	8	4347	4354	50 %	0 %	50 %	0 %	162417816
10	NC_010157	AG	3	6	9467	9472	50 %	0 %	50 %	0 %	162417795
11	NC_010157	GA	3	6	10681	10686	50 %	0 %	50 %	0 %	162417779
12	NC_010157	TC	3	6	11125	11130	0 %	50 %	0 %	50 %	162417779
13	NC_010157	TA	3	6	11830	11835	50 %	50 %	0 %	0 %	162417737
14	NC_010157	TA	4	8	12046	12053	50 %	50 %	0 %	0 %	162417737
15	NC_010157	AT	3	6	13235	13240	50 %	50 %	0 %	0 %	162417805
16	NC_010157	CT	3	6	14219	14224	0 %	50 %	0 %	50 %	162417819
17	NC_010157	CT	3	6	14922	14927	0 %	50 %	0 %	50 %	162417819
18	NC_010157	CT	3	6	17276	17281	0 %	50 %	0 %	50 %	162417734
19	NC_010157	CA	3	6	19371	19376	50 %	0 %	0 %	50 %	162417760
20	NC_010157	AG	3	6	19438	19443	50 %	0 %	50 %	0 %	162417760
21	NC_010157	CA	3	6	20742	20747	50 %	0 %	0 %	50 %	162417768
22	NC_010157	GA	3	6	21024	21029	50 %	0 %	50 %	0 %	162417803
23	NC_010157	AT	3	6	21625	21630	50 %	50 %	0 %	0 %	162417764
24	NC_010157	AT	3	6	21681	21686	50 %	50 %	0 %	0 %	162417764
25	NC_010157	GA	3	6	21961	21966	50 %	0 %	50 %	0 %	162417764
26	NC_010157	AT	3	6	22804	22809	50 %	50 %	0 %	0 %	162417764
27	NC_010157	CG	3	6	22907	22912	0 %	0 %	50 %	50 %	162417764
28	NC_010157	AG	3	6	22995	23000	50 %	0 %	50 %	0 %	162417764
29	NC_010157	GC	3	6	23683	23688	0 %	0 %	50 %	50 %	162417766
30	NC_010157	CT	3	6	26751	26756	0 %	50 %	0 %	50 %	162417750
31	NC_010157	AG	3	6	27980	27985	50 %	0 %	50 %	0 %	162417754
32	NC_010157	CG	3	6	28540	28545	0 %	0 %	50 %	50 %	162417754
33	NC_010157	GC	3	6	28625	28630	0 %	0 %	50 %	50 %	162417754
34	NC_010157	CA	3	6	29723	29728	50 %	0 %	0 %	50 %	162417770
35	NC_010157	CT	3	6	31234	31239	0 %	50 %	0 %	50 %	162417741
36	NC_010157	GC	3	6	31641	31646	0 %	0 %	50 %	50 %	162417792
37	NC_010157	AT	3	6	32219	32224	50 %	50 %	0 %	0 %	162417792
38	NC_010157	CA	3	6	33350	33355	50 %	0 %	0 %	50 %	162417775
39	NC_010157	CT	3	6	33502	33507	0 %	50 %	0 %	50 %	162417775
40	NC_010157	TA	3	6	33827	33832	50 %	50 %	0 %	0 %	162417806
41	NC_010157	TC	3	6	34212	34217	0 %	50 %	0 %	50 %	162417806
42	NC_010157	GT	3	6	37178	37183	0 %	50 %	50 %	0 %	162417759
43	NC_010157	CG	3	6	37442	37447	0 %	0 %	50 %	50 %	162417809
44	NC_010157	AG	3	6	38597	38602	50 %	0 %	50 %	0 %	162417784
45	NC_010157	AC	3	6	39969	39974	50 %	0 %	0 %	50 %	162417738
46	NC_010157	AG	3	6	41273	41278	50 %	0 %	50 %	0 %	162417771
47	NC_010157	TC	3	6	41500	41505	0 %	50 %	0 %	50 %	162417755
48	NC_010157	GC	3	6	41530	41535	0 %	0 %	50 %	50 %	162417755
49	NC_010157	CT	3	6	43432	43437	0 %	50 %	0 %	50 %	162417745
50	NC_010157	GC	4	8	45584	45591	0 %	0 %	50 %	50 %	162417751
51	NC_010157	GT	3	6	45662	45667	0 %	50 %	50 %	0 %	162417751
52	NC_010157	CT	3	6	46018	46023	0 %	50 %	0 %	50 %	162417751
53	NC_010157	CT	3	6	46109	46114	0 %	50 %	0 %	50 %	162417751
54	NC_010157	TC	4	8	48154	48161	0 %	50 %	0 %	50 %	162417798
55	NC_010157	AT	3	6	48599	48604	50 %	50 %	0 %	0 %	162417798
56	NC_010157	TC	3	6	49176	49181	0 %	50 %	0 %	50 %	162417777
57	NC_010157	GC	3	6	49617	49622	0 %	0 %	50 %	50 %	162417777
58	NC_010157	GT	3	6	49649	49654	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
59	NC_010157	GT	3	6	50635	50640	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
60	NC_010157	GT	3	6	51058	51063	0 %	50 %	50 %	0 %	162417777
61	NC_010157	AG	3	6	51133	51138	50 %	0 %	50 %	0 %	162417777
62	NC_010157	GC	3	6	51561	51566	0 %	0 %	50 %	50 %	162417782
63	NC_010157	CA	3	6	51668	51673	50 %	0 %	0 %	50 %	162417782
64	NC_010157	CA	3	6	51756	51761	50 %	0 %	0 %	50 %	162417782
65	NC_010157	GC	3	6	54089	54094	0 %	0 %	50 %	50 %	229270461
66	NC_010157	CG	3	6	54594	54599	0 %	0 %	50 %	50 %	229270461
67	NC_010157	TG	3	6	54738	54743	0 %	50 %	50 %	0 %	229270461
68	NC_010157	TC	3	6	55103	55108	0 %	50 %	0 %	50 %	162417820
69	NC_010157	AT	3	6	56205	56210	50 %	50 %	0 %	0 %	162417746
70	NC_010157	CA	3	6	56217	56222	50 %	0 %	0 %	50 %	162417746
71	NC_010157	GA	3	6	58002	58007	50 %	0 %	50 %	0 %	162417774
72	NC_010157	TG	3	6	60311	60316	0 %	50 %	50 %	0 %	162417818
73	NC_010157	TC	3	6	60789	60794	0 %	50 %	0 %	50 %	162417740
74	NC_010157	CG	3	6	62956	62961	0 %	0 %	50 %	50 %	162417814
75	NC_010157	GT	3	6	63198	63203	0 %	50 %	50 %	0 %	162417814
76	NC_010157	GA	3	6	63325	63330	50 %	0 %	50 %	0 %	162417814
77	NC_010157	TA	3	6	63729	63734	50 %	50 %	0 %	0 %	162417776
78	NC_010157	GA	3	6	65013	65018	50 %	0 %	50 %	0 %	162417780
79	NC_010157	GT	3	6	67673	67678	0 %	50 %	50 %	0 %	162417736

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.