MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	C	6	6	918	923	0 %	0 %	0 %	100 %	162417748
2	NC_010157	T	6	6	1295	1300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010157	T	6	6	2113	2118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010157	A	6	6	2486	2491	100 %	0 %	0 %	0 %	162417753
5	NC_010157	A	7	7	3133	3139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010157	T	6	6	3140	3145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010157	A	8	8	3174	3181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010157	A	7	7	3527	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	162417800
9	NC_010157	T	7	7	4092	4098	0 %	100 %	0 %	0 %	162417816
10	NC_010157	A	6	6	6133	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010157	A	6	6	6425	6430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010157	G	7	7	6920	6926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010157	G	6	6	8622	8627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010157	T	6	6	8657	8662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010157	T	7	7	8743	8749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010157	T	6	6	9257	9262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010157	T	7	7	9439	9445	0 %	100 %	0 %	0 %	162417795
18	NC_010157	T	6	6	9511	9516	0 %	100 %	0 %	0 %	162417795
19	NC_010157	A	6	6	10203	10208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010157	A	7	7	11114	11120	100 %	0 %	0 %	0 %	162417779
21	NC_010157	A	6	6	12121	12126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010157	A	6	6	12232	12237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010157	C	8	8	12435	12442	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_010157	A	6	6	12732	12737	100 %	0 %	0 %	0 %	162417752
25	NC_010157	A	7	7	12892	12898	100 %	0 %	0 %	0 %	162417796
26	NC_010157	A	6	6	12900	12905	100 %	0 %	0 %	0 %	162417796
27	NC_010157	A	6	6	12967	12972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010157	T	6	6	12975	12980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010157	G	7	7	13382	13388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010157	T	6	6	13586	13591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010157	A	6	6	13781	13786	100 %	0 %	0 %	0 %	162417735
32	NC_010157	A	6	6	14464	14469	100 %	0 %	0 %	0 %	162417819
33	NC_010157	T	6	6	14705	14710	0 %	100 %	0 %	0 %	162417819
34	NC_010157	A	6	6	15168	15173	100 %	0 %	0 %	0 %	162417819
35	NC_010157	A	6	6	15772	15777	100 %	0 %	0 %	0 %	162417785
36	NC_010157	A	6	6	16329	16334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010157	C	7	7	16532	16538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_010157	T	6	6	16587	16592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010157	T	7	7	17752	17758	0 %	100 %	0 %	0 %	162417734
40	NC_010157	G	6	6	18994	18999	0 %	0 %	100 %	0 %	162417812
41	NC_010157	T	6	6	19694	19699	0 %	100 %	0 %	0 %	162417744
42	NC_010157	T	7	7	19859	19865	0 %	100 %	0 %	0 %	162417744
43	NC_010157	T	7	7	20587	20593	0 %	100 %	0 %	0 %	162417768
44	NC_010157	T	6	6	21586	21591	0 %	100 %	0 %	0 %	162417764
45	NC_010157	G	8	8	23326	23333	0 %	0 %	100 %	0 %	162417764
46	NC_010157	G	6	6	24109	24114	0 %	0 %	100 %	0 %	162417797
47	NC_010157	A	7	7	24782	24788	100 %	0 %	0 %	0 %	162417778
48	NC_010157	T	6	6	25769	25774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010157	G	6	6	26174	26179	0 %	0 %	100 %	0 %	162417750
50	NC_010157	G	9	9	26339	26347	0 %	0 %	100 %	0 %	162417750
51	NC_010157	A	6	6	27318	27323	100 %	0 %	0 %	0 %	162417817
52	NC_010157	A	6	6	27780	27785	100 %	0 %	0 %	0 %	162417754
53	NC_010157	A	6	6	28232	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	162417754
54	NC_010157	C	7	7	30036	30042	0 %	0 %	0 %	100 %	162417761
55	NC_010157	T	7	7	30237	30243	0 %	100 %	0 %	0 %	162417761
56	NC_010157	T	7	7	31839	31845	0 %	100 %	0 %	0 %	162417792
57	NC_010157	A	7	7	31950	31956	100 %	0 %	0 %	0 %	162417792
58	NC_010157	T	7	7	32942	32948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010157	T	7	7	33026	33032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010157	C	7	7	33284	33290	0 %	0 %	0 %	100 %	162417775
61	NC_010157	T	6	6	33984	33989	0 %	100 %	0 %	0 %	162417806
62	NC_010157	T	6	6	33996	34001	0 %	100 %	0 %	0 %	162417806
63	NC_010157	T	8	8	34578	34585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010157	T	7	7	34851	34857	0 %	100 %	0 %	0 %	162417815
65	NC_010157	A	6	6	34983	34988	100 %	0 %	0 %	0 %	162417733
66	NC_010157	T	6	6	35408	35413	0 %	100 %	0 %	0 %	162417759
67	NC_010157	A	6	6	35917	35922	100 %	0 %	0 %	0 %	162417759
68	NC_010157	T	6	6	37468	37473	0 %	100 %	0 %	0 %	162417809
69	NC_010157	T	6	6	37615	37620	0 %	100 %	0 %	0 %	162417809
70	NC_010157	A	6	6	37739	37744	100 %	0 %	0 %	0 %	162417809
71	NC_010157	A	6	6	37986	37991	100 %	0 %	0 %	0 %	162417809
72	NC_010157	G	6	6	38252	38257	0 %	0 %	100 %	0 %	162417809
73	NC_010157	A	6	6	38548	38553	100 %	0 %	0 %	0 %	162417784
74	NC_010157	G	7	7	40110	40116	0 %	0 %	100 %	0 %	162417738
75	NC_010157	T	6	6	42205	42210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010157	A	7	7	42239	42245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010157	G	6	6	42382	42387	0 %	0 %	100 %	0 %	162417801
78	NC_010157	G	6	6	42999	43004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010157	C	6	6	43153	43158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_010157	A	7	7	43474	43480	100 %	0 %	0 %	0 %	162417745
81	NC_010157	A	6	6	44451	44456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010157	T	6	6	45141	45146	0 %	100 %	0 %	0 %	162417751
83	NC_010157	A	6	6	46209	46214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010157	T	6	6	46217	46222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010157	T	6	6	46308	46313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010157	T	6	6	46353	46358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010157	A	6	6	46359	46364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010157	T	6	6	47343	47348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010157	T	6	6	47605	47610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010157	T	8	8	47965	47972	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
91	NC_010157	T	6	6	48027	48032	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
92	NC_010157	T	7	7	48171	48177	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
93	NC_010157	T	6	6	48454	48459	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
94	NC_010157	T	6	6	49008	49013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96	NC_010157	C	8	8	49906	49913	0 %	0 %	0 %	100 %	162417777
97	NC_010157	A	7	7	51538	51544	100 %	0 %	0 %	0 %	162417782
98	NC_010157	T	6	6	52717	52722	0 %	100 %	0 %	0 %	162417794
99	NC_010157	T	7	7	53413	53419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010157	A	6	6	53671	53676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010157	T	7	7	54679	54685	0 %	100 %	0 %	0 %	229270461
102	NC_010157	T	6	6	55222	55227	0 %	100 %	0 %	0 %	162417820
103	NC_010157	C	6	6	55547	55552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_010157	A	6	6	58085	58090	100 %	0 %	0 %	0 %	162417774
105	NC_010157	T	6	6	58588	58593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010157	T	6	6	58648	58653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010157	T	8	8	59238	59245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010157	A	6	6	59617	59622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010157	A	8	8	59759	59766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010157	A	8	8	59835	59842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010157	T	7	7	59895	59901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010157	A	6	6	59923	59928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010157	A	7	7	59932	59938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010157	A	7	7	60053	60059	100 %	0 %	0 %	0 %	162417758
115	NC_010157	G	6	6	61116	61121	0 %	0 %	100 %	0 %	162417740
116	NC_010157	T	6	6	62179	62184	0 %	100 %	0 %	0 %	162417740
117	NC_010157	T	6	6	62885	62890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010157	A	7	7	63434	63440	100 %	0 %	0 %	0 %	162417814
119	NC_010157	T	6	6	64121	64126	0 %	100 %	0 %	0 %	162417781
120	NC_010157	A	6	6	64795	64800	100 %	0 %	0 %	0 %	162417790
121	NC_010157	T	7	7	66248	66254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010157	A	9	9	66433	66441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010157	T	6	6	66899	66904	0 %	100 %	0 %	0 %	162417788

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.