MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	C	6	6	918	923	0 %	0 %	0 %	100 %	162417748
2	NC_010157	A	6	6	2486	2491	100 %	0 %	0 %	0 %	162417753
3	NC_010157	A	7	7	3527	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	162417800
4	NC_010157	T	7	7	4092	4098	0 %	100 %	0 %	0 %	162417816
5	NC_010157	T	7	7	9439	9445	0 %	100 %	0 %	0 %	162417795
6	NC_010157	T	6	6	9511	9516	0 %	100 %	0 %	0 %	162417795
7	NC_010157	A	7	7	11114	11120	100 %	0 %	0 %	0 %	162417779
8	NC_010157	A	6	6	12732	12737	100 %	0 %	0 %	0 %	162417752
9	NC_010157	A	7	7	12892	12898	100 %	0 %	0 %	0 %	162417796
10	NC_010157	A	6	6	12900	12905	100 %	0 %	0 %	0 %	162417796
11	NC_010157	A	6	6	13781	13786	100 %	0 %	0 %	0 %	162417735
12	NC_010157	A	6	6	14464	14469	100 %	0 %	0 %	0 %	162417819
13	NC_010157	T	6	6	14705	14710	0 %	100 %	0 %	0 %	162417819
14	NC_010157	A	6	6	15168	15173	100 %	0 %	0 %	0 %	162417819
15	NC_010157	A	6	6	15772	15777	100 %	0 %	0 %	0 %	162417785
16	NC_010157	T	7	7	17752	17758	0 %	100 %	0 %	0 %	162417734
17	NC_010157	G	6	6	18994	18999	0 %	0 %	100 %	0 %	162417812
18	NC_010157	T	6	6	19694	19699	0 %	100 %	0 %	0 %	162417744
19	NC_010157	T	7	7	19859	19865	0 %	100 %	0 %	0 %	162417744
20	NC_010157	T	7	7	20587	20593	0 %	100 %	0 %	0 %	162417768
21	NC_010157	T	6	6	21586	21591	0 %	100 %	0 %	0 %	162417764
22	NC_010157	G	8	8	23326	23333	0 %	0 %	100 %	0 %	162417764
23	NC_010157	G	6	6	24109	24114	0 %	0 %	100 %	0 %	162417797
24	NC_010157	A	7	7	24782	24788	100 %	0 %	0 %	0 %	162417778
25	NC_010157	G	6	6	26174	26179	0 %	0 %	100 %	0 %	162417750
26	NC_010157	G	9	9	26339	26347	0 %	0 %	100 %	0 %	162417750
27	NC_010157	A	6	6	27318	27323	100 %	0 %	0 %	0 %	162417817
28	NC_010157	A	6	6	27780	27785	100 %	0 %	0 %	0 %	162417754
29	NC_010157	A	6	6	28232	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	162417754
30	NC_010157	C	7	7	30036	30042	0 %	0 %	0 %	100 %	162417761
31	NC_010157	T	7	7	30237	30243	0 %	100 %	0 %	0 %	162417761
32	NC_010157	T	7	7	31839	31845	0 %	100 %	0 %	0 %	162417792
33	NC_010157	A	7	7	31950	31956	100 %	0 %	0 %	0 %	162417792
34	NC_010157	C	7	7	33284	33290	0 %	0 %	0 %	100 %	162417775
35	NC_010157	T	6	6	33984	33989	0 %	100 %	0 %	0 %	162417806
36	NC_010157	T	6	6	33996	34001	0 %	100 %	0 %	0 %	162417806
37	NC_010157	T	7	7	34851	34857	0 %	100 %	0 %	0 %	162417815
38	NC_010157	A	6	6	34983	34988	100 %	0 %	0 %	0 %	162417733
39	NC_010157	T	6	6	35408	35413	0 %	100 %	0 %	0 %	162417759
40	NC_010157	A	6	6	35917	35922	100 %	0 %	0 %	0 %	162417759
41	NC_010157	T	6	6	37468	37473	0 %	100 %	0 %	0 %	162417809
42	NC_010157	T	6	6	37615	37620	0 %	100 %	0 %	0 %	162417809
43	NC_010157	A	6	6	37739	37744	100 %	0 %	0 %	0 %	162417809
44	NC_010157	A	6	6	37986	37991	100 %	0 %	0 %	0 %	162417809
45	NC_010157	G	6	6	38252	38257	0 %	0 %	100 %	0 %	162417809
46	NC_010157	A	6	6	38548	38553	100 %	0 %	0 %	0 %	162417784
47	NC_010157	G	7	7	40110	40116	0 %	0 %	100 %	0 %	162417738
48	NC_010157	G	6	6	42382	42387	0 %	0 %	100 %	0 %	162417801
49	NC_010157	A	7	7	43474	43480	100 %	0 %	0 %	0 %	162417745
50	NC_010157	T	6	6	45141	45146	0 %	100 %	0 %	0 %	162417751
51	NC_010157	T	8	8	47965	47972	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
52	NC_010157	T	6	6	48027	48032	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
53	NC_010157	T	7	7	48171	48177	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
54	NC_010157	T	6	6	48454	48459	0 %	100 %	0 %	0 %	162417798
55	NC_010157	C	6	6	49848	49853	0 %	0 %	0 %	100 %	162417777
56	NC_010157	C	8	8	49906	49913	0 %	0 %	0 %	100 %	162417777
57	NC_010157	A	7	7	51538	51544	100 %	0 %	0 %	0 %	162417782
58	NC_010157	T	6	6	52717	52722	0 %	100 %	0 %	0 %	162417794
59	NC_010157	T	7	7	54679	54685	0 %	100 %	0 %	0 %	229270461
60	NC_010157	T	6	6	55222	55227	0 %	100 %	0 %	0 %	162417820
61	NC_010157	A	6	6	58085	58090	100 %	0 %	0 %	0 %	162417774
62	NC_010157	A	7	7	60053	60059	100 %	0 %	0 %	0 %	162417758
63	NC_010157	G	6	6	61116	61121	0 %	0 %	100 %	0 %	162417740
64	NC_010157	T	6	6	62179	62184	0 %	100 %	0 %	0 %	162417740
65	NC_010157	A	7	7	63434	63440	100 %	0 %	0 %	0 %	162417814
66	NC_010157	T	6	6	64121	64126	0 %	100 %	0 %	0 %	162417781
67	NC_010157	A	6	6	64795	64800	100 %	0 %	0 %	0 %	162417790
68	NC_010157	T	6	6	66899	66904	0 %	100 %	0 %	0 %	162417788

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.