MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 chromosome

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010125	CTGGCG	2	12	5694	5705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010125	CGGCTG	2	12	8305	8316	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010125	CCGGCA	2	12	38061	38072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010125	TCTGGT	2	12	70518	70529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010125	GAAGGG	2	12	89943	89954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010125	TGCTTC	2	12	90810	90821	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010125	CGCTGG	2	12	108834	108845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010125	AAATCG	2	12	123253	123264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010125	GAAGCG	2	12	164059	164070	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010125	GCCCAT	2	12	164228	164239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010125	GGGGAA	2	12	169364	169375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010125	TCCGTT	2	12	186309	186320	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010125	GGAAGC	2	12	240987	240998	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010125	ACCAGA	2	12	315156	315167	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010125	ATGACA	2	12	315462	315473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010125	TCGTGA	2	12	394030	394041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010125	TGGCCC	2	12	413184	413195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010125	GTTGGC	2	12	429372	429383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010125	TATTCA	2	12	473461	473472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010125	GAAAAT	2	12	526811	526822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010125	GGCCGG	2	12	526897	526908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010125	GGCGGG	2	12	530699	530710	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010125	GGCCCG	2	12	556747	556758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010125	ACCGGC	2	12	589467	589478	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010125	ACCGCA	2	12	662417	662428	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010125	GCGGCC	2	12	737377	737388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010125	TCGAGG	2	12	738549	738560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010125	AGGACG	2	12	751611	751622	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010125	CGGGGG	2	12	751623	751634	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010125	GATCGC	2	12	821059	821070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010125	CGTGTC	2	12	858344	858355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010125	TCGCTG	2	12	886123	886134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010125	GCAGGG	2	12	953324	953335	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010125	CCTGAC	2	12	953577	953588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010125	GCCCGC	2	12	954244	954255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010125	TTCGGG	2	12	954501	954512	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010125	GAATCG	2	12	957354	957365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010125	TCTATT	2	12	977180	977191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010125	CGCCAT	2	12	1020989	1021000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010125	AGCGTC	2	12	1021886	1021897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010125	CCTGCT	2	12	1063893	1063904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010125	GCCAAA	2	12	1063969	1063980	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010125	GGCCTT	2	12	1081921	1081932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010125	GTTCGC	2	12	1086490	1086501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010125	GGAGAA	2	12	1087187	1087198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010125	CGGACG	2	12	1087283	1087294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010125	GGCCGA	2	12	1089335	1089346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010125	GCCGAG	2	12	1089546	1089557	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010125	GGTCGA	2	12	1110148	1110159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010125	CCACCC	2	12	1156963	1156974	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
51	NC_010125	CCGCCC	2	12	1198441	1198452	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_010125	CGCGTC	2	12	1213441	1213452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010125	AAGGAT	2	12	1217146	1217157	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010125	TTTTCC	2	12	1338207	1338218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010125	CGGGGC	2	12	1419499	1419510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010125	AATGAA	2	12	1491878	1491889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010125	CTTGTT	2	12	1492295	1492306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010125	GCGCCC	2	12	1507680	1507691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010125	CATGGA	2	12	1545236	1545247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010125	ACCAGA	2	12	1546505	1546516	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010125	GGTCAG	2	12	1641589	1641600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010125	ATGGCC	2	12	1689854	1689865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010125	CGCCGG	2	12	1696305	1696316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010125	TCCAGT	2	12	1701154	1701165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010125	CTGGCC	3	18	1728852	1728869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010125	TTCCTG	2	12	1751717	1751728	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010125	TTCCCT	2	12	1787502	1787513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010125	GGGACA	2	12	1878587	1878598	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010125	GGATCG	2	12	1932417	1932428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010125	CCGCTC	2	12	1942813	1942824	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010125	GCGACC	2	12	1962169	1962180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010125	CGATTG	2	12	1980840	1980851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010125	GGTCTC	2	12	2064732	2064743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010125	CGGGAC	2	12	2222202	2222213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010125	CCGGAA	2	12	2235690	2235701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010125	CCTGGC	2	12	2237408	2237419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010125	CAGCGC	2	12	2304229	2304240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010125	TTTGAA	2	12	2337193	2337204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010125	CATCCG	2	12	2360027	2360038	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010125	CCCTGC	2	12	2467663	2467674	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010125	AAAAAT	2	12	2493302	2493313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010125	TATTTT	2	12	2583728	2583739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010125	CCGGCC	2	12	2734788	2734799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010125	GACCAT	2	12	2745976	2745987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010125	GCAGCC	2	12	2775940	2775951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010125	GCGCCA	2	12	2857340	2857351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010125	ACCCAA	2	12	2875507	2875518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010125	GGCTCC	2	12	2958124	2958135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010125	CGGAGA	3	18	2991481	2991498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010125	CCATGG	2	12	3027710	3027721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010125	GCCGGA	2	12	3163676	3163687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010125	GGGCCC	2	12	3175059	3175070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010125	GCCGAA	2	12	3192725	3192736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010125	ACCAGA	2	12	3245993	3246004	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010125	CCTCGC	2	12	3259041	3259052	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010125	CCCGAA	2	12	3263327	3263338	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010125	GAAGAC	2	12	3299940	3299951	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010125	TGCCCC	2	12	3312517	3312528	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010125	GCCCCC	2	12	3314624	3314635	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_010125	AACGGA	2	12	3424454	3424465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010125	GGCGCA	2	12	3441762	3441773	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010125	CCCCTG	2	12	3453380	3453391	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_010125	CCTGCC	2	12	3526827	3526838	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010125	CGGCGA	2	12	3527319	3527330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010125	CGAAGG	2	12	3644552	3644563	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010125	GGCAGC	2	12	3671221	3671232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010125	CCGGAA	2	12	3689857	3689868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010125	GGGCGG	2	12	3703743	3703754	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010125	CCGCGT	2	12	3719071	3719082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010125	ATGGCG	2	12	3765649	3765660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010125	CTGGGC	2	12	3767290	3767301	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010125	GGCGCG	2	12	3768918	3768929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010125	TATTGA	2	12	3770625	3770636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010125	CAAAAA	2	12	3824632	3824643	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010125	GTCCCG	2	12	3824824	3824835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010125	CCGCTC	2	12	3825391	3825402	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010125	ACTGGA	2	12	3825431	3825442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010125	TCGCTC	2	12	3857829	3857840	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010125	CTGCCC	2	12	3917132	3917143	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.