MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 chromosome

Total Repeats: 4113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010125	GGGCG	2	10	5600	5609	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010125	CAGAG	2	10	8127	8136	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010125	CAGAG	2	10	10619	10628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010125	GCTTT	2	10	12174	12183	0 %	60 %	20 %	20 %	162145855
5	NC_010125	TGGCG	2	10	13385	13394	0 %	20 %	60 %	20 %	162145856
6	NC_010125	AGGCC	2	10	13790	13799	20 %	0 %	40 %	40 %	162145856
7	NC_010125	GCCGG	2	10	13933	13942	0 %	0 %	60 %	40 %	162145856
8	NC_010125	GCGAC	2	10	15035	15044	20 %	0 %	40 %	40 %	162145857
9	NC_010125	GATAC	2	10	15586	15595	40 %	20 %	20 %	20 %	162145858
10	NC_010125	TGGCG	2	10	15842	15851	0 %	20 %	60 %	20 %	162145858
11	NC_010125	CCGCT	2	10	18725	18734	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_010125	GCGCC	2	10	19120	19129	0 %	0 %	40 %	60 %	162145861
13	NC_010125	GGGGC	2	10	20677	20686	0 %	0 %	80 %	20 %	162145862
14	NC_010125	GCGTG	2	10	21097	21106	0 %	20 %	60 %	20 %	162145863
15	NC_010125	GTGGC	2	10	21107	21116	0 %	20 %	60 %	20 %	162145863
16	NC_010125	GCACG	2	10	22766	22775	20 %	0 %	40 %	40 %	162145864
17	NC_010125	TGCGG	2	10	23123	23132	0 %	20 %	60 %	20 %	162145864
18	NC_010125	CGGTG	2	10	23609	23618	0 %	20 %	60 %	20 %	162145864
19	NC_010125	GTGGG	2	10	27234	27243	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010125	GGTGT	2	10	27515	27524	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010125	CAACG	2	10	27768	27777	40 %	0 %	20 %	40 %	162145867
22	NC_010125	ACACC	2	10	28841	28850	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_010125	TATAA	2	10	29143	29152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010125	CCAGC	2	10	31605	31614	20 %	0 %	20 %	60 %	162145868
25	NC_010125	CACGT	2	10	32436	32445	20 %	20 %	20 %	40 %	162145869
26	NC_010125	GCCGG	2	10	32630	32639	0 %	0 %	60 %	40 %	162145870
27	NC_010125	CGGAC	2	10	33019	33028	20 %	0 %	40 %	40 %	162145870
28	NC_010125	CGGCG	2	10	33248	33257	0 %	0 %	60 %	40 %	162145871
29	NC_010125	CGTCC	2	10	33459	33468	0 %	20 %	20 %	60 %	162145871
30	NC_010125	CCGGG	2	10	34300	34309	0 %	0 %	60 %	40 %	162145872
31	NC_010125	CGCGG	2	10	34875	34884	0 %	0 %	60 %	40 %	162145873
32	NC_010125	TACCT	2	10	35463	35472	20 %	40 %	0 %	40 %	162145873
33	NC_010125	TTGCG	2	10	36625	36634	0 %	40 %	40 %	20 %	162145874
34	NC_010125	GGCCG	2	10	37591	37600	0 %	0 %	60 %	40 %	162145875
35	NC_010125	CGGGC	2	10	38264	38273	0 %	0 %	60 %	40 %	162145876
36	NC_010125	GCCCG	2	10	38299	38308	0 %	0 %	40 %	60 %	162145876
37	NC_010125	GGGGT	2	10	40630	40639	0 %	20 %	80 %	0 %	162145877
38	NC_010125	GCGGT	2	10	40710	40719	0 %	20 %	60 %	20 %	162145877
39	NC_010125	CGGGG	2	10	43990	43999	0 %	0 %	80 %	20 %	162145880
40	NC_010125	GGACA	2	10	44707	44716	40 %	0 %	40 %	20 %	162145880
41	NC_010125	GGCGC	2	10	45477	45486	0 %	0 %	60 %	40 %	162145882
42	NC_010125	CCAGC	2	10	45654	45663	20 %	0 %	20 %	60 %	162145882
43	NC_010125	GCGGG	2	10	47075	47084	0 %	0 %	80 %	20 %	162145882
44	NC_010125	GCGCG	2	10	47503	47512	0 %	0 %	60 %	40 %	162145883
45	NC_010125	GCGCG	2	10	47800	47809	0 %	0 %	60 %	40 %	162145883
46	NC_010125	GATAC	2	10	47927	47936	40 %	20 %	20 %	20 %	162145883
47	NC_010125	TTGCC	2	10	49569	49578	0 %	40 %	20 %	40 %	162145884
48	NC_010125	GCCGC	2	10	50236	50245	0 %	0 %	40 %	60 %	162145884
49	NC_010125	CGGCG	2	10	50953	50962	0 %	0 %	60 %	40 %	162145884
50	NC_010125	GCCGC	2	10	51641	51650	0 %	0 %	40 %	60 %	162145884
51	NC_010125	CGCGG	2	10	51889	51898	0 %	0 %	60 %	40 %	162145884
52	NC_010125	TCGCC	2	10	51996	52005	0 %	20 %	20 %	60 %	162145884
53	NC_010125	CGCGC	2	10	52660	52669	0 %	0 %	40 %	60 %	162145885
54	NC_010125	CCTGC	2	10	52912	52921	0 %	20 %	20 %	60 %	162145885
55	NC_010125	CCCGA	2	10	53965	53974	20 %	0 %	20 %	60 %	162145886
56	NC_010125	CCGGC	2	10	54285	54294	0 %	0 %	40 %	60 %	162145887
57	NC_010125	CAGCC	2	10	56944	56953	20 %	0 %	20 %	60 %	162145889
58	NC_010125	CCGGG	2	10	58061	58070	0 %	0 %	60 %	40 %	162145890
59	NC_010125	CGGCC	2	10	58309	58318	0 %	0 %	40 %	60 %	162145890
60	NC_010125	GCGCC	2	10	58513	58522	0 %	0 %	40 %	60 %	162145890
61	NC_010125	ACGGC	2	10	58530	58539	20 %	0 %	40 %	40 %	162145890
62	NC_010125	GGCGG	2	10	60725	60734	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010125	GGCGG	2	10	61313	61322	0 %	0 %	80 %	20 %	162145892
64	NC_010125	CCCGG	2	10	63829	63838	0 %	0 %	40 %	60 %	162145894
65	NC_010125	CAGAA	2	10	65083	65092	60 %	0 %	20 %	20 %	162145896
66	NC_010125	GATGC	2	10	67407	67416	20 %	20 %	40 %	20 %	162145899
67	NC_010125	CACCG	2	10	67633	67642	20 %	0 %	20 %	60 %	162145899
68	NC_010125	CGGGC	2	10	67830	67839	0 %	0 %	60 %	40 %	162145899
69	NC_010125	GCCGG	2	10	69244	69253	0 %	0 %	60 %	40 %	162145900
70	NC_010125	CCGCA	2	10	73088	73097	20 %	0 %	20 %	60 %	162145904
71	NC_010125	GCGAG	2	10	73117	73126	20 %	0 %	60 %	20 %	162145904
72	NC_010125	CTGGC	2	10	74112	74121	0 %	20 %	40 %	40 %	162145905
73	NC_010125	CGGGC	2	10	75350	75359	0 %	0 %	60 %	40 %	162145907
74	NC_010125	CAGGA	2	10	75681	75690	40 %	0 %	40 %	20 %	162145908
75	NC_010125	CCGCC	2	10	77163	77172	0 %	0 %	20 %	80 %	162145909
76	NC_010125	TTGGC	2	10	78794	78803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010125	GGCAC	2	10	79460	79469	20 %	0 %	40 %	40 %	162145912
78	NC_010125	GCCGG	2	10	80611	80620	0 %	0 %	60 %	40 %	162145913
79	NC_010125	GGGGC	2	10	80798	80807	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010125	TGGTT	2	10	80827	80836	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010125	AATAG	2	10	80896	80905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010125	TCGTG	2	10	82182	82191	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010125	GGTTG	2	10	83092	83101	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010125	CGCGG	2	10	83117	83126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010125	TGGAC	2	10	86220	86229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010125	ATCCC	2	10	86264	86273	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_010125	CCAGA	2	10	87361	87370	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010125	TATCG	2	10	88261	88270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010125	TGCGC	2	10	90224	90233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_010125	TCGTC	2	10	90982	90991	0 %	40 %	20 %	40 %	162145915
91	NC_010125	GTCAC	2	10	93895	93904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010125	GGTCT	2	10	94174	94183	0 %	40 %	40 %	20 %	162145917
93	NC_010125	CGGTC	2	10	94306	94315	0 %	20 %	40 %	40 %	162145917
94	NC_010125	GCCCG	2	10	94353	94362	0 %	0 %	40 %	60 %	162145917
95	NC_010125	GAGTT	2	10	96404	96413	20 %	40 %	40 %	0 %	162145919
96	NC_010125	CGTCA	2	10	97490	97499	20 %	20 %	20 %	40 %	162145920
97	NC_010125	GCGCC	2	10	98397	98406	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_010125	TTTCG	2	10	99937	99946	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010125	GTCCG	2	10	100721	100730	0 %	20 %	40 %	40 %	162145924
100	NC_010125	GCCGG	2	10	101542	101551	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010125	GCTGC	2	10	101644	101653	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010125	GCGCC	2	10	107403	107412	0 %	0 %	40 %	60 %	162145936
103	NC_010125	GGCCT	2	10	107827	107836	0 %	20 %	40 %	40 %	162145937
104	NC_010125	CTGAT	2	10	108951	108960	20 %	40 %	20 %	20 %	162145939
105	NC_010125	GACCG	2	10	108986	108995	20 %	0 %	40 %	40 %	162145939
106	NC_010125	CGCTC	2	10	109345	109354	0 %	20 %	20 %	60 %	162145939
107	NC_010125	GCCGA	2	10	109760	109769	20 %	0 %	40 %	40 %	162145939
108	NC_010125	CGCGC	2	10	109771	109780	0 %	0 %	40 %	60 %	162145939
109	NC_010125	TCGCT	2	10	109873	109882	0 %	40 %	20 %	40 %	162145939
110	NC_010125	GCGCG	2	10	111403	111412	0 %	0 %	60 %	40 %	162145940
111	NC_010125	GCGCC	2	10	112755	112764	0 %	0 %	40 %	60 %	162145940
112	NC_010125	CATGG	2	10	114085	114094	20 %	20 %	40 %	20 %	162145942
113	NC_010125	CCGGA	2	10	117724	117733	20 %	0 %	40 %	40 %	162145947
114	NC_010125	TCTGG	2	10	117866	117875	0 %	40 %	40 %	20 %	162145947
115	NC_010125	CGTCG	2	10	118341	118350	0 %	20 %	40 %	40 %	162145948
116	NC_010125	GCGCA	2	10	119049	119058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010125	CGATG	2	10	120377	120386	20 %	20 %	40 %	20 %	162145950
118	NC_010125	TATAA	2	10	122349	122358	60 %	40 %	0 %	0 %	162145953
119	NC_010125	CGTCG	2	10	124172	124181	0 %	20 %	40 %	40 %	162145954
120	NC_010125	TCCTC	2	10	125272	125281	0 %	40 %	0 %	60 %	162145954
121	NC_010125	TCCGC	2	10	129082	129091	0 %	20 %	20 %	60 %	162145956
122	NC_010125	CCGGA	2	10	131349	131358	20 %	0 %	40 %	40 %	162145957
123	NC_010125	GCGGG	2	10	131952	131961	0 %	0 %	80 %	20 %	162145958
124	NC_010125	TGGCC	2	10	132717	132726	0 %	20 %	40 %	40 %	162145958
125	NC_010125	AGCGC	2	10	133217	133226	20 %	0 %	40 %	40 %	162145958
126	NC_010125	GGAAA	2	10	133387	133396	60 %	0 %	40 %	0 %	162145959
127	NC_010125	ATGAG	2	10	136572	136581	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010125	CGACC	2	10	137319	137328	20 %	0 %	20 %	60 %	162145962
129	NC_010125	GCGCG	2	10	138800	138809	0 %	0 %	60 %	40 %	162145963
130	NC_010125	CTGAT	2	10	140662	140671	20 %	40 %	20 %	20 %	162145965
131	NC_010125	GCCGC	2	10	142210	142219	0 %	0 %	40 %	60 %	162145967
132	NC_010125	CAGCC	2	10	144498	144507	20 %	0 %	20 %	60 %	162145969
133	NC_010125	TCCGC	2	10	145503	145512	0 %	20 %	20 %	60 %	162145969
134	NC_010125	GCGCG	2	10	146439	146448	0 %	0 %	60 %	40 %	162145971
135	NC_010125	GCGGG	2	10	146704	146713	0 %	0 %	80 %	20 %	162145971
136	NC_010125	TGGTC	2	10	147351	147360	0 %	40 %	40 %	20 %	162145972
137	NC_010125	AGGAA	2	10	148618	148627	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010125	CCTGG	2	10	150362	150371	0 %	20 %	40 %	40 %	162145975
139	NC_010125	CGCGC	2	10	150683	150692	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_010125	GGGCG	2	10	152975	152984	0 %	0 %	80 %	20 %	162145976
141	NC_010125	CCGTG	2	10	157441	157450	0 %	20 %	40 %	40 %	162145980
142	NC_010125	CGTCG	2	10	157922	157931	0 %	20 %	40 %	40 %	162145981
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149	NC_010125	TTAGG	2	10	161615	161624	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_010125	CAACG	2	10	163622	163631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_010125	CATCG	2	10	196711	196720	20 %	20 %	20 %	40 %	162146015
200	NC_010125	TGCCG	2	10	196933	196942	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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215	NC_010125	TCCGT	2	10	211524	211533	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
216	NC_010125	CAGGC	2	10	212342	212351	20 %	0 %	40 %	40 %	162146029
217	NC_010125	CCGTG	2	10	213436	213445	0 %	20 %	40 %	40 %	162146030
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234	NC_010125	AGGCC	2	10	239137	239146	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
235	NC_010125	GACAG	2	10	241147	241156	40 %	0 %	40 %	20 %	162146057
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247	NC_010125	CGGGG	2	10	256171	256180	0 %	0 %	80 %	20 %	162146078
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265	NC_010125	CGCCC	2	10	274214	274223	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
266	NC_010125	CGCGG	2	10	275612	275621	0 %	0 %	60 %	40 %	162146095
267	NC_010125	GCCGG	2	10	276023	276032	0 %	0 %	60 %	40 %	162146096
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285	NC_010125	GGTCG	2	10	290627	290636	0 %	20 %	60 %	20 %	162146111
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391	NC_010125	CGCCC	2	10	387829	387838	0 %	0 %	20 %	80 %	162146205
392	NC_010125	TCAGG	2	10	388191	388200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
393	NC_010125	AAAAG	2	10	388262	388271	80 %	0 %	20 %	0 %	162146207
394	NC_010125	TGCGC	2	10	388870	388879	0 %	20 %	40 %	40 %	162146209
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396	NC_010125	AGGAC	2	10	390565	390574	40 %	0 %	40 %	20 %	162146212
397	NC_010125	CTTGT	2	10	390930	390939	0 %	60 %	20 %	20 %	162146212
398	NC_010125	TAACT	2	10	390984	390993	40 %	40 %	0 %	20 %	162146212
399	NC_010125	GATCC	2	10	392541	392550	20 %	20 %	20 %	40 %	162146213
400	NC_010125	CTGCG	2	10	392960	392969	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
401	NC_010125	CAGGG	2	10	393225	393234	20 %	0 %	60 %	20 %	162146214
402	NC_010125	CTGGC	2	10	393735	393744	0 %	20 %	40 %	40 %	162146214
403	NC_010125	CGGGG	2	10	393746	393755	0 %	0 %	80 %	20 %	162146214
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