MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5I

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010124	GCGG	2	8	1201	1208	0 %	0 %	75 %	25 %	161986675
2	NC_010124	CGTC	2	8	1226	1233	0 %	25 %	25 %	50 %	161986675
3	NC_010124	CGCA	2	8	1590	1597	25 %	0 %	25 %	50 %	161986675
4	NC_010124	CGCC	2	8	2088	2095	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_010124	TTCG	2	8	2119	2126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010124	GCCC	2	8	2223	2230	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_010124	AGAC	2	8	2413	2420	50 %	0 %	25 %	25 %	161986676
8	NC_010124	GCTG	2	8	2445	2452	0 %	25 %	50 %	25 %	161986676
9	NC_010124	CTGC	2	8	2686	2693	0 %	25 %	25 %	50 %	161986676
10	NC_010124	TTGA	2	8	3337	3344	25 %	50 %	25 %	0 %	161986677
11	NC_010124	TTCC	2	8	3467	3474	0 %	50 %	0 %	50 %	161986677
12	NC_010124	TTTG	2	8	5520	5527	0 %	75 %	25 %	0 %	161986680
13	NC_010124	CAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010124	ATCA	2	8	6249	6256	50 %	25 %	0 %	25 %	161986682
15	NC_010124	TGCT	2	8	6434	6441	0 %	50 %	25 %	25 %	161986682
16	NC_010124	CCAG	2	8	6839	6846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010124	CAAG	2	8	7016	7023	50 %	0 %	25 %	25 %	161986684
18	NC_010124	GAAG	2	8	7052	7059	50 %	0 %	50 %	0 %	161986684
19	NC_010124	GCCC	2	8	7104	7111	0 %	0 %	25 %	75 %	161986684
20	NC_010124	CTCA	2	8	7247	7254	25 %	25 %	0 %	50 %	161986684
21	NC_010124	GAAC	2	8	7347	7354	50 %	0 %	25 %	25 %	161986684
22	NC_010124	GTCG	2	8	7395	7402	0 %	25 %	50 %	25 %	161986684
23	NC_010124	CCGA	2	8	8204	8211	25 %	0 %	25 %	50 %	161986685
24	NC_010124	TTCG	2	8	8372	8379	0 %	50 %	25 %	25 %	161986685
25	NC_010124	ACCC	2	8	8556	8563	25 %	0 %	0 %	75 %	161986686
26	NC_010124	AAGC	2	8	9101	9108	50 %	0 %	25 %	25 %	161986686
27	NC_010124	GACA	2	8	9140	9147	50 %	0 %	25 %	25 %	161986686
28	NC_010124	CGTG	2	8	9199	9206	0 %	25 %	50 %	25 %	161986686
29	NC_010124	GCCT	2	8	9422	9429	0 %	25 %	25 %	50 %	161986687
30	NC_010124	GCGA	2	8	9448	9455	25 %	0 %	50 %	25 %	161986687
31	NC_010124	AGGA	2	8	9457	9464	50 %	0 %	50 %	0 %	161986687
32	NC_010124	GGGC	2	8	9664	9671	0 %	0 %	75 %	25 %	161986687
33	NC_010124	GCGG	2	8	9943	9950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010124	GCCT	2	8	10095	10102	0 %	25 %	25 %	50 %	161986688
35	NC_010124	CCCG	2	8	10193	10200	0 %	0 %	25 %	75 %	161986688
36	NC_010124	TCGA	2	8	10600	10607	25 %	25 %	25 %	25 %	161986688
37	NC_010124	ACCG	2	8	10692	10699	25 %	0 %	25 %	50 %	161986688
38	NC_010124	GCGG	2	8	11225	11232	0 %	0 %	75 %	25 %	161986689
39	NC_010124	CGTG	2	8	11233	11240	0 %	25 %	50 %	25 %	161986689
40	NC_010124	TCGG	2	8	11346	11353	0 %	25 %	50 %	25 %	161986689
41	NC_010124	TGGT	2	8	11752	11759	0 %	50 %	50 %	0 %	161986690
42	NC_010124	CCGT	2	8	12277	12284	0 %	25 %	25 %	50 %	161986690
43	NC_010124	CATC	2	8	13440	13447	25 %	25 %	0 %	50 %	161986691
44	NC_010124	GCGA	2	8	13668	13675	25 %	0 %	50 %	25 %	161986692
45	NC_010124	ATCC	2	8	13857	13864	25 %	25 %	0 %	50 %	161986692
46	NC_010124	TCAA	2	8	14289	14296	50 %	25 %	0 %	25 %	161986692
47	NC_010124	TGGT	2	8	15321	15328	0 %	50 %	50 %	0 %	161986694
48	NC_010124	GCCA	2	8	16213	16220	25 %	0 %	25 %	50 %	161986695
49	NC_010124	AACG	2	8	16850	16857	50 %	0 %	25 %	25 %	161986695
50	NC_010124	CCAT	2	8	17666	17673	25 %	25 %	0 %	50 %	161986695
51	NC_010124	AATC	2	8	17980	17987	50 %	25 %	0 %	25 %	161986695
52	NC_010124	TGTT	2	8	18171	18178	0 %	75 %	25 %	0 %	161986695
53	NC_010124	CAGG	2	8	18511	18518	25 %	0 %	50 %	25 %	161986696
54	NC_010124	ACTG	2	8	19697	19704	25 %	25 %	25 %	25 %	161986699
55	NC_010124	CGTT	2	8	20422	20429	0 %	50 %	25 %	25 %	161986700
56	NC_010124	GCAC	2	8	20933	20940	25 %	0 %	25 %	50 %	161986700
57	NC_010124	GGCG	2	8	20992	20999	0 %	0 %	75 %	25 %	161986700
58	NC_010124	CCGA	2	8	21033	21040	25 %	0 %	25 %	50 %	161986700
59	NC_010124	TTCG	2	8	21077	21084	0 %	50 %	25 %	25 %	161986700
60	NC_010124	CAAG	2	8	21178	21185	50 %	0 %	25 %	25 %	161986700
61	NC_010124	TCAA	2	8	21277	21284	50 %	25 %	0 %	25 %	161986701
62	NC_010124	ACGA	2	8	21936	21943	50 %	0 %	25 %	25 %	161986701
63	NC_010124	GCCA	2	8	22425	22432	25 %	0 %	25 %	50 %	161986702
64	NC_010124	CTGC	2	8	23388	23395	0 %	25 %	25 %	50 %	161986704
65	NC_010124	GGTG	2	8	23463	23470	0 %	25 %	75 %	0 %	161986704
66	NC_010124	TCTG	2	8	23777	23784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010124	GTCA	2	8	24076	24083	25 %	25 %	25 %	25 %	161986705
68	NC_010124	ACTG	2	8	24399	24406	25 %	25 %	25 %	25 %	161986705
69	NC_010124	CTTG	2	8	24524	24531	0 %	50 %	25 %	25 %	161986705
70	NC_010124	GATG	2	8	24885	24892	25 %	25 %	50 %	0 %	161986705
71	NC_010124	CTTG	2	8	25369	25376	0 %	50 %	25 %	25 %	161986706
72	NC_010124	GACG	2	8	26566	26573	25 %	0 %	50 %	25 %	161986706
73	NC_010124	GGTT	2	8	26840	26847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010124	CCTT	2	8	27284	27291	0 %	50 %	0 %	50 %	161986707
75	NC_010124	GCCA	2	8	27556	27563	25 %	0 %	25 %	50 %	161986708
76	NC_010124	GAAA	2	8	28317	28324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010124	AGAA	2	8	28875	28882	75 %	0 %	25 %	0 %	161986710
78	NC_010124	ATGA	2	8	29077	29084	50 %	25 %	25 %	0 %	161986710
79	NC_010124	TGAT	2	8	29706	29713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010124	CTCC	2	8	30471	30478	0 %	25 %	0 %	75 %	161986712
81	NC_010124	AACC	2	8	30909	30916	50 %	0 %	0 %	50 %	161986712
82	NC_010124	GCTC	2	8	31113	31120	0 %	25 %	25 %	50 %	161986712
83	NC_010124	AACG	2	8	31143	31150	50 %	0 %	25 %	25 %	161986712
84	NC_010124	CCTG	2	8	31242	31249	0 %	25 %	25 %	50 %	161986712
85	NC_010124	TGCT	2	8	31411	31418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010124	GCGA	2	8	31450	31457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010124	CTTT	2	8	31506	31513	0 %	75 %	0 %	25 %	161986713
88	NC_010124	TCAA	2	8	31537	31544	50 %	25 %	0 %	25 %	161986713
89	NC_010124	GCGT	2	8	31834	31841	0 %	25 %	50 %	25 %	161986713
90	NC_010124	TGGC	2	8	32373	32380	0 %	25 %	50 %	25 %	161986714
91	NC_010124	GCTC	2	8	32699	32706	0 %	25 %	25 %	50 %	161986715
92	NC_010124	GCCT	2	8	33097	33104	0 %	25 %	25 %	50 %	161986716
93	NC_010124	GAAA	2	8	33289	33296	75 %	0 %	25 %	0 %	161986716
94	NC_010124	GCTT	3	12	33421	33432	0 %	50 %	25 %	25 %	161986716
95	NC_010124	CCCG	2	8	34311	34318	0 %	0 %	25 %	75 %	161986718
96	NC_010124	CTTG	2	8	34717	34724	0 %	50 %	25 %	25 %	161986719
97	NC_010124	GCCA	2	8	34807	34814	25 %	0 %	25 %	50 %	161986719
98	NC_010124	TCCA	2	8	35202	35209	25 %	25 %	0 %	50 %	161986720
99	NC_010124	ATCA	2	8	35435	35442	50 %	25 %	0 %	25 %	161986720
100	NC_010124	CCTT	2	8	35597	35604	0 %	50 %	0 %	50 %	161986721
101	NC_010124	CCGC	2	8	35657	35664	0 %	0 %	25 %	75 %	161986721
102	NC_010124	CAGG	2	8	36095	36102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010124	AGCA	2	8	36236	36243	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010124	GCAC	2	8	36749	36756	25 %	0 %	25 %	50 %	161986723
105	NC_010124	GCCT	2	8	37130	37137	0 %	25 %	25 %	50 %	161986724
106	NC_010124	CGCC	2	8	37278	37285	0 %	0 %	25 %	75 %	161986724
107	NC_010124	AGTG	2	8	37851	37858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010124	CCCG	2	8	37956	37963	0 %	0 %	25 %	75 %	161986726
109	NC_010124	CCAG	2	8	38145	38152	25 %	0 %	25 %	50 %	161986726
110	NC_010124	GGCC	2	8	38465	38472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010124	TTCG	2	8	38620	38627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010124	CTGC	2	8	38707	38714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.