MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5I

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010124	CG	4	8	245	252	0 %	0 %	50 %	50 %	161986674
2	NC_010124	AG	3	6	368	373	50 %	0 %	50 %	0 %	161986674
3	NC_010124	CG	3	6	447	452	0 %	0 %	50 %	50 %	161986674
4	NC_010124	GC	4	8	968	975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010124	GA	4	8	1950	1957	50 %	0 %	50 %	0 %	161986675
6	NC_010124	AG	3	6	2570	2575	50 %	0 %	50 %	0 %	161986676
7	NC_010124	CA	3	6	2667	2672	50 %	0 %	0 %	50 %	161986676
8	NC_010124	AT	3	6	2723	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	161986676
9	NC_010124	CG	3	6	3517	3522	0 %	0 %	50 %	50 %	161986677
10	NC_010124	CA	3	6	4147	4152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010124	CA	3	6	4870	4875	50 %	0 %	0 %	50 %	161986678
12	NC_010124	GC	3	6	6639	6644	0 %	0 %	50 %	50 %	161986683
13	NC_010124	GC	3	6	6996	7001	0 %	0 %	50 %	50 %	161986684
14	NC_010124	GC	3	6	7331	7336	0 %	0 %	50 %	50 %	161986684
15	NC_010124	GC	4	8	8035	8042	0 %	0 %	50 %	50 %	161986685
16	NC_010124	GA	3	6	8985	8990	50 %	0 %	50 %	0 %	161986686
17	NC_010124	GA	3	6	10067	10072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010124	TC	3	6	10283	10288	0 %	50 %	0 %	50 %	161986688
19	NC_010124	GA	3	6	10318	10323	50 %	0 %	50 %	0 %	161986688
20	NC_010124	GC	3	6	10507	10512	0 %	0 %	50 %	50 %	161986688
21	NC_010124	GC	4	8	10678	10685	0 %	0 %	50 %	50 %	161986688
22	NC_010124	CG	4	8	10778	10785	0 %	0 %	50 %	50 %	161986688
23	NC_010124	GC	3	6	12118	12123	0 %	0 %	50 %	50 %	161986690
24	NC_010124	GT	3	6	13429	13434	0 %	50 %	50 %	0 %	161986691
25	NC_010124	AG	3	6	14977	14982	50 %	0 %	50 %	0 %	161986693
26	NC_010124	AG	3	6	15492	15497	50 %	0 %	50 %	0 %	161986694
27	NC_010124	GC	4	8	15761	15768	0 %	0 %	50 %	50 %	161986694
28	NC_010124	CG	3	6	15933	15938	0 %	0 %	50 %	50 %	161986695
29	NC_010124	CG	4	8	16185	16192	0 %	0 %	50 %	50 %	161986695
30	NC_010124	CG	3	6	16641	16646	0 %	0 %	50 %	50 %	161986695
31	NC_010124	GC	3	6	17188	17193	0 %	0 %	50 %	50 %	161986695
32	NC_010124	TC	3	6	17221	17226	0 %	50 %	0 %	50 %	161986695
33	NC_010124	TA	3	6	17500	17505	50 %	50 %	0 %	0 %	161986695
34	NC_010124	CG	3	6	17792	17797	0 %	0 %	50 %	50 %	161986695
35	NC_010124	CG	3	6	17928	17933	0 %	0 %	50 %	50 %	161986695
36	NC_010124	CT	3	6	19993	19998	0 %	50 %	0 %	50 %	161986699
37	NC_010124	AT	3	6	20374	20379	50 %	50 %	0 %	0 %	161986700
38	NC_010124	GC	3	6	20435	20440	0 %	0 %	50 %	50 %	161986700
39	NC_010124	TG	3	6	20483	20488	0 %	50 %	50 %	0 %	161986700
40	NC_010124	CG	3	6	20976	20981	0 %	0 %	50 %	50 %	161986700
41	NC_010124	CT	3	6	21726	21731	0 %	50 %	0 %	50 %	161986701
42	NC_010124	GC	3	6	21828	21833	0 %	0 %	50 %	50 %	161986701
43	NC_010124	AG	3	6	22073	22078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010124	GA	3	6	22102	22107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010124	AT	3	6	22317	22322	50 %	50 %	0 %	0 %	161986702
46	NC_010124	GC	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010124	AG	3	6	22593	22598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010124	TC	3	6	22658	22663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010124	GC	3	6	23350	23355	0 %	0 %	50 %	50 %	161986704
50	NC_010124	GA	3	6	23598	23603	50 %	0 %	50 %	0 %	161986704
51	NC_010124	GC	3	6	24236	24241	0 %	0 %	50 %	50 %	161986705
52	NC_010124	GC	3	6	25931	25936	0 %	0 %	50 %	50 %	161986706
53	NC_010124	AG	3	6	26751	26756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010124	TC	3	6	27181	27186	0 %	50 %	0 %	50 %	161986707
55	NC_010124	CG	3	6	27404	27409	0 %	0 %	50 %	50 %	161986707
56	NC_010124	CG	3	6	27607	27612	0 %	0 %	50 %	50 %	161986708
57	NC_010124	CG	3	6	27734	27739	0 %	0 %	50 %	50 %	161986708
58	NC_010124	CG	3	6	28499	28504	0 %	0 %	50 %	50 %	161986709
59	NC_010124	GA	3	6	28565	28570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010124	GC	3	6	29100	29105	0 %	0 %	50 %	50 %	161986710
61	NC_010124	CG	3	6	29449	29454	0 %	0 %	50 %	50 %	161986710
62	NC_010124	TC	3	6	30089	30094	0 %	50 %	0 %	50 %	161986712
63	NC_010124	GC	3	6	30123	30128	0 %	0 %	50 %	50 %	161986712
64	NC_010124	CT	3	6	30338	30343	0 %	50 %	0 %	50 %	161986712
65	NC_010124	AG	3	6	30454	30459	50 %	0 %	50 %	0 %	161986712
66	NC_010124	TC	3	6	30480	30485	0 %	50 %	0 %	50 %	161986712
67	NC_010124	AC	3	6	31794	31799	50 %	0 %	0 %	50 %	161986713
68	NC_010124	CA	3	6	32232	32237	50 %	0 %	0 %	50 %	161986714
69	NC_010124	TC	3	6	32569	32574	0 %	50 %	0 %	50 %	161986715
70	NC_010124	GC	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	161986715
71	NC_010124	AC	3	6	32969	32974	50 %	0 %	0 %	50 %	161986715
72	NC_010124	GC	3	6	33046	33051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010124	GC	3	6	33739	33744	0 %	0 %	50 %	50 %	161986717
74	NC_010124	CT	3	6	34164	34169	0 %	50 %	0 %	50 %	161986718
75	NC_010124	GC	3	6	34215	34220	0 %	0 %	50 %	50 %	161986718
76	NC_010124	CG	3	6	34584	34589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010124	CG	4	8	36067	36074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010124	GC	3	6	36705	36710	0 %	0 %	50 %	50 %	161986723
79	NC_010124	GC	3	6	37147	37152	0 %	0 %	50 %	50 %	161986724
80	NC_010124	GC	3	6	37429	37434	0 %	0 %	50 %	50 %	161986724
81	NC_010124	CG	3	6	37983	37988	0 %	0 %	50 %	50 %	161986726
82	NC_010124	GC	3	6	38680	38685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.