MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5II

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010123	CCGC	2	8	280	287	0 %	0 %	25 %	75 %	161986652
2	NC_010123	ACCG	2	8	485	492	25 %	0 %	25 %	50 %	161986652
3	NC_010123	GTGC	2	8	533	540	0 %	25 %	50 %	25 %	161986652
4	NC_010123	CCGA	2	8	611	618	25 %	0 %	25 %	50 %	161986652
5	NC_010123	CGCT	2	8	723	730	0 %	25 %	25 %	50 %	161986652
6	NC_010123	GATG	2	8	970	977	25 %	25 %	50 %	0 %	161986652
7	NC_010123	CGGG	2	8	1829	1836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010123	CTGA	2	8	1921	1928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010123	CGGC	2	8	1999	2006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010123	GCAT	2	8	2335	2342	25 %	25 %	25 %	25 %	161986653
11	NC_010123	GCTT	2	8	2955	2962	0 %	50 %	25 %	25 %	161986653
12	NC_010123	AGCC	2	8	3734	3741	25 %	0 %	25 %	50 %	161986654
13	NC_010123	GGCA	2	8	3776	3783	25 %	0 %	50 %	25 %	161986654
14	NC_010123	GCGG	2	8	3784	3791	0 %	0 %	75 %	25 %	161986654
15	NC_010123	CGCC	2	8	3997	4004	0 %	0 %	25 %	75 %	161986654
16	NC_010123	AGGT	2	8	4321	4328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010123	TGGT	2	8	4547	4554	0 %	50 %	50 %	0 %	161986655
18	NC_010123	CGAC	2	8	4614	4621	25 %	0 %	25 %	50 %	161986655
19	NC_010123	GGAT	2	8	5003	5010	25 %	25 %	50 %	0 %	161986655
20	NC_010123	GCGA	2	8	5900	5907	25 %	0 %	50 %	25 %	161986658
21	NC_010123	GGAT	2	8	6824	6831	25 %	25 %	50 %	0 %	161986660
22	NC_010123	ATCG	2	8	7535	7542	25 %	25 %	25 %	25 %	161986660
23	NC_010123	GGTG	2	8	8155	8162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010123	ATCC	2	8	8786	8793	25 %	25 %	0 %	50 %	161986662
25	NC_010123	CTCC	2	8	9477	9484	0 %	25 %	0 %	75 %	161986662
26	NC_010123	CTGT	2	8	9527	9534	0 %	50 %	25 %	25 %	161986662
27	NC_010123	CAGC	2	8	9611	9618	25 %	0 %	25 %	50 %	161986663
28	NC_010123	CCGA	2	8	9693	9700	25 %	0 %	25 %	50 %	161986663
29	NC_010123	CGCC	2	8	10299	10306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_010123	GAAC	2	8	10763	10770	50 %	0 %	25 %	25 %	161986665
31	NC_010123	GGTC	2	8	10890	10897	0 %	25 %	50 %	25 %	161986665
32	NC_010123	CCCG	2	8	11222	11229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_010123	GCGA	2	8	11647	11654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010123	GCCG	2	8	12107	12114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010123	CAGC	2	8	12554	12561	25 %	0 %	25 %	50 %	161986667
36	NC_010123	GGTG	2	8	13027	13034	0 %	25 %	75 %	0 %	161986668
37	NC_010123	CATC	2	8	13511	13518	25 %	25 %	0 %	50 %	161986669
38	NC_010123	TGGC	2	8	14398	14405	0 %	25 %	50 %	25 %	161986670
39	NC_010123	CCGG	2	8	16230	16237	0 %	0 %	50 %	50 %	161986672
40	NC_010123	ATGG	2	8	16240	16247	25 %	25 %	50 %	0 %	161986672
41	NC_010123	GCGG	2	8	16271	16278	0 %	0 %	75 %	25 %	161986672
42	NC_010123	CATA	2	8	16571	16578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010123	AACA	2	8	16601	16608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.