MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5II

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010123	GC	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
2	NC_010123	CG	3	6	1056	1061	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
3	NC_010123	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
4	NC_010123	GC	3	6	1536	1541	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
5	NC_010123	GC	3	6	1595	1600	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
6	NC_010123	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010123	GC	3	6	2358	2363	0 %	0 %	50 %	50 %	161986653
8	NC_010123	CG	3	6	2585	2590	0 %	0 %	50 %	50 %	161986653
9	NC_010123	GC	3	6	2829	2834	0 %	0 %	50 %	50 %	161986653
10	NC_010123	CA	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	161986653
11	NC_010123	GC	3	6	3512	3517	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
12	NC_010123	GT	3	6	3611	3616	0 %	50 %	50 %	0 %	161986654
13	NC_010123	GC	3	6	3742	3747	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
14	NC_010123	GC	3	6	3815	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
15	NC_010123	CG	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
16	NC_010123	GC	3	6	4075	4080	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
17	NC_010123	GA	3	6	4558	4563	50 %	0 %	50 %	0 %	161986655
18	NC_010123	GC	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	161986655
19	NC_010123	CG	3	6	4866	4871	0 %	0 %	50 %	50 %	161986655
20	NC_010123	GC	3	6	5127	5132	0 %	0 %	50 %	50 %	161986656
21	NC_010123	GC	3	6	5613	5618	0 %	0 %	50 %	50 %	161986657
22	NC_010123	CG	4	8	5667	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	161986657
23	NC_010123	CG	3	6	5841	5846	0 %	0 %	50 %	50 %	161986658
24	NC_010123	GC	3	6	5970	5975	0 %	0 %	50 %	50 %	161986658
25	NC_010123	GC	3	6	6087	6092	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
26	NC_010123	GC	3	6	6189	6194	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
27	NC_010123	GC	3	6	6243	6248	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
28	NC_010123	GT	3	6	6428	6433	0 %	50 %	50 %	0 %	161986659
29	NC_010123	CG	3	6	6434	6439	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
30	NC_010123	CG	3	6	7206	7211	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
31	NC_010123	CG	3	6	7338	7343	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
32	NC_010123	CG	3	6	7375	7380	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
33	NC_010123	GC	3	6	7661	7666	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
34	NC_010123	CG	3	6	7739	7744	0 %	0 %	50 %	50 %	161986661
35	NC_010123	AG	3	6	8339	8344	50 %	0 %	50 %	0 %	161986662
36	NC_010123	TC	3	6	8756	8761	0 %	50 %	0 %	50 %	161986662
37	NC_010123	AG	3	6	9139	9144	50 %	0 %	50 %	0 %	161986662
38	NC_010123	CG	3	6	9166	9171	0 %	0 %	50 %	50 %	161986662
39	NC_010123	GC	3	6	9908	9913	0 %	0 %	50 %	50 %	161986663
40	NC_010123	GC	3	6	10192	10197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010123	GC	3	6	10199	10204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010123	GA	3	6	11376	11381	50 %	0 %	50 %	0 %	161986666
43	NC_010123	GC	3	6	12157	12162	0 %	0 %	50 %	50 %	161986667
44	NC_010123	CG	3	6	12749	12754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010123	GC	3	6	13071	13076	0 %	0 %	50 %	50 %	161986668
46	NC_010123	CG	4	8	13081	13088	0 %	0 %	50 %	50 %	161986668
47	NC_010123	GC	3	6	13335	13340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010123	GC	3	6	13480	13485	0 %	0 %	50 %	50 %	161986669
49	NC_010123	CT	3	6	13575	13580	0 %	50 %	0 %	50 %	161986669
50	NC_010123	GA	3	6	13730	13735	50 %	0 %	50 %	0 %	161986669
51	NC_010123	AG	3	6	14184	14189	50 %	0 %	50 %	0 %	161986670
52	NC_010123	CT	3	6	14224	14229	0 %	50 %	0 %	50 %	161986670
53	NC_010123	CG	4	8	14230	14237	0 %	0 %	50 %	50 %	161986670
54	NC_010123	TC	3	6	14346	14351	0 %	50 %	0 %	50 %	161986670
55	NC_010123	CG	3	6	14500	14505	0 %	0 %	50 %	50 %	161986670
56	NC_010123	AG	3	6	15689	15694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.