MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010120	GGCTTG	2	12	27351	27362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010120	CGCAGG	2	12	44197	44208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010120	ACAAAG	2	12	58492	58503	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010120	CAGGAG	2	12	83292	83303	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010120	CGCGGT	2	12	100139	100150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010120	TTATTT	2	12	149844	149855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010120	ACAAAG	2	12	184578	184589	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010120	TGCGCC	2	12	211158	211169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010120	TTTTGT	2	12	212468	212479	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010120	CGGAAG	2	12	231118	231129	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010120	TTCAGT	2	12	239890	239901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010120	CAAAAA	2	12	304659	304670	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010120	GCAGGG	2	12	306043	306054	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010120	GGGGCG	2	12	314149	314160	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010120	ATTTAA	2	12	322970	322981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010120	TTTGAT	2	12	328393	328404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010120	CAACCC	2	12	371707	371718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010120	TTTTGT	2	12	382838	382849	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010120	GTATTC	2	12	417537	417548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010120	ACCGAA	2	12	426177	426188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010120	ACCGAA	2	12	426377	426388	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010120	ACCGAA	2	12	426577	426588	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010120	ACCGAA	2	12	429341	429352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010120	AACCGG	2	12	429410	429421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010120	GCTGCC	2	12	451420	451431	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010120	TTAAAT	2	12	457905	457916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010120	GAATTT	2	12	461122	461133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010120	TAAAGA	2	12	462434	462445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010120	ATTTAA	2	12	462830	462841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010120	AGGCGT	2	12	466494	466505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010120	CAAAAT	2	12	469146	469157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010120	TTAAAT	2	12	507281	507292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010120	GCAGGA	2	12	516751	516762	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010120	CTTGGG	2	12	521372	521383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010120	AATTTA	2	12	523976	523987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010120	ATGCCG	2	12	530827	530838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010120	CGAAAA	2	12	538804	538815	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010120	GCGCAG	2	12	545708	545719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010120	AAATCC	2	12	549686	549697	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010120	TCGGTT	2	12	550075	550086	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010120	TCGGTT	2	12	550428	550439	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010120	AAAAAC	2	12	550693	550704	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010120	TTCAAA	2	12	557415	557426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010120	ATCCGC	2	12	567141	567152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010120	TTAAAT	2	12	579086	579097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010120	CGGACA	2	12	587431	587442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010120	TTATGT	2	12	619700	619711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010120	TTCGGT	2	12	655221	655232	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010120	TTTTTG	2	12	672664	672675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010120	ATTTAA	2	12	673938	673949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010120	CCTTAA	2	12	679391	679402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010120	ATTTAA	2	12	679716	679727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010120	TTAAAT	2	12	696135	696146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010120	CGCCTG	2	12	715818	715829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010120	AAAATA	2	12	719350	719361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010120	TTCGGA	2	12	729414	729425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010120	TTTCTG	2	12	730356	730367	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010120	ATTTAA	2	12	733545	733556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010120	TTGGCA	2	12	750751	750762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010120	CGATTT	2	12	797503	797514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010120	GTCAAA	2	12	797769	797780	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010120	TTAAAT	2	12	801531	801542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010120	ACGGAT	2	12	816124	816135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010120	AAGGAT	2	12	834340	834351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010120	AAGGAA	2	12	846882	846893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010120	TTAAAT	2	12	847015	847026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010120	ATTTAT	2	12	847782	847793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010120	TTCAAT	2	12	847794	847805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010120	TAATCA	2	12	863063	863074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010120	TTTAAA	2	12	865596	865607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010120	ATTTAA	2	12	865674	865685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010120	GGCTGC	2	12	871160	871171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010120	CGAAAT	2	12	875762	875773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010120	ATTTAA	2	12	902294	902305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010120	CGGATG	2	12	912352	912363	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010120	TCTTTG	2	12	914235	914246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010120	ATTTTT	2	12	921672	921683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010120	TTAAAT	2	12	927191	927202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010120	CGTTTG	2	12	927346	927357	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010120	TTGTTT	2	12	942135	942146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010120	ATTTAA	2	12	943408	943419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010120	TTAAAT	2	12	951011	951022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010120	TTCGGC	2	12	959505	959516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010120	AATTTG	2	12	981458	981469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010120	ATTTAA	2	12	991182	991193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010120	GGAAAA	2	12	991222	991233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010120	TCAAAA	2	12	999638	999649	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010120	CCTCTG	2	12	1013972	1013983	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010120	GGAATC	2	12	1041825	1041836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010120	GCGGAT	2	12	1058122	1058133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010120	GTTTTG	2	12	1081036	1081047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010120	GAACAA	2	12	1081606	1081617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010120	GTTATT	2	12	1082376	1082387	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010120	GAAACC	2	12	1090019	1090030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010120	TGCCGA	2	12	1146723	1146734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010120	GCTGTG	2	12	1170697	1170708	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010120	TTTCAG	2	12	1197632	1197643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010120	AAACAC	2	12	1214148	1214159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010120	ATTTAA	2	12	1269793	1269804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010120	CAAAAA	2	12	1285215	1285226	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010120	TGCCTT	2	12	1298340	1298351	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010120	TAAATA	2	12	1314725	1314736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010120	ATTTTT	2	12	1331616	1331627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010120	ATTTAA	2	12	1331664	1331675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010120	CACCAT	2	12	1340525	1340536	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010120	GCCATA	2	12	1341656	1341667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010120	ACAGGC	2	12	1395170	1395181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010120	ATTTAA	2	12	1395522	1395533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010120	GGCTGC	2	12	1398215	1398226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010120	ATAAGG	2	12	1417942	1417953	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010120	CCGGAA	2	12	1438493	1438504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010120	ATGCCG	2	12	1440525	1440536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010120	ATCGGA	2	12	1440546	1440557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010120	TTCGGT	2	12	1530293	1530304	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010120	CTCCAA	2	12	1530464	1530475	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010120	GATTCA	2	12	1535024	1535035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010120	TTTAAA	2	12	1540621	1540632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010120	ACCGAA	2	12	1540732	1540743	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010120	ACCGAA	2	12	1541047	1541058	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010120	ATTTAA	2	12	1543129	1543140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010120	CGCCTG	2	12	1580423	1580434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010120	AATCCA	2	12	1582317	1582328	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010120	GCCTTC	2	12	1590497	1590508	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010120	CTTTGT	2	12	1594156	1594167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010120	GCCGCT	2	12	1608513	1608524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010120	CATTTC	2	12	1629301	1629312	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010120	CGTACC	2	12	1649322	1649333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010120	GAAGCC	2	12	1688185	1688196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010120	ATTTTT	2	12	1691325	1691336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010120	ATTTAA	2	12	1731626	1731637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010120	CGGAAA	2	12	1735721	1735732	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010120	TTCGGT	2	12	1737278	1737289	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010120	AGCCCG	2	12	1754095	1754106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010120	GCGTTT	2	12	1768647	1768658	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_010120	CTGCTC	2	12	1770048	1770059	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010120	TATCAA	2	12	1794160	1794171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_010120	CTGAAT	4	24	1811286	1811309	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_010120	CCGAAT	2	12	1811310	1811321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010120	ATTTAA	2	12	1861600	1861611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010120	ATAAAA	2	12	1865955	1865966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010120	AACCGA	2	12	1878658	1878669	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010120	AACCGA	2	12	1878928	1878939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010120	AAAGAA	2	12	1882508	1882519	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010120	GCCTTC	2	12	1885270	1885281	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010120	CTTTGT	2	12	1888929	1888940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_010120	ATTTAA	2	12	1918516	1918527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010120	TTTTCT	2	12	1949303	1949314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_010120	AAGGGA	2	12	1966959	1966970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010120	TATTTT	2	12	2012442	2012453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010120	CTTTTC	2	12	2069761	2069772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010120	GCATAA	2	12	2087618	2087629	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_010120	GCGGCC	2	12	2092487	2092498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010120	AAAAAT	2	12	2099719	2099730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010120	TATTTT	2	12	2114042	2114053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010120	CATCAA	2	12	2148181	2148192	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.