MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 1193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010120	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	161869021
2	NC_010120	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	161869021
3	NC_010120	CCAGC	2	10	4695	4704	20 %	0 %	20 %	60 %	161869025
4	NC_010120	AAGGC	2	10	6004	6013	40 %	0 %	40 %	20 %	161869027
5	NC_010120	GAATG	2	10	6114	6123	40 %	20 %	40 %	0 %	161869027
6	NC_010120	GCTTT	2	10	6365	6374	0 %	60 %	20 %	20 %	161869028
7	NC_010120	GGTGC	2	10	8286	8295	0 %	20 %	60 %	20 %	161869029
8	NC_010120	TACCG	2	10	9564	9573	20 %	20 %	20 %	40 %	161869030
9	NC_010120	TCAAT	2	10	10477	10486	40 %	40 %	0 %	20 %	161869031
10	NC_010120	CCCGT	2	10	11511	11520	0 %	20 %	20 %	60 %	161869032
11	NC_010120	TCCCG	2	10	12660	12669	0 %	20 %	20 %	60 %	161869033
12	NC_010120	TGTCG	2	10	14116	14125	0 %	40 %	40 %	20 %	161869034
13	NC_010120	AGGGC	2	10	25243	25252	20 %	0 %	60 %	20 %	161869048
14	NC_010120	GGCGC	2	10	25523	25532	0 %	0 %	60 %	40 %	161869049
15	NC_010120	AAACC	2	10	25946	25955	60 %	0 %	0 %	40 %	161869049
16	NC_010120	CAAAC	2	10	27912	27921	60 %	0 %	0 %	40 %	161869050
17	NC_010120	TCCGC	2	10	29246	29255	0 %	20 %	20 %	60 %	161869051
18	NC_010120	CATTC	2	10	33834	33843	20 %	40 %	0 %	40 %	161869055
19	NC_010120	AGGTG	2	10	34282	34291	20 %	20 %	60 %	0 %	161869056
20	NC_010120	GTCGG	2	10	34971	34980	0 %	20 %	60 %	20 %	161869056
21	NC_010120	GGGCT	2	10	36946	36955	0 %	20 %	60 %	20 %	161869059
22	NC_010120	GGCGG	2	10	40444	40453	0 %	0 %	80 %	20 %	161869062
23	NC_010120	GCGGT	2	10	40919	40928	0 %	20 %	60 %	20 %	161869063
24	NC_010120	GCGCG	2	10	41316	41325	0 %	0 %	60 %	40 %	161869063
25	NC_010120	ACGGC	2	10	41861	41870	20 %	0 %	40 %	40 %	161869063
26	NC_010120	CGGCG	2	10	44411	44420	0 %	0 %	60 %	40 %	161869066
27	NC_010120	TTTGA	2	10	46395	46404	20 %	60 %	20 %	0 %	161869066
28	NC_010120	GGGCA	2	10	46617	46626	20 %	0 %	60 %	20 %	161869066
29	NC_010120	GAAAA	2	10	47058	47067	80 %	0 %	20 %	0 %	161869066
30	NC_010120	GTTGG	2	10	49629	49638	0 %	40 %	60 %	0 %	161869067
31	NC_010120	AAACC	2	10	51851	51860	60 %	0 %	0 %	40 %	161869068
32	NC_010120	GTGCG	2	10	54202	54211	0 %	20 %	60 %	20 %	161869070
33	NC_010120	TGCCG	2	10	64627	64636	0 %	20 %	40 %	40 %	161869079
34	NC_010120	TGGCT	2	10	64956	64965	0 %	40 %	40 %	20 %	161869079
35	NC_010120	TGCCC	2	10	65563	65572	0 %	20 %	20 %	60 %	161869079
36	NC_010120	TCTTT	2	10	67456	67465	0 %	80 %	0 %	20 %	161869081
37	NC_010120	TCGGC	2	10	69439	69448	0 %	20 %	40 %	40 %	161869083
38	NC_010120	TGCTA	2	10	70848	70857	20 %	40 %	20 %	20 %	161869084
39	NC_010120	ACATA	2	10	73616	73625	60 %	20 %	0 %	20 %	161869086
40	NC_010120	AAGCA	2	10	74590	74599	60 %	0 %	20 %	20 %	161869087
41	NC_010120	TTTAA	2	10	74840	74849	40 %	60 %	0 %	0 %	161869087
42	NC_010120	GATTT	2	10	76753	76762	20 %	60 %	20 %	0 %	161869089
43	NC_010120	TGTAT	2	10	78160	78169	20 %	60 %	20 %	0 %	161869090
44	NC_010120	AAAAG	2	10	78344	78353	80 %	0 %	20 %	0 %	161869091
45	NC_010120	TTTGA	2	10	78967	78976	20 %	60 %	20 %	0 %	161869091
46	NC_010120	TGGCT	2	10	79900	79909	0 %	40 %	40 %	20 %	161869092
47	NC_010120	GCAAG	2	10	81181	81190	40 %	0 %	40 %	20 %	161869094
48	NC_010120	GCGCG	2	10	82240	82249	0 %	0 %	60 %	40 %	161869094
49	NC_010120	CAACG	2	10	83162	83171	40 %	0 %	20 %	40 %	161869094
50	NC_010120	CCCGT	2	10	89392	89401	0 %	20 %	20 %	60 %	161869100
51	NC_010120	CCGTA	2	10	89629	89638	20 %	20 %	20 %	40 %	161869100
52	NC_010120	ACATC	2	10	90530	90539	40 %	20 %	0 %	40 %	161869101
53	NC_010120	CGCAA	2	10	92239	92248	40 %	0 %	20 %	40 %	161869102
54	NC_010120	CAAGC	2	10	92604	92613	40 %	0 %	20 %	40 %	161869102
55	NC_010120	GATAT	2	10	96642	96651	40 %	40 %	20 %	0 %	161869107
56	NC_010120	GGCAA	2	10	97960	97969	40 %	0 %	40 %	20 %	161869107
57	NC_010120	AAACC	2	10	98948	98957	60 %	0 %	0 %	40 %	161869108
58	NC_010120	TTCAA	2	10	99358	99367	40 %	40 %	0 %	20 %	161869108
59	NC_010120	GAACA	2	10	103792	103801	60 %	0 %	20 %	20 %	161869111
60	NC_010120	TGCCG	2	10	106821	106830	0 %	20 %	40 %	40 %	161869113
61	NC_010120	TGGCT	2	10	107507	107516	0 %	40 %	40 %	20 %	161869114
62	NC_010120	ACCGA	2	10	108298	108307	40 %	0 %	20 %	40 %	161869114
63	NC_010120	AGGCA	2	10	110061	110070	40 %	0 %	40 %	20 %	161869116
64	NC_010120	CGGCG	2	10	113539	113548	0 %	0 %	60 %	40 %	161869119
65	NC_010120	CGGGC	2	10	115472	115481	0 %	0 %	60 %	40 %	161869120
66	NC_010120	AGGAG	2	10	119346	119355	40 %	0 %	60 %	0 %	161869124
67	NC_010120	TCGAT	2	10	120021	120030	20 %	40 %	20 %	20 %	161869125
68	NC_010120	CCCGC	2	10	120468	120477	0 %	0 %	20 %	80 %	161869125
69	NC_010120	AATCC	2	10	124057	124066	40 %	20 %	0 %	40 %	161869129
70	NC_010120	CAGGA	2	10	124172	124181	40 %	0 %	40 %	20 %	161869129
71	NC_010120	AGGGC	2	10	125414	125423	20 %	0 %	60 %	20 %	161869131
72	NC_010120	TCCGT	2	10	126895	126904	0 %	40 %	20 %	40 %	161869130
73	NC_010120	TTTCC	2	10	128715	128724	0 %	60 %	0 %	40 %	161869132
74	NC_010120	GAACA	2	10	129866	129875	60 %	0 %	20 %	20 %	161869133
75	NC_010120	TTTGC	2	10	131822	131831	0 %	60 %	20 %	20 %	161869137
76	NC_010120	CGGCG	2	10	131967	131976	0 %	0 %	60 %	40 %	161869137
77	NC_010120	GTTTT	2	10	132161	132170	0 %	80 %	20 %	0 %	161869137
78	NC_010120	CGATA	2	10	132242	132251	40 %	20 %	20 %	20 %	161869137
79	NC_010120	GGCAA	2	10	133833	133842	40 %	0 %	40 %	20 %	161869139
80	NC_010120	CAAAC	2	10	134238	134247	60 %	0 %	0 %	40 %	161869140
81	NC_010120	AGCAA	2	10	134252	134261	60 %	0 %	20 %	20 %	161869140
82	NC_010120	GGTAT	2	10	135145	135154	20 %	40 %	40 %	0 %	161869140
83	NC_010120	TGCCG	2	10	140411	140420	0 %	20 %	40 %	40 %	161869145
84	NC_010120	GGGCA	2	10	142187	142196	20 %	0 %	60 %	20 %	161869148
85	NC_010120	GTTCA	2	10	145725	145734	20 %	40 %	20 %	20 %	161869150
86	NC_010120	CAAAA	2	10	146763	146772	80 %	0 %	0 %	20 %	161869151
87	NC_010120	ACGGC	2	10	148703	148712	20 %	0 %	40 %	40 %	161869152
88	NC_010120	GTTAC	2	10	148721	148730	20 %	40 %	20 %	20 %	161869152
89	NC_010120	TAATG	2	10	150802	150811	40 %	40 %	20 %	0 %	161869153
90	NC_010120	CATTT	2	10	156336	156345	20 %	60 %	0 %	20 %	161869159
91	NC_010120	TCAAC	2	10	157684	157693	40 %	20 %	0 %	40 %	161869161
92	NC_010120	AACCT	2	10	157750	157759	40 %	20 %	0 %	40 %	161869161
93	NC_010120	GGCGT	2	10	166257	166266	0 %	20 %	60 %	20 %	161869168
94	NC_010120	TGCGG	2	10	167453	167462	0 %	20 %	60 %	20 %	161869170
95	NC_010120	GGCGC	3	15	172075	172089	0 %	0 %	60 %	40 %	161869172
96	NC_010120	CGCGG	2	10	179424	179433	0 %	0 %	60 %	40 %	229597122
97	NC_010120	CCGCG	2	10	181086	181095	0 %	0 %	40 %	60 %	161869183
98	NC_010120	GTTTT	2	10	189178	189187	0 %	80 %	20 %	0 %	161869187
99	NC_010120	GGTTG	2	10	193874	193883	0 %	40 %	60 %	0 %	161869191
100	NC_010120	CAACC	2	10	193927	193936	40 %	0 %	0 %	60 %	161869191
101	NC_010120	AAGTG	2	10	197479	197488	40 %	20 %	40 %	0 %	161869193
102	NC_010120	CGGCA	2	10	203154	203163	20 %	0 %	40 %	40 %	161869197
103	NC_010120	GCGCG	2	10	204224	204233	0 %	0 %	60 %	40 %	161869201
104	NC_010120	GGGCG	2	10	204805	204814	0 %	0 %	80 %	20 %	161869201
105	NC_010120	ACCGT	2	10	205384	205393	20 %	20 %	20 %	40 %	161869202
106	NC_010120	GCGCG	2	10	213520	213529	0 %	0 %	60 %	40 %	161869205
107	NC_010120	CGGCG	2	10	214223	214232	0 %	0 %	60 %	40 %	161869205
108	NC_010120	CCGCG	2	10	215854	215863	0 %	0 %	40 %	60 %	161869205
109	NC_010120	GCCGC	2	10	216066	216075	0 %	0 %	40 %	60 %	161869205
110	NC_010120	AGGAG	2	10	218899	218908	40 %	0 %	60 %	0 %	161869207
111	NC_010120	GCGCC	2	10	219657	219666	0 %	0 %	40 %	60 %	161869208
112	NC_010120	GTACG	2	10	225598	225607	20 %	20 %	40 %	20 %	161869212
113	NC_010120	CGGCG	2	10	229732	229741	0 %	0 %	60 %	40 %	161869216
114	NC_010120	TCATA	2	10	231825	231834	40 %	40 %	0 %	20 %	161869219
115	NC_010120	GCGCC	2	10	233967	233976	0 %	0 %	40 %	60 %	161869219
116	NC_010120	CCGGC	2	10	234477	234486	0 %	0 %	40 %	60 %	161869219
117	NC_010120	CAAAC	2	10	239325	239334	60 %	0 %	0 %	40 %	161869225
118	NC_010120	TGCGG	2	10	241943	241952	0 %	20 %	60 %	20 %	161869227
119	NC_010120	GGCGC	2	10	241957	241966	0 %	0 %	60 %	40 %	161869227
120	NC_010120	CCGCA	2	10	245762	245771	20 %	0 %	20 %	60 %	161869230
121	NC_010120	TGATA	2	10	246068	246077	40 %	40 %	20 %	0 %	161869230
122	NC_010120	GAAAA	2	10	248970	248979	80 %	0 %	20 %	0 %	161871031
123	NC_010120	GCCGC	2	10	254101	254110	0 %	0 %	40 %	60 %	161869237
124	NC_010120	AAAAC	2	10	254404	254413	80 %	0 %	0 %	20 %	161869237
125	NC_010120	GCAAC	2	10	254832	254841	40 %	0 %	20 %	40 %	161869237
126	NC_010120	GAATG	2	10	254845	254854	40 %	20 %	40 %	0 %	161869237
127	NC_010120	TTTGA	2	10	255556	255565	20 %	60 %	20 %	0 %	161869238
128	NC_010120	TCGGT	2	10	256362	256371	0 %	40 %	40 %	20 %	161869238
129	NC_010120	TTGAT	2	10	256553	256562	20 %	60 %	20 %	0 %	161869238
130	NC_010120	TTTCA	2	10	264188	264197	20 %	60 %	0 %	20 %	161869240
131	NC_010120	TCCGT	2	10	266982	266991	0 %	40 %	20 %	40 %	161869245
132	NC_010120	GGCAT	2	10	268381	268390	20 %	20 %	40 %	20 %	161869247
133	NC_010120	CCCGC	2	10	269319	269328	0 %	0 %	20 %	80 %	161869249
134	NC_010120	CGGCG	2	10	269983	269992	0 %	0 %	60 %	40 %	161869249
135	NC_010120	GCCCA	2	10	271207	271216	20 %	0 %	20 %	60 %	161869252
136	NC_010120	CGGCG	2	10	274582	274591	0 %	0 %	60 %	40 %	161869256
137	NC_010120	GGCGC	2	10	274608	274617	0 %	0 %	60 %	40 %	161869256
138	NC_010120	GCCGC	2	10	275863	275872	0 %	0 %	40 %	60 %	161869257
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142	NC_010120	CAATG	2	10	284501	284510	40 %	20 %	20 %	20 %	161869269
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148	NC_010120	GCGCC	2	10	296075	296084	0 %	0 %	40 %	60 %	161869283
149	NC_010120	AAAAC	2	10	296615	296624	80 %	0 %	0 %	20 %	161869283
150	NC_010120	CCGAC	2	10	297208	297217	20 %	0 %	20 %	60 %	161869284
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152	NC_010120	CGGCG	2	10	301403	301412	0 %	0 %	60 %	40 %	161869288
153	NC_010120	TGCCT	2	10	301443	301452	0 %	40 %	20 %	40 %	161869288
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156	NC_010120	GCACG	2	10	311946	311955	20 %	0 %	40 %	40 %	161869297
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166	NC_010120	TTCGG	2	10	333767	333776	0 %	40 %	40 %	20 %	161869323
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177	NC_010120	CGGCG	2	10	354515	354524	0 %	0 %	60 %	40 %	161869348
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254	NC_010120	GCATC	2	10	505695	505704	20 %	20 %	20 %	40 %	161869474
255	NC_010120	AAAAC	2	10	506149	506158	80 %	0 %	0 %	20 %	161869474
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260	NC_010120	CGATG	2	10	515955	515964	20 %	20 %	40 %	20 %	161869481
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262	NC_010120	GTTTG	2	10	519640	519649	0 %	60 %	40 %	0 %	161869484
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