MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri GWSS

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010118	AAATT	2	10	664	673	60 %	40 %	0 %	0 %	218148539
2	NC_010118	AAAAT	2	10	749	758	80 %	20 %	0 %	0 %	161833636
3	NC_010118	AGAAA	2	10	1660	1669	80 %	0 %	20 %	0 %	161833636
4	NC_010118	AAATA	2	10	2147	2156	80 %	20 %	0 %	0 %	161833636
5	NC_010118	TTGAT	2	10	2342	2351	20 %	60 %	20 %	0 %	161833636
6	NC_010118	TTATT	2	10	3001	3010	20 %	80 %	0 %	0 %	161833636
7	NC_010118	CGAAA	2	10	3093	3102	60 %	0 %	20 %	20 %	161833636
8	NC_010118	AATAA	2	10	3476	3485	80 %	20 %	0 %	0 %	161833637
9	NC_010118	ATTAT	2	10	3862	3871	40 %	60 %	0 %	0 %	161833637
10	NC_010118	AAAAT	2	10	4448	4457	80 %	20 %	0 %	0 %	161833637
11	NC_010118	TAAAA	2	10	6780	6789	80 %	20 %	0 %	0 %	161833639
12	NC_010118	AAAAT	2	10	7000	7009	80 %	20 %	0 %	0 %	161833639
13	NC_010118	AAATA	2	10	7374	7383	80 %	20 %	0 %	0 %	161833639
14	NC_010118	AAAAC	2	10	7943	7952	80 %	0 %	0 %	20 %	161833639
15	NC_010118	TTATA	2	10	8748	8757	40 %	60 %	0 %	0 %	161833640
16	NC_010118	AAAAT	2	10	9175	9184	80 %	20 %	0 %	0 %	161833640
17	NC_010118	TAATA	2	10	9234	9243	60 %	40 %	0 %	0 %	161833640
18	NC_010118	TTATT	2	10	9318	9327	20 %	80 %	0 %	0 %	161833640
19	NC_010118	ATATT	2	10	9502	9511	40 %	60 %	0 %	0 %	161833640
20	NC_010118	ATGAA	2	10	9684	9693	60 %	20 %	20 %	0 %	161833641
21	NC_010118	ATAAA	2	10	13534	13543	80 %	20 %	0 %	0 %	161833643
22	NC_010118	TAATA	2	10	15026	15035	60 %	40 %	0 %	0 %	161833644
23	NC_010118	AATAA	2	10	15333	15342	80 %	20 %	0 %	0 %	161833644
24	NC_010118	AATTA	2	10	17446	17455	60 %	40 %	0 %	0 %	161833646
25	NC_010118	AAATG	2	10	18256	18265	60 %	20 %	20 %	0 %	161833646
26	NC_010118	ATTTT	2	10	18862	18871	20 %	80 %	0 %	0 %	161833648
27	NC_010118	ATTAT	2	10	19019	19028	40 %	60 %	0 %	0 %	161833648
28	NC_010118	CCCAC	2	10	19322	19331	20 %	0 %	0 %	80 %	161833648
29	NC_010118	ATTTT	2	10	20326	20335	20 %	80 %	0 %	0 %	161833649
30	NC_010118	CGTAC	2	10	21982	21991	20 %	20 %	20 %	40 %	161833651
31	NC_010118	ATTTT	2	10	22909	22918	20 %	80 %	0 %	0 %	161833652
32	NC_010118	GTTGT	2	10	23517	23526	0 %	60 %	40 %	0 %	161833653
33	NC_010118	AATGT	2	10	24158	24167	40 %	40 %	20 %	0 %	161833654
34	NC_010118	ATTTT	2	10	24170	24179	20 %	80 %	0 %	0 %	161833654
35	NC_010118	TAATT	2	10	25847	25856	40 %	60 %	0 %	0 %	161833655
36	NC_010118	TAAAT	2	10	26130	26139	60 %	40 %	0 %	0 %	161833655
37	NC_010118	ATCTA	2	10	26765	26774	40 %	40 %	0 %	20 %	161833655
38	NC_010118	TATAT	2	10	27257	27266	40 %	60 %	0 %	0 %	161833655
39	NC_010118	ATTTT	2	10	27885	27894	20 %	80 %	0 %	0 %	161833657
40	NC_010118	ATATA	2	10	27961	27970	60 %	40 %	0 %	0 %	161833657
41	NC_010118	TAATA	2	10	27994	28003	60 %	40 %	0 %	0 %	161833657
42	NC_010118	TATTT	2	10	28637	28646	20 %	80 %	0 %	0 %	161833658
43	NC_010118	AGAAA	2	10	28917	28926	80 %	0 %	20 %	0 %	161833658
44	NC_010118	ATCTA	2	10	28958	28967	40 %	40 %	0 %	20 %	161833658
45	NC_010118	AATTA	3	15	29438	29452	60 %	40 %	0 %	0 %	161833658
46	NC_010118	ATAAA	2	10	30643	30652	80 %	20 %	0 %	0 %	161833660
47	NC_010118	TCTTT	2	10	30720	30729	0 %	80 %	0 %	20 %	161833660
48	NC_010118	TTTTC	2	10	30920	30929	0 %	80 %	0 %	20 %	161833661
49	NC_010118	TACTA	2	10	32658	32667	40 %	40 %	0 %	20 %	161833662
50	NC_010118	ATTAT	2	10	33449	33458	40 %	60 %	0 %	0 %	161833663
51	NC_010118	TCTTT	2	10	33636	33645	0 %	80 %	0 %	20 %	161833664
52	NC_010118	TATTT	2	10	34418	34427	20 %	80 %	0 %	0 %	161833665
53	NC_010118	AATTT	2	10	35507	35516	40 %	60 %	0 %	0 %	161833666
54	NC_010118	ATTTT	2	10	35791	35800	20 %	80 %	0 %	0 %	161833667
55	NC_010118	TTTTA	2	10	36031	36040	20 %	80 %	0 %	0 %	161833667
56	NC_010118	AATGA	2	10	37523	37532	60 %	20 %	20 %	0 %	161833668
57	NC_010118	TAAAA	2	10	37591	37600	80 %	20 %	0 %	0 %	161833668
58	NC_010118	AAATA	2	10	39042	39051	80 %	20 %	0 %	0 %	161833670
59	NC_010118	TAAAT	2	10	39076	39085	60 %	40 %	0 %	0 %	161833670
60	NC_010118	CATAA	2	10	39769	39778	60 %	20 %	0 %	20 %	161833671
61	NC_010118	ATTTA	2	10	40330	40339	40 %	60 %	0 %	0 %	161833671
62	NC_010118	TAATA	2	10	41030	41039	60 %	40 %	0 %	0 %	161833672
63	NC_010118	ATTTT	2	10	41455	41464	20 %	80 %	0 %	0 %	161833672
64	NC_010118	ATATG	2	10	41691	41700	40 %	40 %	20 %	0 %	161833672
65	NC_010118	CCTAA	2	10	42059	42068	40 %	20 %	0 %	40 %	161833673
66	NC_010118	ATTAT	2	10	42135	42144	40 %	60 %	0 %	0 %	161833673
67	NC_010118	TTAAT	2	10	42211	42220	40 %	60 %	0 %	0 %	161833673
68	NC_010118	TTTAA	2	10	42506	42515	40 %	60 %	0 %	0 %	161833674
69	NC_010118	ATTTA	2	10	45570	45579	40 %	60 %	0 %	0 %	161833675
70	NC_010118	TAAAA	2	10	46435	46444	80 %	20 %	0 %	0 %	161833675
71	NC_010118	AGTAA	2	10	46741	46750	60 %	20 %	20 %	0 %	161833676
72	NC_010118	CAAAA	2	10	46949	46958	80 %	0 %	0 %	20 %	161833676
73	NC_010118	TAATT	2	10	47750	47759	40 %	60 %	0 %	0 %	161833677
74	NC_010118	AAAAT	2	10	47875	47884	80 %	20 %	0 %	0 %	161833677
75	NC_010118	TATAA	2	10	48243	48252	60 %	40 %	0 %	0 %	161833677
76	NC_010118	AAATT	2	10	48709	48718	60 %	40 %	0 %	0 %	161833677
77	NC_010118	AAATA	2	10	49244	49253	80 %	20 %	0 %	0 %	161833679
78	NC_010118	TCTAT	2	10	50027	50036	20 %	60 %	0 %	20 %	161833681
79	NC_010118	ATTTT	2	10	51217	51226	20 %	80 %	0 %	0 %	161833683
80	NC_010118	ATTTT	2	10	51532	51541	20 %	80 %	0 %	0 %	161833683
81	NC_010118	TAAAT	2	10	53592	53601	60 %	40 %	0 %	0 %	161833683
82	NC_010118	TTTTA	2	10	53640	53649	20 %	80 %	0 %	0 %	161833683
83	NC_010118	ATATA	2	10	53971	53980	60 %	40 %	0 %	0 %	161833683
84	NC_010118	TATCA	2	10	55155	55164	40 %	40 %	0 %	20 %	161833683
85	NC_010118	ATTTT	2	10	55693	55702	20 %	80 %	0 %	0 %	161833683
86	NC_010118	ATTTT	2	10	55705	55714	20 %	80 %	0 %	0 %	161833683
87	NC_010118	ATTTT	2	10	55717	55726	20 %	80 %	0 %	0 %	161833683
88	NC_010118	ATTTA	2	10	56800	56809	40 %	60 %	0 %	0 %	161833684
89	NC_010118	TTCTC	2	10	57564	57573	0 %	60 %	0 %	40 %	161833684
90	NC_010118	ATTTA	2	10	58603	58612	40 %	60 %	0 %	0 %	161833684
91	NC_010118	AAGTA	2	10	59059	59068	60 %	20 %	20 %	0 %	161833684
92	NC_010118	ATTTT	2	10	61359	61368	20 %	80 %	0 %	0 %	161833688
93	NC_010118	TATTT	2	10	63654	63663	20 %	80 %	0 %	0 %	161833690
94	NC_010118	GATTT	2	10	65088	65097	20 %	60 %	20 %	0 %	161833691
95	NC_010118	TTCTA	2	10	65197	65206	20 %	60 %	0 %	20 %	161833691
96	NC_010118	AATTT	2	10	66647	66656	40 %	60 %	0 %	0 %	161833691
97	NC_010118	TTATA	2	10	68951	68960	40 %	60 %	0 %	0 %	161833692
98	NC_010118	TAAAA	2	10	69726	69735	80 %	20 %	0 %	0 %	161833693
99	NC_010118	ATTAT	2	10	69782	69791	40 %	60 %	0 %	0 %	161833694
100	NC_010118	TAAAA	2	10	70462	70471	80 %	20 %	0 %	0 %	161833695
101	NC_010118	TAATA	2	10	70828	70837	60 %	40 %	0 %	0 %	161833695
102	NC_010118	ATTAA	2	10	71557	71566	60 %	40 %	0 %	0 %	161833695
103	NC_010118	TTTAT	2	10	72099	72108	20 %	80 %	0 %	0 %	161833697
104	NC_010118	GTAAT	2	10	72253	72262	40 %	40 %	20 %	0 %	161833697
105	NC_010118	ATTAT	2	10	72468	72477	40 %	60 %	0 %	0 %	161833697
106	NC_010118	TTTTA	2	10	72836	72845	20 %	80 %	0 %	0 %	161833697
107	NC_010118	ATTTA	2	10	78665	78674	40 %	60 %	0 %	0 %	161833698
108	NC_010118	TATAA	2	10	79325	79334	60 %	40 %	0 %	0 %	161833698
109	NC_010118	AAATA	2	10	80448	80457	80 %	20 %	0 %	0 %	161833701
110	NC_010118	AATTA	2	10	80944	80953	60 %	40 %	0 %	0 %	161833701
111	NC_010118	ATAAA	2	10	81252	81261	80 %	20 %	0 %	0 %	161833701
112	NC_010118	ATTAA	2	10	81308	81317	60 %	40 %	0 %	0 %	161833701
113	NC_010118	ATTAA	2	10	81422	81431	60 %	40 %	0 %	0 %	161833701
114	NC_010118	AATGG	2	10	82016	82025	40 %	20 %	40 %	0 %	161833702
115	NC_010118	TGAAT	2	10	83623	83632	40 %	40 %	20 %	0 %	161833702
116	NC_010118	ATAAA	2	10	83832	83841	80 %	20 %	0 %	0 %	161833702
117	NC_010118	TAATT	2	10	84155	84164	40 %	60 %	0 %	0 %	161833703
118	NC_010118	AGCTA	2	10	84981	84990	40 %	20 %	20 %	20 %	161833704
119	NC_010118	GATTT	2	10	87110	87119	20 %	60 %	20 %	0 %	161833706
120	NC_010118	TAAAA	2	10	88022	88031	80 %	20 %	0 %	0 %	161833707
121	NC_010118	TTAAA	2	10	88245	88254	60 %	40 %	0 %	0 %	161833708
122	NC_010118	ATTAA	2	10	88706	88715	60 %	40 %	0 %	0 %	161833709
123	NC_010118	AGATA	2	10	88806	88815	60 %	20 %	20 %	0 %	161833709
124	NC_010118	ATTAT	2	10	89024	89033	40 %	60 %	0 %	0 %	161833710
125	NC_010118	AATAG	2	10	89380	89389	60 %	20 %	20 %	0 %	161833711
126	NC_010118	ATTAT	2	10	89662	89671	40 %	60 %	0 %	0 %	161833711
127	NC_010118	ATTTA	2	10	89828	89837	40 %	60 %	0 %	0 %	161833712
128	NC_010118	TAAAA	2	10	90017	90026	80 %	20 %	0 %	0 %	161833712
129	NC_010118	AAAAG	2	10	90573	90582	80 %	0 %	20 %	0 %	161833712
130	NC_010118	AATAT	2	10	90625	90634	60 %	40 %	0 %	0 %	161833712
131	NC_010118	AAATT	2	10	92559	92568	60 %	40 %	0 %	0 %	161833714
132	NC_010118	ATTTT	3	15	92626	92640	20 %	80 %	0 %	0 %	161833714
133	NC_010118	ATATT	2	10	93268	93277	40 %	60 %	0 %	0 %	161833715
134	NC_010118	ATTTT	2	10	93593	93602	20 %	80 %	0 %	0 %	161833715
135	NC_010118	AATTT	2	10	93895	93904	40 %	60 %	0 %	0 %	161833715
136	NC_010118	CTAAA	2	10	98619	98628	60 %	20 %	0 %	20 %	161833720
137	NC_010118	TTTAC	2	10	99170	99179	20 %	60 %	0 %	20 %	161833721
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.