MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 1217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	161830473
2	NC_010117	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	161831398
3	NC_010117	AAATA	2	10	8911	8920	80 %	20 %	0 %	0 %	161831413
4	NC_010117	AAACT	2	10	12354	12363	60 %	20 %	0 %	20 %	161831338
5	NC_010117	AATGG	2	10	15474	15483	40 %	20 %	40 %	0 %	161831122
6	NC_010117	TTTTA	2	10	15845	15854	20 %	80 %	0 %	0 %	161831130
7	NC_010117	TTTTA	2	10	17286	17295	20 %	80 %	0 %	0 %	161831015
8	NC_010117	GAAAT	2	10	17414	17423	60 %	20 %	20 %	0 %	161831015
9	NC_010117	TTGCG	2	10	18407	18416	0 %	40 %	40 %	20 %	161830023
10	NC_010117	TACAT	2	10	22923	22932	40 %	40 %	0 %	20 %	161831327
11	NC_010117	GCAGC	2	10	25671	25680	20 %	0 %	40 %	40 %	161831441
12	NC_010117	GCCCG	2	10	26385	26394	0 %	0 %	40 %	60 %	161829860
13	NC_010117	ATACG	2	10	27304	27313	40 %	20 %	20 %	20 %	161829860
14	NC_010117	AATGC	2	10	29284	29293	40 %	20 %	20 %	20 %	161830734
15	NC_010117	TTGTT	2	10	30672	30681	0 %	80 %	20 %	0 %	161830612
16	NC_010117	GTTTT	2	10	31000	31009	0 %	80 %	20 %	0 %	161830612
17	NC_010117	ATTCG	2	10	33739	33748	20 %	40 %	20 %	20 %	161831447
18	NC_010117	TGCGT	2	10	35017	35026	0 %	40 %	40 %	20 %	161829730
19	NC_010117	TGGGT	2	10	35883	35892	0 %	40 %	60 %	0 %	161831565
20	NC_010117	TAAAT	2	10	40259	40268	60 %	40 %	0 %	0 %	161830478
21	NC_010117	TGCGC	2	10	45764	45773	0 %	20 %	40 %	40 %	161830711
22	NC_010117	CAGCC	2	10	51543	51552	20 %	0 %	20 %	60 %	161830390
23	NC_010117	AAGGT	2	10	54692	54701	40 %	20 %	40 %	0 %	161830931
24	NC_010117	ATTTA	2	10	58275	58284	40 %	60 %	0 %	0 %	161831059
25	NC_010117	ACAAA	2	10	58300	58309	80 %	0 %	0 %	20 %	161831059
26	NC_010117	TTTTA	2	10	58729	58738	20 %	80 %	0 %	0 %	161831197
27	NC_010117	CGATT	2	10	59752	59761	20 %	40 %	20 %	20 %	161831197
28	NC_010117	TTCGT	2	10	60608	60617	0 %	60 %	20 %	20 %	161830271
29	NC_010117	ACGAT	2	10	63007	63016	40 %	20 %	20 %	20 %	161831469
30	NC_010117	AATTT	2	10	65912	65921	40 %	60 %	0 %	0 %	161831173
31	NC_010117	TAAGA	2	10	66102	66111	60 %	20 %	20 %	0 %	161831173
32	NC_010117	TAATA	2	10	66583	66592	60 %	40 %	0 %	0 %	161830759
33	NC_010117	TTCCC	2	10	70756	70765	0 %	40 %	0 %	60 %	161830028
34	NC_010117	GCAAT	2	10	71067	71076	40 %	20 %	20 %	20 %	161830028
35	NC_010117	GTTTT	2	10	73861	73870	0 %	80 %	20 %	0 %	161831337
36	NC_010117	GAAAA	2	10	74047	74056	80 %	0 %	20 %	0 %	161831337
37	NC_010117	CGCGA	2	10	75435	75444	20 %	0 %	40 %	40 %	161830232
38	NC_010117	AAATG	2	10	76058	76067	60 %	20 %	20 %	0 %	161830232
39	NC_010117	TTCAA	2	10	76799	76808	40 %	40 %	0 %	20 %	161829953
40	NC_010117	TCGCT	2	10	77747	77756	0 %	40 %	20 %	40 %	161830649
41	NC_010117	GTAGG	2	10	83147	83156	20 %	20 %	60 %	0 %	161831372
42	NC_010117	AGCGA	2	10	83297	83306	40 %	0 %	40 %	20 %	161830760
43	NC_010117	GTTTG	2	10	85322	85331	0 %	60 %	40 %	0 %	161831617
44	NC_010117	ATCAA	2	10	85967	85976	60 %	20 %	0 %	20 %	161831101
45	NC_010117	GAATG	2	10	86607	86616	40 %	20 %	40 %	0 %	161829963
46	NC_010117	TCCAT	2	10	87759	87768	20 %	40 %	0 %	40 %	161830465
47	NC_010117	AATAA	2	10	88608	88617	80 %	20 %	0 %	0 %	161831390
48	NC_010117	CGGCG	2	10	88657	88666	0 %	0 %	60 %	40 %	161831390
49	NC_010117	TAATT	2	10	89151	89160	40 %	60 %	0 %	0 %	161830852
50	NC_010117	CGCGG	2	10	90430	90439	0 %	0 %	60 %	40 %	161830827
51	NC_010117	CAATG	2	10	91012	91021	40 %	20 %	20 %	20 %	161830385
52	NC_010117	TTGTA	2	10	93644	93653	20 %	60 %	20 %	0 %	161829772
53	NC_010117	ATTGT	2	10	94723	94732	20 %	60 %	20 %	0 %	161829772
54	NC_010117	GCAAA	2	10	95151	95160	60 %	0 %	20 %	20 %	161829772
55	NC_010117	GATTG	2	10	96951	96960	20 %	40 %	40 %	0 %	161831058
56	NC_010117	CCATC	2	10	97540	97549	20 %	20 %	0 %	60 %	161829992
57	NC_010117	ATTTA	2	10	100525	100534	40 %	60 %	0 %	0 %	161830966
58	NC_010117	TATCA	2	10	100830	100839	40 %	40 %	0 %	20 %	161829905
59	NC_010117	CGATA	2	10	103381	103390	40 %	20 %	20 %	20 %	161830748
60	NC_010117	CAATT	2	10	105909	105918	40 %	40 %	0 %	20 %	161830579
61	NC_010117	CGATT	2	10	106644	106653	20 %	40 %	20 %	20 %	161830579
62	NC_010117	ATAAA	2	10	106686	106695	80 %	20 %	0 %	0 %	161830579
63	NC_010117	CGAAA	2	10	109080	109089	60 %	0 %	20 %	20 %	161831284
64	NC_010117	CGCTT	2	10	109119	109128	0 %	40 %	20 %	40 %	161831284
65	NC_010117	TATAA	2	10	109885	109894	60 %	40 %	0 %	0 %	161831089
66	NC_010117	TGCAC	2	10	110336	110345	20 %	20 %	20 %	40 %	161829968
67	NC_010117	AATAA	2	10	110767	110776	80 %	20 %	0 %	0 %	161829866
68	NC_010117	TTTGG	2	10	112537	112546	0 %	60 %	40 %	0 %	161830424
69	NC_010117	CAGCG	2	10	114888	114897	20 %	0 %	40 %	40 %	161830558
70	NC_010117	TTTCT	2	10	115179	115188	0 %	80 %	0 %	20 %	161830394
71	NC_010117	ACATA	2	10	115952	115961	60 %	20 %	0 %	20 %	161830394
72	NC_010117	TGCGC	2	10	118508	118517	0 %	20 %	40 %	40 %	161830490
73	NC_010117	AATTG	2	10	118915	118924	40 %	40 %	20 %	0 %	161830833
74	NC_010117	AACGC	2	10	121030	121039	40 %	0 %	20 %	40 %	161831365
75	NC_010117	GTTGA	2	10	123862	123871	20 %	40 %	40 %	0 %	161830941
76	NC_010117	ATCCA	2	10	125560	125569	40 %	20 %	0 %	40 %	161831200
77	NC_010117	CCTTA	2	10	128845	128854	20 %	40 %	0 %	40 %	161830938
78	NC_010117	CAGAA	2	10	136431	136440	60 %	0 %	20 %	20 %	161830634
79	NC_010117	AAAGG	2	10	136477	136486	60 %	0 %	40 %	0 %	161830634
80	NC_010117	ATTTA	2	10	142370	142379	40 %	60 %	0 %	0 %	161831472
81	NC_010117	TTAAA	2	10	142934	142943	60 %	40 %	0 %	0 %	161830080
82	NC_010117	TTAAA	2	10	143919	143928	60 %	40 %	0 %	0 %	161830080
83	NC_010117	GTTTT	2	10	146343	146352	0 %	80 %	20 %	0 %	161829880
84	NC_010117	TGAAA	2	10	146784	146793	60 %	20 %	20 %	0 %	161829880
85	NC_010117	GCGCC	2	10	151081	151090	0 %	0 %	40 %	60 %	161829742
86	NC_010117	TCGTT	2	10	151417	151426	0 %	60 %	20 %	20 %	161831251
87	NC_010117	TGGAG	2	10	152178	152187	20 %	20 %	60 %	0 %	161831251
88	NC_010117	CTTGT	2	10	153920	153929	0 %	60 %	20 %	20 %	161830616
89	NC_010117	ATTTA	2	10	155419	155428	40 %	60 %	0 %	0 %	161831311
90	NC_010117	TTAAT	2	10	156850	156859	40 %	60 %	0 %	0 %	161831560
91	NC_010117	TTATT	2	10	159553	159562	20 %	80 %	0 %	0 %	161830087
92	NC_010117	TTATT	2	10	160759	160768	20 %	80 %	0 %	0 %	161830087
93	NC_010117	TGATT	2	10	160907	160916	20 %	60 %	20 %	0 %	161830087
94	NC_010117	TTCCT	2	10	161467	161476	0 %	60 %	0 %	40 %	161830700
95	NC_010117	GATTG	2	10	163519	163528	20 %	40 %	40 %	0 %	161830284
96	NC_010117	ACAAT	2	10	165543	165552	60 %	20 %	0 %	20 %	161830501
97	NC_010117	CAATT	2	10	166811	166820	40 %	40 %	0 %	20 %	161830799
98	NC_010117	GCCGC	2	10	168560	168569	0 %	0 %	40 %	60 %	161830758
99	NC_010117	CCTTT	2	10	172810	172819	0 %	60 %	0 %	40 %	161830356
100	NC_010117	ACGCG	2	10	173705	173714	20 %	0 %	40 %	40 %	161829829
101	NC_010117	GCATT	2	10	174921	174930	20 %	40 %	20 %	20 %	161831111
102	NC_010117	TATCG	2	10	175234	175243	20 %	40 %	20 %	20 %	161830684
103	NC_010117	TCACC	2	10	175975	175984	20 %	20 %	0 %	60 %	161830265
104	NC_010117	TGAAT	2	10	176285	176294	40 %	40 %	20 %	0 %	161830265
105	NC_010117	AGTTG	2	10	178388	178397	20 %	40 %	40 %	0 %	161829991
106	NC_010117	AAGCG	2	10	179302	179311	40 %	0 %	40 %	20 %	161831113
107	NC_010117	CGATG	2	10	180935	180944	20 %	20 %	40 %	20 %	161829774
108	NC_010117	GGTTG	2	10	181425	181434	0 %	40 %	60 %	0 %	161831306
109	NC_010117	TGTGG	2	10	184326	184335	0 %	40 %	60 %	0 %	161830091
110	NC_010117	TGGAT	2	10	187981	187990	20 %	40 %	40 %	0 %	161830315
111	NC_010117	CAACA	2	10	190057	190066	60 %	0 %	0 %	40 %	161830555
112	NC_010117	CAAGG	2	10	191554	191563	40 %	0 %	40 %	20 %	161830535
113	NC_010117	ACGTT	2	10	191598	191607	20 %	40 %	20 %	20 %	161830535
114	NC_010117	AAGTG	2	10	192245	192254	40 %	20 %	40 %	0 %	161830873
115	NC_010117	TCGGG	2	10	192514	192523	0 %	20 %	60 %	20 %	161830873
116	NC_010117	ATTAA	2	10	193470	193479	60 %	40 %	0 %	0 %	161831633
117	NC_010117	GGCTG	2	10	195291	195300	0 %	20 %	60 %	20 %	161830225
118	NC_010117	ATTTT	2	10	197814	197823	20 %	80 %	0 %	0 %	161830959
119	NC_010117	GAAAA	2	10	197961	197970	80 %	0 %	20 %	0 %	161830105
120	NC_010117	GTTTT	2	10	198924	198933	0 %	80 %	20 %	0 %	161831392
121	NC_010117	TTTGG	2	10	208839	208848	0 %	60 %	40 %	0 %	161830487
122	NC_010117	CAACC	2	10	209323	209332	40 %	0 %	0 %	60 %	161830487
123	NC_010117	CGTAA	2	10	210660	210669	40 %	20 %	20 %	20 %	161830519
124	NC_010117	AATCC	2	10	212463	212472	40 %	20 %	0 %	40 %	161829755
125	NC_010117	TAAAT	2	10	213159	213168	60 %	40 %	0 %	0 %	161830282
126	NC_010117	TTTGG	2	10	213169	213178	0 %	60 %	40 %	0 %	161830282
127	NC_010117	ATGAT	2	10	213695	213704	40 %	40 %	20 %	0 %	161830293
128	NC_010117	TAAAA	2	10	215281	215290	80 %	20 %	0 %	0 %	161831205
129	NC_010117	CGTAA	2	10	216723	216732	40 %	20 %	20 %	20 %	161830350
130	NC_010117	CAAAT	2	10	217402	217411	60 %	20 %	0 %	20 %	161830740
131	NC_010117	CTTTC	2	10	217932	217941	0 %	60 %	0 %	40 %	161831385
132	NC_010117	AGCGT	2	10	218247	218256	20 %	20 %	40 %	20 %	161831385
133	NC_010117	TCACT	2	10	218561	218570	20 %	40 %	0 %	40 %	161831385
134	NC_010117	AATTG	2	10	228201	228210	40 %	40 %	20 %	0 %	161830840
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