MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 6031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	161830473
2	NC_010117	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	161830473
3	NC_010117	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	161830473
4	NC_010117	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	161830473
5	NC_010117	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	161830473
6	NC_010117	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	161830473
7	NC_010117	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	161831398
8	NC_010117	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	161831398
9	NC_010117	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	161831398
10	NC_010117	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	161830866
11	NC_010117	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	161830866
12	NC_010117	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	161830866
13	NC_010117	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	161830866
14	NC_010117	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	161830866
15	NC_010117	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	161830866
16	NC_010117	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	161830866
17	NC_010117	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	161830408
18	NC_010117	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	161830408
19	NC_010117	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	161830408
20	NC_010117	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	161830408
21	NC_010117	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	161830408
22	NC_010117	ACCC	2	8	6709	6716	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_010117	GTAT	2	8	6890	6897	25 %	50 %	25 %	0 %	161831254
24	NC_010117	AGCG	2	8	7277	7284	25 %	0 %	50 %	25 %	161831254
25	NC_010117	TTGT	2	8	7325	7332	0 %	75 %	25 %	0 %	161831254
26	NC_010117	GGGT	2	8	7438	7445	0 %	25 %	75 %	0 %	161831254
27	NC_010117	GAAT	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	161831254
28	NC_010117	CTTT	2	8	8023	8030	0 %	75 %	0 %	25 %	161830165
29	NC_010117	GGGT	2	8	8057	8064	0 %	25 %	75 %	0 %	161830165
30	NC_010117	CCCA	2	8	8183	8190	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010117	GTGA	2	8	8437	8444	25 %	25 %	50 %	0 %	161831413
32	NC_010117	TCTT	2	8	8476	8483	0 %	75 %	0 %	25 %	161831413
33	NC_010117	GTAA	2	8	8488	8495	50 %	25 %	25 %	0 %	161831413
34	NC_010117	TGGC	2	8	9173	9180	0 %	25 %	50 %	25 %	161831543
35	NC_010117	AAGT	2	8	9313	9320	50 %	25 %	25 %	0 %	161831543
36	NC_010117	TAAA	2	8	9559	9566	75 %	25 %	0 %	0 %	161831551
37	NC_010117	AAAG	2	8	9643	9650	75 %	0 %	25 %	0 %	161831551
38	NC_010117	CCGC	2	8	11226	11233	0 %	0 %	25 %	75 %	161830543
39	NC_010117	TTCT	2	8	11486	11493	0 %	75 %	0 %	25 %	161830543
40	NC_010117	TGGT	2	8	11592	11599	0 %	50 %	50 %	0 %	161830543
41	NC_010117	CCCT	2	8	11857	11864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010117	CCGA	2	8	11920	11927	25 %	0 %	25 %	50 %	161831338
43	NC_010117	AAGG	2	8	12182	12189	50 %	0 %	50 %	0 %	161831338
44	NC_010117	AAAT	2	8	12467	12474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010117	AAAG	2	8	12757	12764	75 %	0 %	25 %	0 %	161830428
46	NC_010117	CCCA	2	8	12882	12889	25 %	0 %	0 %	75 %	161830428
47	NC_010117	TTAG	2	8	13110	13117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010117	TTGC	3	12	13186	13197	0 %	50 %	25 %	25 %	161829738
49	NC_010117	AAAG	2	8	13374	13381	75 %	0 %	25 %	0 %	161829738
50	NC_010117	GAAA	2	8	13721	13728	75 %	0 %	25 %	0 %	161831538
51	NC_010117	ATTT	2	8	13785	13792	25 %	75 %	0 %	0 %	161831538
52	NC_010117	CGAT	2	8	14113	14120	25 %	25 %	25 %	25 %	161831538
53	NC_010117	CAAA	2	8	14165	14172	75 %	0 %	0 %	25 %	161831538
54	NC_010117	ATGA	2	8	14173	14180	50 %	25 %	25 %	0 %	161831538
55	NC_010117	TCGA	2	8	14573	14580	25 %	25 %	25 %	25 %	161831122
56	NC_010117	TGTC	2	8	14673	14680	0 %	50 %	25 %	25 %	161831122
57	NC_010117	GACG	2	8	14838	14845	25 %	0 %	50 %	25 %	161831122
58	NC_010117	GCGT	2	8	14994	15001	0 %	25 %	50 %	25 %	161831122
59	NC_010117	ACAA	2	8	15006	15013	75 %	0 %	0 %	25 %	161831122
60	NC_010117	ATTA	2	8	15429	15436	50 %	50 %	0 %	0 %	161831122
61	NC_010117	ATTC	2	8	15754	15761	25 %	50 %	0 %	25 %	161831130
62	NC_010117	AGCT	2	8	15820	15827	25 %	25 %	25 %	25 %	161831130
63	NC_010117	CGGC	2	8	15879	15886	0 %	0 %	50 %	50 %	161831130
64	NC_010117	TGAT	2	8	16191	16198	25 %	50 %	25 %	0 %	161831130
65	NC_010117	ACCC	2	8	16251	16258	25 %	0 %	0 %	75 %	161831130
66	NC_010117	TTGG	2	8	16351	16358	0 %	50 %	50 %	0 %	161831130
67	NC_010117	ATTT	2	8	17029	17036	25 %	75 %	0 %	0 %	161831015
68	NC_010117	GTTT	2	8	17084	17091	0 %	75 %	25 %	0 %	161831015
69	NC_010117	GTCA	2	8	17152	17159	25 %	25 %	25 %	25 %	161831015
70	NC_010117	GCTT	2	8	17193	17200	0 %	50 %	25 %	25 %	161831015
71	NC_010117	TGGA	2	8	17625	17632	25 %	25 %	50 %	0 %	161831015
72	NC_010117	CTTT	2	8	17777	17784	0 %	75 %	0 %	25 %	161831015
73	NC_010117	TATT	2	8	18208	18215	25 %	75 %	0 %	0 %	161830023
74	NC_010117	TATT	2	8	18280	18287	25 %	75 %	0 %	0 %	161830023
75	NC_010117	AATA	2	8	18592	18599	75 %	25 %	0 %	0 %	161831550
76	NC_010117	GTGG	2	8	19006	19013	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010117	GATC	2	8	19388	19395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010117	TCTT	2	8	19458	19465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010117	ACCC	2	8	19758	19765	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_010117	ATAA	2	8	19863	19870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010117	TTGT	2	8	20108	20115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010117	ATTC	2	8	20374	20381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010117	CAAC	2	8	20793	20800	50 %	0 %	0 %	50 %	161829805
84	NC_010117	GCCA	2	8	21390	21397	25 %	0 %	25 %	50 %	161829805
85	NC_010117	ACAA	2	8	21489	21496	75 %	0 %	0 %	25 %	161829805
86	NC_010117	AAAG	2	8	21987	21994	75 %	0 %	25 %	0 %	161831327
87	NC_010117	TATT	2	8	22050	22057	25 %	75 %	0 %	0 %	161831327
88	NC_010117	TTAC	2	8	22216	22223	25 %	50 %	0 %	25 %	161831327
89	NC_010117	TTTA	2	8	22227	22234	25 %	75 %	0 %	0 %	161831327
90	NC_010117	GGGT	2	8	23404	23411	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010117	ATGA	2	8	23568	23575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010117	ATCC	2	8	23666	23673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010117	ATCA	2	8	23701	23708	50 %	25 %	0 %	25 %	161830879
94	NC_010117	GAAA	2	8	23723	23730	75 %	0 %	25 %	0 %	161830879
95	NC_010117	TGAT	2	8	23788	23795	25 %	50 %	25 %	0 %	161830879
96	NC_010117	ATTG	2	8	24324	24331	25 %	50 %	25 %	0 %	161830879
97	NC_010117	GGCT	2	8	25036	25043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010117	GCTT	2	8	25243	25250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010117	CAAA	2	8	25569	25576	75 %	0 %	0 %	25 %	161831441
100	NC_010117	GTAA	2	8	25643	25650	50 %	25 %	25 %	0 %	161831441
101	NC_010117	TAAA	2	8	25663	25670	75 %	25 %	0 %	0 %	161831441
102	NC_010117	TAGC	2	8	26296	26303	25 %	25 %	25 %	25 %	161829860
103	NC_010117	TAAT	2	8	26371	26378	50 %	50 %	0 %	0 %	161829860
104	NC_010117	CACC	2	8	26438	26445	25 %	0 %	0 %	75 %	161829860
105	NC_010117	AATT	2	8	26601	26608	50 %	50 %	0 %	0 %	161829860
106	NC_010117	AAAT	2	8	26694	26701	75 %	25 %	0 %	0 %	161829860
107	NC_010117	GAAA	2	8	26827	26834	75 %	0 %	25 %	0 %	161829860
108	NC_010117	ATCA	2	8	27324	27331	50 %	25 %	0 %	25 %	161829860
109	NC_010117	CTGT	2	8	27496	27503	0 %	50 %	25 %	25 %	161829860
110	NC_010117	TTTG	2	8	27986	27993	0 %	75 %	25 %	0 %	161829860
111	NC_010117	GTTT	2	8	28009	28016	0 %	75 %	25 %	0 %	161829860
112	NC_010117	GCAG	2	8	28599	28606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010117	AATT	2	8	28971	28978	50 %	50 %	0 %	0 %	161830734
114	NC_010117	CCTT	2	8	29029	29036	0 %	50 %	0 %	50 %	161830734
115	NC_010117	CTTT	2	8	29129	29136	0 %	75 %	0 %	25 %	161830734
116	NC_010117	CTTT	2	8	29484	29491	0 %	75 %	0 %	25 %	161830734
117	NC_010117	GAAA	2	8	29515	29522	75 %	0 %	25 %	0 %	161830734
118	NC_010117	TTTA	2	8	29542	29549	25 %	75 %	0 %	0 %	161830734
119	NC_010117	GAGG	2	8	29651	29658	25 %	0 %	75 %	0 %	161830734
120	NC_010117	AATT	2	8	30044	30051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010117	GCTT	2	8	30078	30085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010117	ACGA	2	8	30188	30195	50 %	0 %	25 %	25 %	161829965
123	NC_010117	CTTG	2	8	30295	30302	0 %	50 %	25 %	25 %	161829965
124	NC_010117	TCAC	2	8	30812	30819	25 %	25 %	0 %	50 %	161830612
125	NC_010117	TGGG	2	8	31316	31323	0 %	25 %	75 %	0 %	161830810
126	NC_010117	ACGC	2	8	31385	31392	25 %	0 %	25 %	50 %	161830810
127	NC_010117	TTGG	2	8	31862	31869	0 %	50 %	50 %	0 %	161830810
128	NC_010117	TGAA	2	8	32232	32239	50 %	25 %	25 %	0 %	161830810
129	NC_010117	ATTT	2	8	32917	32924	25 %	75 %	0 %	0 %	161831447
130	NC_010117	ACTT	2	8	33219	33226	25 %	50 %	0 %	25 %	161831447
131	NC_010117	ATCG	2	8	33400	33407	25 %	25 %	25 %	25 %	161831447
132	NC_010117	AAAT	2	8	33506	33513	75 %	25 %	0 %	0 %	161831447
133	NC_010117	AAAC	2	8	33756	33763	75 %	0 %	0 %	25 %	161831447
134	NC_010117	CAAA	2	8	34232	34239	75 %	0 %	0 %	25 %	161831447
135	NC_010117	AAAC	2	8	34833	34840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010117	AGTT	2	8	35460	35467	25 %	50 %	25 %	0 %	161829730
137	NC_010117	TGCG	2	8	35792	35799	0 %	25 %	50 %	25 %	161831565
138	NC_010117	CCCG	2	8	35928	35935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_010117	GAGT	2	8	36184	36191	25 %	25 %	50 %	0 %	161830272
140	NC_010117	TATT	2	8	36567	36574	25 %	75 %	0 %	0 %	161830272
141	NC_010117	TTTC	2	8	37060	37067	0 %	75 %	0 %	25 %	161830272
142	NC_010117	TCAC	2	8	37800	37807	25 %	25 %	0 %	50 %	161830272
143	NC_010117	AAGA	2	8	38308	38315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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