MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 4708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	161830473
2	NC_010117	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	161830473
3	NC_010117	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	161830473
4	NC_010117	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	161830473
5	NC_010117	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	161830473
6	NC_010117	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	161830473
7	NC_010117	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	161831398
8	NC_010117	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	161831398
9	NC_010117	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	161831398
10	NC_010117	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	161830866
11	NC_010117	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	161830866
12	NC_010117	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	161830866
13	NC_010117	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	161830866
14	NC_010117	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	161830866
15	NC_010117	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	161830866
16	NC_010117	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	161830866
17	NC_010117	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	161830408
18	NC_010117	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	161830408
19	NC_010117	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	161830408
20	NC_010117	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	161830408
21	NC_010117	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	161830408
22	NC_010117	GTAT	2	8	6890	6897	25 %	50 %	25 %	0 %	161831254
23	NC_010117	AGCG	2	8	7277	7284	25 %	0 %	50 %	25 %	161831254
24	NC_010117	TTGT	2	8	7325	7332	0 %	75 %	25 %	0 %	161831254
25	NC_010117	GGGT	2	8	7438	7445	0 %	25 %	75 %	0 %	161831254
26	NC_010117	GAAT	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	161831254
27	NC_010117	CTTT	2	8	8023	8030	0 %	75 %	0 %	25 %	161830165
28	NC_010117	GGGT	2	8	8057	8064	0 %	25 %	75 %	0 %	161830165
29	NC_010117	GTGA	2	8	8437	8444	25 %	25 %	50 %	0 %	161831413
30	NC_010117	TCTT	2	8	8476	8483	0 %	75 %	0 %	25 %	161831413
31	NC_010117	GTAA	2	8	8488	8495	50 %	25 %	25 %	0 %	161831413
32	NC_010117	TGGC	2	8	9173	9180	0 %	25 %	50 %	25 %	161831543
33	NC_010117	AAGT	2	8	9313	9320	50 %	25 %	25 %	0 %	161831543
34	NC_010117	TAAA	2	8	9559	9566	75 %	25 %	0 %	0 %	161831551
35	NC_010117	AAAG	2	8	9643	9650	75 %	0 %	25 %	0 %	161831551
36	NC_010117	CCGC	2	8	11226	11233	0 %	0 %	25 %	75 %	161830543
37	NC_010117	TTCT	2	8	11486	11493	0 %	75 %	0 %	25 %	161830543
38	NC_010117	TGGT	2	8	11592	11599	0 %	50 %	50 %	0 %	161830543
39	NC_010117	CCGA	2	8	11920	11927	25 %	0 %	25 %	50 %	161831338
40	NC_010117	AAGG	2	8	12182	12189	50 %	0 %	50 %	0 %	161831338
41	NC_010117	AAAG	2	8	12757	12764	75 %	0 %	25 %	0 %	161830428
42	NC_010117	CCCA	2	8	12882	12889	25 %	0 %	0 %	75 %	161830428
43	NC_010117	TTGC	3	12	13186	13197	0 %	50 %	25 %	25 %	161829738
44	NC_010117	AAAG	2	8	13374	13381	75 %	0 %	25 %	0 %	161829738
45	NC_010117	GAAA	2	8	13721	13728	75 %	0 %	25 %	0 %	161831538
46	NC_010117	ATTT	2	8	13785	13792	25 %	75 %	0 %	0 %	161831538
47	NC_010117	CGAT	2	8	14113	14120	25 %	25 %	25 %	25 %	161831538
48	NC_010117	CAAA	2	8	14165	14172	75 %	0 %	0 %	25 %	161831538
49	NC_010117	ATGA	2	8	14173	14180	50 %	25 %	25 %	0 %	161831538
50	NC_010117	TCGA	2	8	14573	14580	25 %	25 %	25 %	25 %	161831122
51	NC_010117	TGTC	2	8	14673	14680	0 %	50 %	25 %	25 %	161831122
52	NC_010117	GACG	2	8	14838	14845	25 %	0 %	50 %	25 %	161831122
53	NC_010117	GCGT	2	8	14994	15001	0 %	25 %	50 %	25 %	161831122
54	NC_010117	ACAA	2	8	15006	15013	75 %	0 %	0 %	25 %	161831122
55	NC_010117	ATTA	2	8	15429	15436	50 %	50 %	0 %	0 %	161831122
56	NC_010117	ATTC	2	8	15754	15761	25 %	50 %	0 %	25 %	161831130
57	NC_010117	AGCT	2	8	15820	15827	25 %	25 %	25 %	25 %	161831130
58	NC_010117	CGGC	2	8	15879	15886	0 %	0 %	50 %	50 %	161831130
59	NC_010117	TGAT	2	8	16191	16198	25 %	50 %	25 %	0 %	161831130
60	NC_010117	ACCC	2	8	16251	16258	25 %	0 %	0 %	75 %	161831130
61	NC_010117	TTGG	2	8	16351	16358	0 %	50 %	50 %	0 %	161831130
62	NC_010117	ATTT	2	8	17029	17036	25 %	75 %	0 %	0 %	161831015
63	NC_010117	GTTT	2	8	17084	17091	0 %	75 %	25 %	0 %	161831015
64	NC_010117	GTCA	2	8	17152	17159	25 %	25 %	25 %	25 %	161831015
65	NC_010117	GCTT	2	8	17193	17200	0 %	50 %	25 %	25 %	161831015
66	NC_010117	TGGA	2	8	17625	17632	25 %	25 %	50 %	0 %	161831015
67	NC_010117	CTTT	2	8	17777	17784	0 %	75 %	0 %	25 %	161831015
68	NC_010117	TATT	2	8	18208	18215	25 %	75 %	0 %	0 %	161830023
69	NC_010117	TATT	2	8	18280	18287	25 %	75 %	0 %	0 %	161830023
70	NC_010117	AATA	2	8	18592	18599	75 %	25 %	0 %	0 %	161831550
71	NC_010117	CAAC	2	8	20793	20800	50 %	0 %	0 %	50 %	161829805
72	NC_010117	GCCA	2	8	21390	21397	25 %	0 %	25 %	50 %	161829805
73	NC_010117	ACAA	2	8	21489	21496	75 %	0 %	0 %	25 %	161829805
74	NC_010117	AAAG	2	8	21987	21994	75 %	0 %	25 %	0 %	161831327
75	NC_010117	TATT	2	8	22050	22057	25 %	75 %	0 %	0 %	161831327
76	NC_010117	TTAC	2	8	22216	22223	25 %	50 %	0 %	25 %	161831327
77	NC_010117	TTTA	2	8	22227	22234	25 %	75 %	0 %	0 %	161831327
78	NC_010117	ATCA	2	8	23701	23708	50 %	25 %	0 %	25 %	161830879
79	NC_010117	GAAA	2	8	23723	23730	75 %	0 %	25 %	0 %	161830879
80	NC_010117	TGAT	2	8	23788	23795	25 %	50 %	25 %	0 %	161830879
81	NC_010117	ATTG	2	8	24324	24331	25 %	50 %	25 %	0 %	161830879
82	NC_010117	CAAA	2	8	25569	25576	75 %	0 %	0 %	25 %	161831441
83	NC_010117	GTAA	2	8	25643	25650	50 %	25 %	25 %	0 %	161831441
84	NC_010117	TAAA	2	8	25663	25670	75 %	25 %	0 %	0 %	161831441
85	NC_010117	TAGC	2	8	26296	26303	25 %	25 %	25 %	25 %	161829860
86	NC_010117	TAAT	2	8	26371	26378	50 %	50 %	0 %	0 %	161829860
87	NC_010117	CACC	2	8	26438	26445	25 %	0 %	0 %	75 %	161829860
88	NC_010117	AATT	2	8	26601	26608	50 %	50 %	0 %	0 %	161829860
89	NC_010117	AAAT	2	8	26694	26701	75 %	25 %	0 %	0 %	161829860
90	NC_010117	GAAA	2	8	26827	26834	75 %	0 %	25 %	0 %	161829860
91	NC_010117	ATCA	2	8	27324	27331	50 %	25 %	0 %	25 %	161829860
92	NC_010117	CTGT	2	8	27496	27503	0 %	50 %	25 %	25 %	161829860
93	NC_010117	TTTG	2	8	27986	27993	0 %	75 %	25 %	0 %	161829860
94	NC_010117	GTTT	2	8	28009	28016	0 %	75 %	25 %	0 %	161829860
95	NC_010117	AATT	2	8	28971	28978	50 %	50 %	0 %	0 %	161830734
96	NC_010117	CCTT	2	8	29029	29036	0 %	50 %	0 %	50 %	161830734
97	NC_010117	CTTT	2	8	29129	29136	0 %	75 %	0 %	25 %	161830734
98	NC_010117	CTTT	2	8	29484	29491	0 %	75 %	0 %	25 %	161830734
99	NC_010117	GAAA	2	8	29515	29522	75 %	0 %	25 %	0 %	161830734
100	NC_010117	TTTA	2	8	29542	29549	25 %	75 %	0 %	0 %	161830734
101	NC_010117	GAGG	2	8	29651	29658	25 %	0 %	75 %	0 %	161830734
102	NC_010117	ACGA	2	8	30188	30195	50 %	0 %	25 %	25 %	161829965
103	NC_010117	CTTG	2	8	30295	30302	0 %	50 %	25 %	25 %	161829965
104	NC_010117	TCAC	2	8	30812	30819	25 %	25 %	0 %	50 %	161830612
105	NC_010117	TGGG	2	8	31316	31323	0 %	25 %	75 %	0 %	161830810
106	NC_010117	ACGC	2	8	31385	31392	25 %	0 %	25 %	50 %	161830810
107	NC_010117	TTGG	2	8	31862	31869	0 %	50 %	50 %	0 %	161830810
108	NC_010117	TGAA	2	8	32232	32239	50 %	25 %	25 %	0 %	161830810
109	NC_010117	ATTT	2	8	32917	32924	25 %	75 %	0 %	0 %	161831447
110	NC_010117	ACTT	2	8	33219	33226	25 %	50 %	0 %	25 %	161831447
111	NC_010117	ATCG	2	8	33400	33407	25 %	25 %	25 %	25 %	161831447
112	NC_010117	AAAT	2	8	33506	33513	75 %	25 %	0 %	0 %	161831447
113	NC_010117	AAAC	2	8	33756	33763	75 %	0 %	0 %	25 %	161831447
114	NC_010117	CAAA	2	8	34232	34239	75 %	0 %	0 %	25 %	161831447
115	NC_010117	AGTT	2	8	35460	35467	25 %	50 %	25 %	0 %	161829730
116	NC_010117	TGCG	2	8	35792	35799	0 %	25 %	50 %	25 %	161831565
117	NC_010117	GAGT	2	8	36184	36191	25 %	25 %	50 %	0 %	161830272
118	NC_010117	TATT	2	8	36567	36574	25 %	75 %	0 %	0 %	161830272
119	NC_010117	TTTC	2	8	37060	37067	0 %	75 %	0 %	25 %	161830272
120	NC_010117	TCAC	2	8	37800	37807	25 %	25 %	0 %	50 %	161830272
121	NC_010117	GTTT	2	8	40193	40200	0 %	75 %	25 %	0 %	161830478
122	NC_010117	AATT	2	8	40710	40717	50 %	50 %	0 %	0 %	161831332
123	NC_010117	ATTT	2	8	44903	44910	25 %	75 %	0 %	0 %	161829887
124	NC_010117	TTTA	2	8	44922	44929	25 %	75 %	0 %	0 %	161829887
125	NC_010117	CCGT	2	8	45024	45031	0 %	25 %	25 %	50 %	161829887
126	NC_010117	AGCG	2	8	45498	45505	25 %	0 %	50 %	25 %	161829887
127	NC_010117	AGAA	2	8	45573	45580	75 %	0 %	25 %	0 %	161829887
128	NC_010117	ATTT	2	8	47051	47058	25 %	75 %	0 %	0 %	161830620
129	NC_010117	GATT	2	8	47314	47321	25 %	50 %	25 %	0 %	161831125
130	NC_010117	CCAC	2	8	48422	48429	25 %	0 %	0 %	75 %	161830022
131	NC_010117	TGCG	2	8	49482	49489	0 %	25 %	50 %	25 %	161830022
132	NC_010117	TAAT	2	8	49840	49847	50 %	50 %	0 %	0 %	161831401
133	NC_010117	CGCC	2	8	50476	50483	0 %	0 %	25 %	75 %	161831401
134	NC_010117	TATT	2	8	51266	51273	25 %	75 %	0 %	0 %	161830390
135	NC_010117	TGGA	2	8	51472	51479	25 %	25 %	50 %	0 %	161830390
136	NC_010117	AAAG	2	8	51591	51598	75 %	0 %	25 %	0 %	161830390
137	NC_010117	ATTG	2	8	51696	51703	25 %	50 %	25 %	0 %	161830772
138	NC_010117	AAAG	2	8	53952	53959	75 %	0 %	25 %	0 %	161830314
139	NC_010117	GGTT	2	8	55145	55152	0 %	50 %	50 %	0 %	161830931
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