MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 26424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830473
2	NC_010117	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830473
3	NC_010117	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830473
4	NC_010117	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830473
5	NC_010117	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830473
6	NC_010117	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830473
7	NC_010117	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830473
8	NC_010117	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830473
9	NC_010117	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830473
10	NC_010117	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830473
11	NC_010117	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830473
12	NC_010117	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830473
13	NC_010117	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830473
14	NC_010117	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830473
15	NC_010117	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830473
16	NC_010117	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831398
17	NC_010117	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831398
18	NC_010117	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831398
19	NC_010117	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831398
20	NC_010117	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831398
21	NC_010117	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831398
22	NC_010117	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831398
23	NC_010117	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831398
24	NC_010117	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831398
25	NC_010117	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831398
26	NC_010117	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831398
27	NC_010117	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831398
28	NC_010117	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831398
29	NC_010117	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831398
30	NC_010117	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831398
31	NC_010117	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830866
32	NC_010117	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830866
33	NC_010117	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830866
34	NC_010117	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830866
35	NC_010117	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830866
36	NC_010117	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830866
37	NC_010117	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830866
38	NC_010117	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010117	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831267
40	NC_010117	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831267
41	NC_010117	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830408
42	NC_010117	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830408
43	NC_010117	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830408
44	NC_010117	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830408
45	NC_010117	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830408
46	NC_010117	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830408
47	NC_010117	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830408
48	NC_010117	CGG	2	6	4439	4444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830408
49	NC_010117	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830408
50	NC_010117	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830408
51	NC_010117	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830408
52	NC_010117	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830408
53	NC_010117	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830408
54	NC_010117	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830408
55	NC_010117	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830408
56	NC_010117	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830408
57	NC_010117	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830408
58	NC_010117	TGG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830408
59	NC_010117	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830408
60	NC_010117	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830408
61	NC_010117	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830408
62	NC_010117	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830408
63	NC_010117	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830408
64	NC_010117	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830408
65	NC_010117	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830408
66	NC_010117	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830408
67	NC_010117	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830408
68	NC_010117	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830408
69	NC_010117	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830408
70	NC_010117	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830408
71	NC_010117	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830408
72	NC_010117	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010117	TGA	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831254
74	NC_010117	GTG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831254
75	NC_010117	GGA	2	6	6945	6950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831254
76	NC_010117	GCA	2	6	7010	7015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831254
77	NC_010117	AAC	2	6	7123	7128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831254
78	NC_010117	GTT	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831254
79	NC_010117	GTG	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831254
80	NC_010117	TTG	2	6	7341	7346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831254
81	NC_010117	GAG	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831254
82	NC_010117	TCA	2	6	7487	7492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831254
83	NC_010117	ACA	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831254
84	NC_010117	AGG	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831254
85	NC_010117	TGT	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831254
86	NC_010117	CCG	2	6	7803	7808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830165
87	NC_010117	TGA	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830165
88	NC_010117	TCA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830165
89	NC_010117	TGG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830165
90	NC_010117	TCA	2	6	8031	8036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830165
91	NC_010117	TTG	2	6	8044	8049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830165
92	NC_010117	ACA	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830165
93	NC_010117	CAT	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010117	TAA	2	6	8191	8196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010117	GAC	2	6	8467	8472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831413
96	NC_010117	CGC	2	6	8559	8564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831413
97	NC_010117	ACT	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831413
98	NC_010117	CGG	2	6	8682	8687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831413
99	NC_010117	ATC	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831413
100	NC_010117	AGT	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831413
101	NC_010117	TTA	2	6	8882	8887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831413
102	NC_010117	TAA	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831413
103	NC_010117	GCC	2	6	8926	8931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831413
104	NC_010117	AAT	2	6	8954	8959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831413
105	NC_010117	ATG	2	6	8987	8992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831413
106	NC_010117	AGT	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831543
107	NC_010117	ATC	2	6	9107	9112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831543
108	NC_010117	CTA	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831543
109	NC_010117	TCT	2	6	9342	9347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831551
110	NC_010117	TGA	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831551
111	NC_010117	ATT	2	6	9489	9494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831551
112	NC_010117	ATT	2	6	9533	9538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831551
113	NC_010117	TAA	2	6	9547	9552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831551
114	NC_010117	AAT	2	6	9624	9629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831551
115	NC_010117	GAA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831551
116	NC_010117	ATA	2	6	9696	9701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831551
117	NC_010117	CCG	2	6	9831	9836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831551
118	NC_010117	TAA	2	6	9886	9891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831551
119	NC_010117	ATT	2	6	10038	10043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831551
120	NC_010117	TAA	2	6	10081	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831110
121	NC_010117	ATG	2	6	10211	10216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831110
122	NC_010117	CGC	2	6	10245	10250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831110
123	NC_010117	ATC	2	6	10339	10344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831110
124	NC_010117	ATA	2	6	10408	10413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831110
125	NC_010117	GAG	2	6	10602	10607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831110
126	NC_010117	CGA	2	6	10658	10663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831110
127	NC_010117	GCC	2	6	10786	10791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831110
128	NC_010117	TAC	2	6	10944	10949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831110
129	NC_010117	AAG	2	6	10982	10987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830543
130	NC_010117	ACC	2	6	11017	11022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830543
131	NC_010117	GAC	2	6	11032	11037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830543
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258	NC_010117	GAT	2	6	21474	21479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829805
259	NC_010117	GAA	2	6	21580	21585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829805
260	NC_010117	CTG	2	6	21710	21715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829805
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263	NC_010117	TCG	2	6	21875	21880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_010117	TGG	2	6	39544	39549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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