MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 5464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010117	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010117	CAT	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010117	TAA	2	6	8191	8196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010117	TAG	2	6	12387	12392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010117	AAT	2	6	12403	12408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010117	TAT	2	6	12513	12518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010117	ATC	2	6	18461	18466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010117	TTC	2	6	18846	18851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010117	TCT	2	6	18856	18861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010117	TAG	2	6	18873	18878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010117	GAG	2	6	18893	18898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010117	TTC	2	6	19095	19100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010117	TAG	2	6	19105	19110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010117	TTC	2	6	19350	19355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010117	CTA	2	6	19406	19411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010117	CAT	2	6	19482	19487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010117	TCT	2	6	19726	19731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010117	TTC	2	6	19776	19781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010117	TAG	2	6	20153	20158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010117	GAA	2	6	20315	20320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010117	TCG	2	6	20331	20336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010117	ATT	2	6	20342	20347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010117	AAT	2	6	20351	20356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010117	GGC	2	6	20475	20480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010117	CAT	2	6	21775	21780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010117	TCG	2	6	21875	21880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010117	AAG	2	6	21902	21907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010117	GTT	2	6	23304	23309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010117	TTC	2	6	23339	23344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010117	TAC	2	6	23347	23352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010117	GAC	2	6	23373	23378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010117	TTA	2	6	23481	23486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010117	GCA	2	6	24739	24744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010117	ATT	2	6	24817	24822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010117	GTG	2	6	24854	24859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010117	AGA	2	6	24942	24947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010117	AAT	2	6	24997	25002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010117	CGA	2	6	25101	25106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010117	ATT	2	6	25124	25129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010117	AGA	2	6	25155	25160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010117	CCT	2	6	25177	25182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010117	AAG	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010117	GCA	2	6	25381	25386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010117	GAA	2	6	25393	25398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010117	GAA	2	6	25408	25413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010117	TGA	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010117	CTC	2	6	25470	25475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010117	GTT	2	6	28673	28678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010117	TAA	2	6	28687	28692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010117	TAA	2	6	28699	28704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010117	GAA	2	6	28731	28736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010117	TTA	2	6	29753	29758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010117	ATT	2	6	29804	29809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010117	TAA	2	6	29833	29838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010117	AAC	2	6	29866	29871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010117	TGA	2	6	29878	29883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010117	TAA	2	6	29919	29924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010117	CAG	2	6	29931	29936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010117	ATA	2	6	30145	30150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010117	GAT	2	6	31232	31237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010117	TTG	2	6	32338	32343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010117	AAG	2	6	32353	32358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010117	AGG	2	6	32487	32492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010117	GTT	2	6	35752	35757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010117	GAT	2	6	35978	35983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010117	ATT	2	6	38181	38186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010117	TGT	2	6	38223	38228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010117	ATT	2	6	38263	38268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010117	ATA	3	9	38296	38304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010117	AAT	2	6	38467	38472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010117	TTG	2	6	38544	38549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010117	TCA	2	6	38609	38614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010117	GAG	2	6	38684	38689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010117	ATC	2	6	38704	38709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010117	CTC	2	6	38740	38745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010117	TCA	2	6	38775	38780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010117	CGG	2	6	38815	38820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010117	ATG	2	6	38987	38992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010117	TTC	2	6	39139	39144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010117	TTG	2	6	39417	39422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010117	AGA	2	6	39433	39438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010117	CAC	2	6	39452	39457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010117	TGG	2	6	39544	39549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010117	CAT	2	6	39557	39562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010117	AAG	2	6	39729	39734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010117	AAT	2	6	39777	39782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010117	TTG	2	6	39813	39818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010117	AAT	2	6	39864	39869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010117	TCC	2	6	39871	39876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010117	AAT	2	6	39915	39920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010117	CAC	2	6	40015	40020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010117	ATT	2	6	41838	41843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010117	AAT	2	6	41849	41854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010117	GAT	2	6	41966	41971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010117	CAA	2	6	42180	42185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010117	TCT	2	6	42271	42276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010117	CGA	2	6	42298	42303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010117	TAA	2	6	42309	42314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010117	ATC	2	6	42349	42354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010117	GAG	2	6	42362	42367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010117	TAA	2	6	42390	42395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010117	AGG	2	6	42564	42569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010117	GAT	2	6	42753	42758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010117	TAA	2	6	42930	42935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010117	AAT	2	6	43112	43117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010117	ATA	2	6	43224	43229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010117	CGC	2	6	43344	43349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010117	AGC	2	6	43435	43440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010117	TAA	2	6	43444	43449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010117	ACG	2	6	43506	43511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010117	GTT	2	6	43521	43526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010117	TTC	2	6	43597	43602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010117	CGA	3	9	43677	43685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010117	TTG	2	6	43702	43707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010117	TCA	2	6	43761	43766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010117	GAA	2	6	43770	43775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010117	ATA	2	6	43820	43825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010117	CTT	2	6	43926	43931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010117	TAT	2	6	45857	45862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010117	AAT	2	6	45870	45875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010117	ATT	2	6	45901	45906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010117	CAC	2	6	47144	47149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010117	TTA	2	6	47211	47216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010117	GAA	2	6	47284	47289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010117	CTT	2	6	47481	47486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010117	GAG	2	6	47492	47497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010117	TCG	2	6	47528	47533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010117	GTT	2	6	47651	47656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010117	TCC	2	6	47730	47735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010117	GTG	2	6	47771	47776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010117	GAC	2	6	47786	47791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010117	TAA	2	6	47849	47854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010117	ATT	2	6	47882	47887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010117	TAA	2	6	47915	47920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010117	TAA	2	6	48022	48027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010117	TCA	2	6	48138	48143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010117	TTG	2	6	48290	48295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010117	TAA	2	6	50889	50894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010117	AGG	2	6	50960	50965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_010117	CTG	2	6	203024	203029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_010117	GAG	2	6	203198	203203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
412	NC_010117	AAG	2	6	203224	203229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
413	NC_010117	TGT	2	6	203269	203274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
414	NC_010117	TAT	2	6	203391	203396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_010117	GGA	2	6	209903	209908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
429	NC_010117	ACG	2	6	210034	210039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_010117	TAT	2	6	210172	210177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_010117	ATT	2	6	216951	216956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_010117	CCT	2	6	216979	216984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_010117	TTG	2	6	219067	219072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_010117	CGT	2	6	219153	219158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_010117	TGA	2	6	219424	219429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_010117	AAT	2	6	219938	219943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010117	GGT	2	6	220107	220112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_010117	ATT	2	6	220148	220153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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