MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 2735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010117	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	161830473
2	NC_010117	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	161831398
3	NC_010117	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	161830866
4	NC_010117	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	161830866
5	NC_010117	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	161830408
6	NC_010117	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	161830408
7	NC_010117	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	161830408
8	NC_010117	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	161830408
9	NC_010117	TG	3	6	6832	6837	0 %	50 %	50 %	0 %	161831254
10	NC_010117	TG	3	6	7719	7724	0 %	50 %	50 %	0 %	161831254
11	NC_010117	AC	3	6	7838	7843	50 %	0 %	0 %	50 %	161830165
12	NC_010117	CG	3	6	10144	10149	0 %	0 %	50 %	50 %	161831110
13	NC_010117	CA	3	6	10282	10287	50 %	0 %	0 %	50 %	161831110
14	NC_010117	AT	3	6	11548	11553	50 %	50 %	0 %	0 %	161830543
15	NC_010117	TG	3	6	13835	13840	0 %	50 %	50 %	0 %	161831538
16	NC_010117	TA	4	8	14277	14284	50 %	50 %	0 %	0 %	161830348
17	NC_010117	CT	3	6	14412	14417	0 %	50 %	0 %	50 %	161831122
18	NC_010117	GA	3	6	14922	14927	50 %	0 %	50 %	0 %	161831122
19	NC_010117	TA	3	6	15044	15049	50 %	50 %	0 %	0 %	161831122
20	NC_010117	TC	3	6	15388	15393	0 %	50 %	0 %	50 %	161831122
21	NC_010117	TA	3	6	16466	16471	50 %	50 %	0 %	0 %	161831130
22	NC_010117	GC	3	6	17227	17232	0 %	0 %	50 %	50 %	161831015
23	NC_010117	CG	3	6	17435	17440	0 %	0 %	50 %	50 %	161831015
24	NC_010117	CG	3	6	17644	17649	0 %	0 %	50 %	50 %	161831015
25	NC_010117	TG	3	6	17929	17934	0 %	50 %	50 %	0 %	161830023
26	NC_010117	AG	3	6	19430	19435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010117	CT	3	6	19516	19521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010117	AG	3	6	23461	23466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010117	CA	3	6	24936	24941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010117	CT	3	6	25444	25449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010117	CA	3	6	26772	26777	50 %	0 %	0 %	50 %	161829860
32	NC_010117	GC	3	6	26786	26791	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
33	NC_010117	CG	3	6	26915	26920	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
34	NC_010117	GC	5	10	27068	27077	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
35	NC_010117	GC	3	6	27274	27279	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
36	NC_010117	CG	3	6	27623	27628	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
37	NC_010117	GT	3	6	29169	29174	0 %	50 %	50 %	0 %	161830734
38	NC_010117	GA	4	8	29975	29982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010117	AT	3	6	30112	30117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010117	GT	4	8	30473	30480	0 %	50 %	50 %	0 %	161829965
41	NC_010117	CG	3	6	30581	30586	0 %	0 %	50 %	50 %	161829965
42	NC_010117	GA	3	6	31171	31176	50 %	0 %	50 %	0 %	161830612
43	NC_010117	CG	3	6	31682	31687	0 %	0 %	50 %	50 %	161830810
44	NC_010117	GA	3	6	32545	32550	50 %	0 %	50 %	0 %	161831447
45	NC_010117	GC	3	6	35802	35807	0 %	0 %	50 %	50 %	161831565
46	NC_010117	GC	3	6	35813	35818	0 %	0 %	50 %	50 %	161831565
47	NC_010117	TC	3	6	39036	39041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010117	GC	4	8	42067	42074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010117	GC	3	6	43379	43384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010117	AT	3	6	43407	43412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010117	TC	3	6	44381	44386	0 %	50 %	0 %	50 %	161830606
52	NC_010117	GT	3	6	44450	44455	0 %	50 %	50 %	0 %	161830606
53	NC_010117	GT	3	6	45037	45042	0 %	50 %	50 %	0 %	161829887
54	NC_010117	GC	4	8	45342	45349	0 %	0 %	50 %	50 %	161829887
55	NC_010117	TA	3	6	45440	45445	50 %	50 %	0 %	0 %	161829887
56	NC_010117	CG	3	6	45733	45738	0 %	0 %	50 %	50 %	161830711
57	NC_010117	TG	3	6	45775	45780	0 %	50 %	50 %	0 %	161830711
58	NC_010117	GT	3	6	46050	46055	0 %	50 %	50 %	0 %	161830337
59	NC_010117	AG	3	6	47106	47111	50 %	0 %	50 %	0 %	161830620
60	NC_010117	GA	3	6	48241	48246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010117	TC	3	6	49314	49319	0 %	50 %	0 %	50 %	161830022
62	NC_010117	GC	3	6	50060	50065	0 %	0 %	50 %	50 %	161831401
63	NC_010117	GT	3	6	50169	50174	0 %	50 %	50 %	0 %	161831401
64	NC_010117	AG	3	6	52488	52493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010117	AT	3	6	52877	52882	50 %	50 %	0 %	0 %	161831230
66	NC_010117	TG	3	6	54295	54300	0 %	50 %	50 %	0 %	161830314
67	NC_010117	CG	3	6	55574	55579	0 %	0 %	50 %	50 %	161829984
68	NC_010117	AT	3	6	55754	55759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010117	CG	3	6	56606	56611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010117	CA	3	6	56992	56997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010117	TA	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010117	AG	3	6	58508	58513	50 %	0 %	50 %	0 %	161831059
73	NC_010117	CG	3	6	59299	59304	0 %	0 %	50 %	50 %	161831197
74	NC_010117	TC	3	6	60013	60018	0 %	50 %	0 %	50 %	161831197
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76	NC_010117	CG	3	6	61897	61902	0 %	0 %	50 %	50 %	161830271
77	NC_010117	AG	3	6	62581	62586	50 %	0 %	50 %	0 %	161830100
78	NC_010117	CT	3	6	62809	62814	0 %	50 %	0 %	50 %	161831469
79	NC_010117	CT	3	6	63741	63746	0 %	50 %	0 %	50 %	161830957
80	NC_010117	AT	3	6	63865	63870	50 %	50 %	0 %	0 %	161830957
81	NC_010117	AG	3	6	66466	66471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_010117	CG	3	6	68799	68804	0 %	0 %	50 %	50 %	161830731
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90	NC_010117	CA	3	6	74570	74575	50 %	0 %	0 %	50 %	161829818
91	NC_010117	GC	3	6	74766	74771	0 %	0 %	50 %	50 %	161829818
92	NC_010117	GC	3	6	75318	75323	0 %	0 %	50 %	50 %	161830232
93	NC_010117	CG	3	6	75501	75506	0 %	0 %	50 %	50 %	161830232
94	NC_010117	GC	3	6	75812	75817	0 %	0 %	50 %	50 %	161830232
95	NC_010117	TG	3	6	76865	76870	0 %	50 %	50 %	0 %	161829953
96	NC_010117	GC	3	6	77833	77838	0 %	0 %	50 %	50 %	161830649
97	NC_010117	AG	3	6	78173	78178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010117	GC	3	6	78233	78238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010117	CG	3	6	81229	81234	0 %	0 %	50 %	50 %	161830529
100	NC_010117	CG	3	6	81470	81475	0 %	0 %	50 %	50 %	161830529
101	NC_010117	AG	3	6	82700	82705	50 %	0 %	50 %	0 %	161831372
102	NC_010117	AT	3	6	82873	82878	50 %	50 %	0 %	0 %	161831372
103	NC_010117	CG	3	6	83507	83512	0 %	0 %	50 %	50 %	161831370
104	NC_010117	TA	3	6	83544	83549	50 %	50 %	0 %	0 %	161831370
105	NC_010117	GT	3	6	83914	83919	0 %	50 %	50 %	0 %	161831370
106	NC_010117	GC	3	6	84130	84135	0 %	0 %	50 %	50 %	161831370
107	NC_010117	GA	3	6	84396	84401	50 %	0 %	50 %	0 %	161831370
108	NC_010117	GC	4	8	89640	89647	0 %	0 %	50 %	50 %	161831274
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110	NC_010117	AT	3	6	90483	90488	50 %	50 %	0 %	0 %	161830827
111	NC_010117	TC	3	6	90501	90506	0 %	50 %	0 %	50 %	161830827
112	NC_010117	AT	3	6	90622	90627	50 %	50 %	0 %	0 %	161830385
113	NC_010117	TA	3	6	92030	92035	50 %	50 %	0 %	0 %	161829776
114	NC_010117	GT	3	6	94376	94381	0 %	50 %	50 %	0 %	161829772
115	NC_010117	GC	3	6	94886	94891	0 %	0 %	50 %	50 %	161829772
116	NC_010117	TC	3	6	94980	94985	0 %	50 %	0 %	50 %	161829772
117	NC_010117	CT	3	6	96090	96095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010117	GT	3	6	97071	97076	0 %	50 %	50 %	0 %	161831058
119	NC_010117	CG	3	6	97698	97703	0 %	0 %	50 %	50 %	161829992
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121	NC_010117	CG	3	6	98194	98199	0 %	0 %	50 %	50 %	161830625
122	NC_010117	TA	3	6	98746	98751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010117	GA	3	6	98785	98790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010117	GT	3	6	99068	99073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010117	AT	3	6	99196	99201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010117	TG	3	6	100250	100255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010117	AT	3	6	100372	100377	50 %	50 %	0 %	0 %	161830966
128	NC_010117	GC	3	6	100664	100669	0 %	0 %	50 %	50 %	161830966
129	NC_010117	AT	3	6	101281	101286	50 %	50 %	0 %	0 %	161831500
130	NC_010117	CA	3	6	101594	101599	50 %	0 %	0 %	50 %	161831500
131	NC_010117	CG	3	6	101890	101895	0 %	0 %	50 %	50 %	161831500
132	NC_010117	GA	3	6	102069	102074	50 %	0 %	50 %	0 %	161831500
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134	NC_010117	GC	3	6	102737	102742	0 %	0 %	50 %	50 %	161830748
135	NC_010117	GC	3	6	102969	102974	0 %	0 %	50 %	50 %	161830748
136	NC_010117	GC	3	6	104150	104155	0 %	0 %	50 %	50 %	161830069
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141	NC_010117	TC	3	6	107094	107099	0 %	50 %	0 %	50 %	161830579
142	NC_010117	TC	3	6	107158	107163	0 %	50 %	0 %	50 %	161830579
143	NC_010117	AT	3	6	107280	107285	50 %	50 %	0 %	0 %	161830579
144	NC_010117	AC	3	6	107654	107659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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