MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010115	CCATCA	2	12	866	877	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	161789069
2	NC_010115	TTCTCT	2	12	4691	4702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161789096
3	NC_010115	AACTAA	2	12	5662	5673	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	161789084
4	NC_010115	AGGAAG	2	12	6242	6253	50 %	0 %	50 %	0 %	161789093
5	NC_010115	GATAGT	3	18	8559	8576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161789104
6	NC_010115	ATTTAA	2	12	8756	8767	50 %	50 %	0 %	0 %	161789088
7	NC_010115	TCTTCA	2	12	10399	10410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161789065
8	NC_010115	GAATTC	2	12	11287	11298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161789085
9	NC_010115	GAAAGT	2	12	13154	13165	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161789097
10	NC_010115	TAATTT	2	12	13842	13853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010115	TGAGTC	2	12	14275	14286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161789094
12	NC_010115	TATTGC	2	12	23749	23760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161789092
13	NC_010115	CAATGG	2	12	27289	27300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010115	CATCAA	2	12	29886	29897	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	161789079
15	NC_010115	AATATG	2	12	34461	34472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.