Penta-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1
Total Repeats: 19
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_010115 | TCTTA | 2 | 10 | 1057 | 1066 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 161789069 |
2 | NC_010115 | TTAAC | 2 | 10 | 5687 | 5696 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 161789084 |
3 | NC_010115 | GAAAA | 2 | 10 | 7685 | 7694 | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 161789104 |
4 | NC_010115 | TCGGC | 2 | 10 | 9738 | 9747 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 161789065 |
5 | NC_010115 | TTTAA | 2 | 10 | 12104 | 12113 | 40 % | 60 % | 0 % | 0 % | 161789089 |
6 | NC_010115 | TTTAT | 2 | 10 | 13782 | 13791 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 161789102 |
7 | NC_010115 | CTTTT | 2 | 10 | 14726 | 14735 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 161789082 |
8 | NC_010115 | TGATT | 2 | 10 | 16954 | 16963 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 161789068 |
9 | NC_010115 | TTACG | 2 | 10 | 22327 | 22336 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 161789071 |
10 | NC_010115 | AAACA | 2 | 10 | 23832 | 23841 | 80 % | 0 % | 0 % | 20 % | 161789092 |
11 | NC_010115 | GAATG | 2 | 10 | 24342 | 24351 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 161789091 |
12 | NC_010115 | AGATT | 2 | 10 | 24757 | 24766 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 161789091 |
13 | NC_010115 | ATAAA | 2 | 10 | 25132 | 25141 | 80 % | 20 % | 0 % | 0 % | 161789091 |
14 | NC_010115 | TTGAA | 2 | 10 | 25201 | 25210 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 161789091 |
15 | NC_010115 | GAGCT | 2 | 10 | 25593 | 25602 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 161789076 |
16 | NC_010115 | GCCAC | 2 | 10 | 30228 | 30237 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 161789106 |
17 | NC_010115 | ATTTT | 2 | 10 | 31161 | 31170 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 161789106 |
18 | NC_010115 | AGTTA | 2 | 10 | 31291 | 31300 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 161789086 |
19 | NC_010115 | CAATG | 2 | 10 | 31947 | 31956 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 161789103 |