MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010115	CGAG	2	8	2216	2223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010115	AAAT	2	8	3309	3316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010115	CGAT	2	8	4415	4422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010115	TAAG	2	8	5001	5008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010115	GGAA	2	8	5094	5101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010115	TGAC	2	8	5205	5212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010115	AAAG	2	8	8666	8673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010115	AAGG	2	8	11001	11008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010115	ATTT	2	8	12491	12498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010115	ATTT	2	8	13214	13221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010115	GTTT	2	8	13493	13500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010115	GTCA	2	8	13529	13536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010115	TGGC	2	8	13615	13622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010115	CTTG	2	8	15475	15482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010115	CTTA	2	8	18264	18271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010115	AACT	2	8	18612	18619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010115	GTTG	2	8	19476	19483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010115	CAAA	2	8	19562	19569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010115	TGTT	2	8	26200	26207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010115	TTTA	2	8	26211	26218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010115	TAGT	2	8	26229	26236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010115	CAGG	2	8	26292	26299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010115	GGTA	2	8	27160	27167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010115	GCTG	2	8	27241	27248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010115	CAGG	2	8	27571	27578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010115	ATTT	2	8	31577	31584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010115	TCGA	2	8	31696	31703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010115	TCAT	2	8	31788	31795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010115	GCGA	2	8	32932	32939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010115	CCGT	2	8	33474	33481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010115	AATA	2	8	34199	34206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010115	GAAA	2	8	34290	34297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010115	AGGT	2	8	34794	34801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010115	GGCG	2	8	35291	35298	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010115	CCAT	2	8	36012	36019	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010115	GAAA	2	8	36166	36173	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010115	GGAT	2	8	37021	37028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010115	TCTA	2	8	37170	37177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010115	GCTC	2	8	37295	37302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.