MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010115	TA	3	6	181	186	50 %	50 %	0 %	0 %	161789077
2	NC_010115	AG	3	6	255	260	50 %	0 %	50 %	0 %	161789077
3	NC_010115	TG	3	6	2983	2988	0 %	50 %	50 %	0 %	161789105
4	NC_010115	AG	3	6	5896	5901	50 %	0 %	50 %	0 %	161789093
5	NC_010115	GC	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	161789104
6	NC_010115	AT	3	6	7175	7180	50 %	50 %	0 %	0 %	161789104
7	NC_010115	AG	3	6	7923	7928	50 %	0 %	50 %	0 %	161789104
8	NC_010115	AG	4	8	8490	8497	50 %	0 %	50 %	0 %	161789104
9	NC_010115	GC	3	6	9235	9240	0 %	0 %	50 %	50 %	161789088
10	NC_010115	GC	3	6	9767	9772	0 %	0 %	50 %	50 %	161789065
11	NC_010115	TC	3	6	11848	11853	0 %	50 %	0 %	50 %	161789089
12	NC_010115	TC	4	8	12478	12485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010115	GC	3	6	14051	14056	0 %	0 %	50 %	50 %	161789083
14	NC_010115	GC	3	6	14062	14067	0 %	0 %	50 %	50 %	161789083
15	NC_010115	TG	3	6	14244	14249	0 %	50 %	50 %	0 %	161789094
16	NC_010115	TG	3	6	15551	15556	0 %	50 %	50 %	0 %	161789068
17	NC_010115	GT	3	6	15755	15760	0 %	50 %	50 %	0 %	161789068
18	NC_010115	GA	4	8	16437	16444	50 %	0 %	50 %	0 %	161789068
19	NC_010115	CG	3	6	16862	16867	0 %	0 %	50 %	50 %	161789068
20	NC_010115	CT	3	6	17065	17070	0 %	50 %	0 %	50 %	161789068
21	NC_010115	AT	3	6	17416	17421	50 %	50 %	0 %	0 %	161789090
22	NC_010115	CT	3	6	17473	17478	0 %	50 %	0 %	50 %	161789090
23	NC_010115	AT	3	6	18778	18783	50 %	50 %	0 %	0 %	161789066
24	NC_010115	TA	4	8	19032	19039	50 %	50 %	0 %	0 %	161789107
25	NC_010115	AG	3	6	20066	20071	50 %	0 %	50 %	0 %	161789081
26	NC_010115	TC	3	6	20415	20420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010115	AT	3	6	20440	20445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010115	GC	3	6	21176	21181	0 %	0 %	50 %	50 %	161789072
29	NC_010115	GA	3	6	21347	21352	50 %	0 %	50 %	0 %	161789072
30	NC_010115	TG	3	6	22832	22837	0 %	50 %	50 %	0 %	161789071
31	NC_010115	GC	3	6	23916	23921	0 %	0 %	50 %	50 %	161789092
32	NC_010115	TG	3	6	23973	23978	0 %	50 %	50 %	0 %	161789092
33	NC_010115	GA	3	6	24732	24737	50 %	0 %	50 %	0 %	161789091
34	NC_010115	CG	3	6	25566	25571	0 %	0 %	50 %	50 %	161789076
35	NC_010115	CG	3	6	25917	25922	0 %	0 %	50 %	50 %	161789076
36	NC_010115	AT	4	8	26343	26350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010115	TA	4	8	26382	26389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010115	AT	3	6	26413	26418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010115	CA	3	6	26774	26779	50 %	0 %	0 %	50 %	161789074
40	NC_010115	TC	3	6	28196	28201	0 %	50 %	0 %	50 %	161789064
41	NC_010115	GT	3	6	28686	28691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010115	TG	3	6	30156	30161	0 %	50 %	50 %	0 %	161789106
43	NC_010115	AG	3	6	31127	31132	50 %	0 %	50 %	0 %	161789106
44	NC_010115	TA	3	6	32167	32172	50 %	50 %	0 %	0 %	161789103
45	NC_010115	GA	3	6	32296	32301	50 %	0 %	50 %	0 %	161789103
46	NC_010115	AT	3	6	32851	32856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010115	GA	3	6	33976	33981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010115	TC	3	6	34426	34431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010115	TA	3	6	34712	34717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010115	GC	3	6	35418	35423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010115	TG	3	6	36440	36445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.