MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010115	T	6	6	1787	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010115	A	6	6	2203	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010115	T	6	6	3098	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010115	A	6	6	3118	3123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010115	T	6	6	3357	3362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010115	A	6	6	4343	4348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010115	T	8	8	4462	4469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010115	T	6	6	4493	4498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010115	A	6	6	4893	4898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010115	A	8	8	4976	4983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010115	T	7	7	5185	5191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010115	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010115	A	7	7	6851	6857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010115	A	7	7	6874	6880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010115	A	6	6	8689	8694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010115	T	9	9	8738	8746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010115	T	7	7	10748	10754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010115	T	6	6	11047	11052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010115	A	7	7	12510	12516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010115	T	8	8	13406	13413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010115	T	6	6	13462	13467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010115	T	6	6	13470	13475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010115	T	7	7	13498	13504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010115	A	8	8	13881	13888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010115	A	7	7	18096	18102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010115	T	6	6	18222	18227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010115	A	8	8	18322	18329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010115	A	6	6	18535	18540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010115	A	6	6	19579	19584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010115	T	8	8	19612	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010115	T	7	7	19630	19636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010115	G	6	6	25424	25429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010115	A	6	6	27074	27079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010115	A	6	6	27214	27219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010115	A	6	6	27348	27353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010115	A	7	7	27403	27409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010115	A	6	6	28050	28055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010115	T	6	6	28068	28073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010115	T	6	6	28834	28839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010115	A	7	7	29976	29982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010115	T	7	7	29999	30005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010115	A	7	7	30060	30066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010115	T	6	6	31379	31384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010115	A	6	6	31446	31451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010115	A	7	7	32982	32988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010115	A	6	6	33007	33012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010115	T	6	6	33100	33105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010115	A	7	7	33837	33843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010115	A	6	6	34350	34355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010115	A	7	7	35408	35414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010115	A	7	7	35753	35759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010115	G	6	6	36729	36734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010115	A	6	6	37090	37095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010115	G	6	6	37178	37183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.