MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010115	T	8	8	429	436	0 %	100 %	0 %	0 %	161789069
2	NC_010115	T	6	6	1098	1103	0 %	100 %	0 %	0 %	161789069
3	NC_010115	A	7	7	1159	1165	100 %	0 %	0 %	0 %	161789069
4	NC_010115	T	6	6	1363	1368	0 %	100 %	0 %	0 %	161789069
5	NC_010115	A	6	6	1995	2000	100 %	0 %	0 %	0 %	161789101
6	NC_010115	T	7	7	3460	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	161789100
7	NC_010115	A	6	6	3686	3691	100 %	0 %	0 %	0 %	161789067
8	NC_010115	A	6	6	3844	3849	100 %	0 %	0 %	0 %	161789067
9	NC_010115	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	161789080
10	NC_010115	A	6	6	4226	4231	100 %	0 %	0 %	0 %	161789080
11	NC_010115	A	6	6	4652	4657	100 %	0 %	0 %	0 %	161789096
12	NC_010115	T	6	6	5607	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	161789084
13	NC_010115	A	6	6	5866	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	161789093
14	NC_010115	A	6	6	5966	5971	100 %	0 %	0 %	0 %	161789093
15	NC_010115	T	6	6	6641	6646	0 %	100 %	0 %	0 %	161789093
16	NC_010115	A	8	8	6695	6702	100 %	0 %	0 %	0 %	161789093
17	NC_010115	A	8	8	6962	6969	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
18	NC_010115	A	6	6	7043	7048	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
19	NC_010115	A	7	7	7076	7082	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
20	NC_010115	A	6	6	7181	7186	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
21	NC_010115	A	7	7	7395	7401	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
22	NC_010115	A	7	7	7691	7697	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
23	NC_010115	A	6	6	7996	8001	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
24	NC_010115	A	8	8	8085	8092	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
25	NC_010115	A	6	6	8145	8150	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
26	NC_010115	A	8	8	8171	8178	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
27	NC_010115	A	7	7	8307	8313	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
28	NC_010115	T	7	7	8857	8863	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
29	NC_010115	A	6	6	8893	8898	100 %	0 %	0 %	0 %	161789088
30	NC_010115	T	6	6	8932	8937	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
31	NC_010115	T	6	6	8995	9000	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
32	NC_010115	T	7	7	9133	9139	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
33	NC_010115	G	6	6	9535	9540	0 %	0 %	100 %	0 %	161789088
34	NC_010115	T	8	8	9593	9600	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
35	NC_010115	A	6	6	9730	9735	100 %	0 %	0 %	0 %	161789065
36	NC_010115	C	6	6	9791	9796	0 %	0 %	0 %	100 %	161789065
37	NC_010115	A	6	6	10372	10377	100 %	0 %	0 %	0 %	161789065
38	NC_010115	T	7	7	11642	11648	0 %	100 %	0 %	0 %	161789089
39	NC_010115	T	6	6	11705	11710	0 %	100 %	0 %	0 %	161789089
40	NC_010115	T	6	6	12254	12259	0 %	100 %	0 %	0 %	161789089
41	NC_010115	T	6	6	12683	12688	0 %	100 %	0 %	0 %	161789099
42	NC_010115	A	7	7	13752	13758	100 %	0 %	0 %	0 %	161789102
43	NC_010115	A	7	7	14103	14109	100 %	0 %	0 %	0 %	161789083
44	NC_010115	A	6	6	14261	14266	100 %	0 %	0 %	0 %	161789094
45	NC_010115	A	6	6	14304	14309	100 %	0 %	0 %	0 %	161789094
46	NC_010115	T	8	8	14732	14739	0 %	100 %	0 %	0 %	161789082
47	NC_010115	A	7	7	14895	14901	100 %	0 %	0 %	0 %	161789095
48	NC_010115	T	6	6	14976	14981	0 %	100 %	0 %	0 %	161789095
49	NC_010115	T	6	6	15373	15378	0 %	100 %	0 %	0 %	161789070
50	NC_010115	T	6	6	16236	16241	0 %	100 %	0 %	0 %	161789068
51	NC_010115	T	6	6	16370	16375	0 %	100 %	0 %	0 %	161789068
52	NC_010115	A	6	6	16652	16657	100 %	0 %	0 %	0 %	161789068
53	NC_010115	T	6	6	16946	16951	0 %	100 %	0 %	0 %	161789068
54	NC_010115	T	7	7	17197	17203	0 %	100 %	0 %	0 %	161789068
55	NC_010115	T	6	6	17257	17262	0 %	100 %	0 %	0 %	161789068
56	NC_010115	T	6	6	17621	17626	0 %	100 %	0 %	0 %	161789090
57	NC_010115	T	6	6	17681	17686	0 %	100 %	0 %	0 %	161789090
58	NC_010115	A	6	6	17867	17872	100 %	0 %	0 %	0 %	161789090
59	NC_010115	T	6	6	18647	18652	0 %	100 %	0 %	0 %	161789066
60	NC_010115	A	7	7	18653	18659	100 %	0 %	0 %	0 %	161789066
61	NC_010115	T	6	6	18859	18864	0 %	100 %	0 %	0 %	161789107
62	NC_010115	A	7	7	19071	19077	100 %	0 %	0 %	0 %	161789107
63	NC_010115	G	6	6	19162	19167	0 %	0 %	100 %	0 %	161789107
64	NC_010115	T	6	6	19769	19774	0 %	100 %	0 %	0 %	161789081
65	NC_010115	T	6	6	19921	19926	0 %	100 %	0 %	0 %	161789081
66	NC_010115	T	7	7	21151	21157	0 %	100 %	0 %	0 %	161789072
67	NC_010115	A	7	7	21691	21697	100 %	0 %	0 %	0 %	161789078
68	NC_010115	A	6	6	21738	21743	100 %	0 %	0 %	0 %	161789078
69	NC_010115	A	6	6	21757	21762	100 %	0 %	0 %	0 %	161789078
70	NC_010115	A	7	7	21942	21948	100 %	0 %	0 %	0 %	161789071
71	NC_010115	A	6	6	22080	22085	100 %	0 %	0 %	0 %	161789071
72	NC_010115	A	7	7	22228	22234	100 %	0 %	0 %	0 %	161789071
73	NC_010115	A	7	7	23099	23105	100 %	0 %	0 %	0 %	161789092
74	NC_010115	A	7	7	23657	23663	100 %	0 %	0 %	0 %	161789092
75	NC_010115	A	6	6	23731	23736	100 %	0 %	0 %	0 %	161789092
76	NC_010115	A	7	7	24376	24382	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
77	NC_010115	A	7	7	24660	24666	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
78	NC_010115	A	6	6	24777	24782	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
79	NC_010115	A	6	6	24799	24804	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
80	NC_010115	A	6	6	25311	25316	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
81	NC_010115	A	6	6	25713	25718	100 %	0 %	0 %	0 %	161789076
82	NC_010115	A	6	6	25776	25781	100 %	0 %	0 %	0 %	161789076
83	NC_010115	T	6	6	25905	25910	0 %	100 %	0 %	0 %	161789076
84	NC_010115	T	8	8	25974	25981	0 %	100 %	0 %	0 %	161789076
85	NC_010115	A	8	8	26807	26814	100 %	0 %	0 %	0 %	161789074
86	NC_010115	T	6	6	27752	27757	0 %	100 %	0 %	0 %	161789075
87	NC_010115	T	7	7	27821	27827	0 %	100 %	0 %	0 %	161789073
88	NC_010115	G	6	6	27921	27926	0 %	0 %	100 %	0 %	161789073
89	NC_010115	A	6	6	27990	27995	100 %	0 %	0 %	0 %	161789073
90	NC_010115	A	6	6	28478	28483	100 %	0 %	0 %	0 %	161789064
91	NC_010115	T	6	6	28515	28520	0 %	100 %	0 %	0 %	161789064
92	NC_010115	A	9	9	28929	28937	100 %	0 %	0 %	0 %	161789079
93	NC_010115	T	6	6	29101	29106	0 %	100 %	0 %	0 %	161789079
94	NC_010115	A	6	6	29525	29530	100 %	0 %	0 %	0 %	161789079
95	NC_010115	A	7	7	29622	29628	100 %	0 %	0 %	0 %	161789079
96	NC_010115	A	6	6	30283	30288	100 %	0 %	0 %	0 %	161789106
97	NC_010115	T	6	6	30542	30547	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
98	NC_010115	T	6	6	30684	30689	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
99	NC_010115	A	6	6	31064	31069	100 %	0 %	0 %	0 %	161789106
100	NC_010115	T	8	8	31167	31174	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
101	NC_010115	A	6	6	31270	31275	100 %	0 %	0 %	0 %	161789086
102	NC_010115	A	6	6	32184	32189	100 %	0 %	0 %	0 %	161789103

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.