MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella canis ATCC 23365 chromosome I

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010103	CCAGT	2	10	15679	15688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010103	CATGC	2	10	26938	26947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010103	CATGC	2	10	28353	28362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010103	CGAAA	2	10	28551	28560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010103	CGGAG	2	10	31529	31538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010103	CCGTG	2	10	40683	40692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010103	TAAAG	2	10	50830	50839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010103	TGAAA	2	10	51863	51872	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010103	CGGAG	2	10	72762	72771	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010103	GGCGC	2	10	74000	74009	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010103	GATGC	2	10	76012	76021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010103	AAATA	2	10	78894	78903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010103	AAGGC	2	10	83529	83538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010103	TCTGG	2	10	83674	83683	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010103	TCGAT	2	10	89252	89261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010103	TTCCA	2	10	95528	95537	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010103	CGGTT	2	10	95900	95909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010103	GAACC	2	10	95952	95961	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010103	GCACC	2	10	106836	106845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010103	TTTGT	2	10	107329	107338	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010103	ATGGA	2	10	122877	122886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010103	GCACG	2	10	146975	146984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010103	CGAAC	2	10	147271	147280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010103	GCTTC	2	10	147319	147328	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010103	CGAAG	2	10	147456	147465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010103	CAATG	2	10	148696	148705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010103	CGCGC	2	10	148710	148719	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_010103	ACAGC	2	10	162479	162488	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010103	CGGAG	2	10	165814	165823	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010103	ACAAA	2	10	165881	165890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010103	CTGCC	2	10	170445	170454	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010103	TGAAA	2	10	171817	171826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010103	CGTGT	2	10	172714	172723	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010103	TTTTA	2	10	174521	174530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010103	TGAAT	2	10	185302	185311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010103	AAAGC	2	10	196421	196430	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010103	TTTCG	2	10	217062	217071	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010103	CTTGG	2	10	228090	228099	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010103	GGCAG	2	10	233468	233477	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010103	GGGGC	2	10	269662	269671	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010103	ATTCT	2	10	288938	288947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010103	TGGCT	2	10	305584	305593	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010103	AAAAG	2	10	311557	311566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010103	GTTTC	2	10	321478	321487	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010103	CAGCT	2	10	327088	327097	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010103	TCTTT	2	10	330909	330918	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010103	CGTGG	2	10	347338	347347	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010103	GCGCA	2	10	350353	350362	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010103	GCCTG	2	10	386289	386298	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010103	ACGCG	2	10	386303	386312	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010103	CCGGC	2	10	386323	386332	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_010103	ACAAA	2	10	390126	390135	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010103	ACGGC	2	10	397204	397213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010103	GGCCC	2	10	397373	397382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_010103	CGAAA	2	10	404001	404010	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010103	CCGGG	2	10	405095	405104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010103	ACAAA	2	10	405306	405315	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010103	GAAAA	2	10	413330	413339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010103	AGGCT	2	10	422071	422080	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010103	GGGTT	2	10	427878	427887	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010103	AATGT	2	10	427955	427964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010103	AAAAG	2	10	432528	432537	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010103	ACCGC	2	10	433658	433667	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_010103	GTTTT	2	10	433679	433688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010103	AACGC	2	10	451528	451537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_010103	GCCCG	2	10	452098	452107	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_010103	GCGTT	2	10	452491	452500	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010103	CCTGT	2	10	452850	452859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010103	GATGT	2	10	460067	460076	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010103	CGGCA	2	10	468617	468626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_010103	AGGGC	2	10	475947	475956	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010103	TGCCG	2	10	476008	476017	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010103	CGGAA	2	10	484564	484573	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010103	TTTTA	2	10	485277	485286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010103	ACAGG	2	10	494418	494427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010103	TGCGC	2	10	503315	503324	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010103	CCGCA	2	10	515024	515033	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_010103	TGCCA	2	10	520658	520667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010103	TGCGA	2	10	523457	523466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010103	AGTTT	2	10	545387	545396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010103	ATAGT	2	10	545514	545523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010103	TTTGC	2	10	559636	559645	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010103	AAAGA	2	10	559659	559668	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010103	ACTGA	2	10	564061	564070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010103	TGGGC	2	10	568553	568562	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010103	CGGGC	2	10	587938	587947	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_010103	CGGGC	2	10	589454	589463	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010103	AGGCG	2	10	589534	589543	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010103	GGGCA	2	10	589655	589664	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010103	TGCCA	2	10	590048	590057	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010103	TTGGA	2	10	590481	590490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010103	TAAAA	2	10	617039	617048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010103	GAACG	2	10	623797	623806	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010103	ACCGG	2	10	625522	625531	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_010103	TTTGC	2	10	628081	628090	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010103	TCCTA	2	10	644893	644902	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_010103	TCCGC	2	10	645928	645937	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_010103	GCAAG	2	10	660507	660516	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010103	ACAAA	2	10	693883	693892	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010103	AAGAT	2	10	701176	701185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010103	CAAAG	2	10	701746	701755	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010103	TCTTT	2	10	704488	704497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010103	ACATT	2	10	715556	715565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010103	CATGC	2	10	730645	730654	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_010103	GGCAA	2	10	732744	732753	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010103	ACAAA	2	10	742037	742046	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010103	CAAGA	2	10	742065	742074	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010103	ATGCC	2	10	748832	748841	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_010103	TTTGT	2	10	759665	759674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010103	GAAAA	2	10	761420	761429	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010103	ACAAA	2	10	761552	761561	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010103	CTTGT	2	10	766833	766842	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010103	CAAAG	2	10	768022	768031	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010103	CTTGA	2	10	771146	771155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010103	ATGCC	2	10	777505	777514	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010103	ATTGG	2	10	786491	786500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010103	GTAAA	2	10	807392	807401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010103	TGAAG	2	10	818293	818302	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010103	AGCGA	2	10	820933	820942	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010103	CCTGC	2	10	829226	829235	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_010103	ATCAG	2	10	834249	834258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010103	GATGA	2	10	834477	834486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010103	CGATT	2	10	837166	837175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010103	GAGCT	2	10	841703	841712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010103	GGGCA	2	10	843478	843487	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010103	GACAG	2	10	846319	846328	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010103	GTGAT	2	10	910048	910057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010103	GACAG	2	10	910214	910223	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010103	GGTGC	2	10	916916	916925	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010103	CATCT	2	10	926173	926182	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010103	CCGTT	2	10	926759	926768	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010103	TTGCC	2	10	927598	927607	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010103	GCAGG	2	10	935454	935463	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010103	TTCCT	2	10	942234	942243	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010103	CGCTG	2	10	942269	942278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010103	TTGCG	2	10	978874	978883	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010103	TGCAG	2	10	978894	978903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010103	AAATA	2	10	984267	984276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010103	ATGAA	2	10	994093	994102	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010103	ACAAA	2	10	995957	995966	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010103	ACAAA	2	10	1000860	1000869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010103	TCGGT	2	10	1008307	1008316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010103	CGTGG	2	10	1014870	1014879	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010103	AGGGC	2	10	1021092	1021101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010103	AAAAG	2	10	1025446	1025455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010103	AAAAT	2	10	1025629	1025638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_010103	ACTCA	2	10	1859734	1859743	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_010103	ATTAT	2	10	1934413	1934422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010103	ACCAA	2	10	1935665	1935674	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_010103	GTTTG	2	10	2069754	2069763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010103	GCCAA	2	10	2073670	2073679	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
286	NC_010103	GAACA	2	10	2078162	2078171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_010103	ACAAA	2	10	2083557	2083566	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_010103	CCTGT	2	10	2084391	2084400	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_010103	TGTGC	2	10	2087532	2087541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_010103	CCCGG	2	10	2089150	2089159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
291	NC_010103	ACCCG	2	10	2089538	2089547	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
292	NC_010103	CGGAT	2	10	2089563	2089572	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
293	NC_010103	GGCTT	2	10	2100123	2100132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
294	NC_010103	GGATG	2	10	2105206	2105215	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.