MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 chromosome 3

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010087	CGATCG	2	12	12498	12509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010087	CGACGC	2	12	85148	85159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010087	AGCGCG	2	12	108143	108154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010087	AACGGA	2	12	110586	110597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010087	AGAACG	2	12	122999	123010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010087	GAAGGA	2	12	126720	126731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010087	CGTCGC	2	12	162084	162095	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010087	GCGGCC	2	12	226607	226618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010087	CCTTGA	2	12	236300	236311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010087	CGGGCG	2	12	246941	246952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010087	GGTGAG	2	12	258805	258816	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010087	CGTGAA	2	12	286651	286662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010087	CCGGCG	2	12	290953	290964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010087	CCTATC	2	12	329653	329664	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010087	TGATCG	2	12	334839	334850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010087	GAACCG	2	12	372470	372481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010087	GCCGAT	2	12	380874	380885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010087	ACCAGA	2	12	399287	399298	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010087	AACGAG	2	12	401325	401336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010087	CCCCAG	2	12	404437	404448	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010087	GCGCCG	2	12	411510	411521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010087	CGTATG	2	12	459414	459425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010087	GATGGC	2	12	461700	461711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010087	TGCCGA	2	12	461815	461826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010087	GCTGTC	2	12	481970	481981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010087	CGAGCA	2	12	574084	574095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010087	CCTCGT	2	12	577047	577058	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010087	TTTCAC	2	12	628820	628831	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010087	CGCTGG	2	12	637793	637804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010087	GCCCTC	2	12	678139	678150	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010087	TTCTGA	2	12	692335	692346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010087	CGGTTT	2	12	697076	697087	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010087	TGCGCC	2	12	702985	702996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010087	CGCGCC	2	12	705114	705125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010087	ACGGCG	2	12	745887	745898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010087	CCGGCG	2	12	746814	746825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010087	GCAGGC	2	12	790485	790496	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010087	ACGCGA	2	12	800104	800115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010087	TCGCGA	2	12	805962	805973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010087	GACGAG	2	12	810733	810744	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010087	AGGGGC	2	12	817844	817855	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010087	TGCGGA	2	12	820382	820393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010087	GCCGAA	2	12	822712	822723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010087	CGGCGC	2	12	824134	824145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010087	GTTCGG	3	18	828889	828906	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010087	CTTGAG	2	12	837360	837371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010087	AAGCGC	2	12	838274	838285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010087	GAACCA	2	12	839849	839860	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010087	GCCGCA	2	12	885767	885778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010087	CGCTCG	2	12	890748	890759	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010087	CCTCAT	2	12	891448	891459	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.