MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 chromosome 3

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010087	GTCCC	2	10	2855	2864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_010087	CCCCG	2	10	5278	5287	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_010087	ACGCG	2	10	7082	7091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010087	CGGGC	2	10	7890	7899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010087	CCGCC	2	10	12484	12493	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_010087	CGGCC	2	10	13373	13382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_010087	CGGGC	2	10	13393	13402	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010087	AGGCC	2	10	18376	18385	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010087	TGCGA	2	10	19884	19893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010087	TCGTG	2	10	22045	22054	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010087	GGGAG	2	10	23654	23663	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010087	CTCAT	2	10	25653	25662	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010087	GCAAC	2	10	26140	26149	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010087	GCGCG	2	10	33186	33195	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010087	GCGGA	2	10	61136	61145	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010087	GACGC	2	10	67638	67647	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010087	ACGAA	2	10	69929	69938	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010087	CCGCG	2	10	82998	83007	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_010087	GCGCC	2	10	91566	91575	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010087	ACGGA	2	10	94333	94342	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010087	CGCGC	2	10	95874	95883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_010087	CGCGG	2	10	107766	107775	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010087	GCCGG	2	10	108646	108655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010087	GCGCA	2	10	110713	110722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010087	ACGGC	2	10	111802	111811	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_010087	CGGCA	2	10	117561	117570	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010087	CCGCG	2	10	127773	127782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_010087	GGCCC	2	10	131303	131312	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_010087	CGGCA	2	10	131430	131439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_010087	GCCGC	2	10	131483	131492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_010087	GACGC	2	10	153211	153220	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010087	GGCGT	2	10	153253	153262	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010087	GCGCC	2	10	155095	155104	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_010087	GCACG	2	10	155796	155805	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010087	CGCGC	2	10	164153	164162	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_010087	CCCCG	2	10	176200	176209	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_010087	GCACG	2	10	178129	178138	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010087	AACGC	2	10	196347	196356	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010087	CGGCG	2	10	196392	196401	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010087	GCGAG	2	10	202282	202291	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010087	CCGGA	2	10	218247	218256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010087	GCCGC	2	10	221579	221588	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_010087	CGGCG	2	10	223692	223701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010087	CGCGC	2	10	223807	223816	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010087	CGCGC	2	10	226595	226604	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_010087	ACAAA	2	10	232326	232335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010087	CGACG	2	10	233733	233742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010087	CTTTC	2	10	235661	235670	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010087	TTGGG	2	10	235841	235850	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010087	TGCGT	2	10	238053	238062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010087	CGTTG	2	10	238065	238074	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010087	GCAGG	2	10	238834	238843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010087	CGCGG	2	10	244648	244657	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010087	GCCGC	2	10	249677	249686	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_010087	AGTAT	2	10	251404	251413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010087	CTGCG	2	10	257533	257542	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010087	CGTCT	2	10	257841	257850	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_010087	AATAA	2	10	275759	275768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010087	TCGGC	2	10	281788	281797	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_010087	ACGGA	2	10	281839	281848	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010087	CGACG	2	10	286711	286720	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010087	CGCCA	2	10	291267	291276	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_010087	TCCGT	2	10	294056	294065	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010087	GGGCG	2	10	298686	298695	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010087	CCGCA	2	10	302107	302116	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_010087	TTTCA	2	10	311262	311271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010087	ACGGA	2	10	327175	327184	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010087	GCGCC	2	10	343932	343941	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_010087	GGCGC	2	10	348730	348739	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_010087	GACTG	2	10	350712	350721	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_010087	GCTGA	2	10	354875	354884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010087	AAAGG	2	10	362587	362596	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010087	GCGGG	2	10	364492	364501	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010087	GCGCC	2	10	367831	367840	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_010087	CACTA	2	10	369122	369131	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010087	AATCA	2	10	369731	369740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010087	TTTCC	2	10	369940	369949	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010087	TTGCT	2	10	372882	372891	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010087	CCATC	2	10	374166	374175	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_010087	CGACG	2	10	380323	380332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010087	GAACA	2	10	385761	385770	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010087	TTGCG	2	10	399734	399743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010087	GCGCG	2	10	400652	400661	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010087	TCGGC	2	10	401683	401692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010087	ACGGA	2	10	401734	401743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010087	CGGCG	2	10	409444	409453	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_010087	AAGGA	2	10	411216	411225	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010087	TAGTG	2	10	431859	431868	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010087	GCGCC	2	10	437696	437705	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_010087	GGCCG	2	10	440739	440748	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010087	CAGCT	2	10	440817	440826	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010087	GAGCC	2	10	442780	442789	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010087	TACGG	2	10	442805	442814	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010087	GCGCC	2	10	449852	449861	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_010087	CAGCG	2	10	458959	458968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_010087	ACCGC	2	10	459017	459026	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_010087	GGGCC	2	10	459126	459135	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010087	GGCGC	2	10	459157	459166	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010087	ACCTC	2	10	461455	461464	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_010087	GCCGC	2	10	463813	463822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_010087	CCCCA	2	10	465248	465257	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
102	NC_010087	CGAGC	2	10	473141	473150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010087	TCGGC	2	10	473224	473233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010087	CCACA	2	10	474582	474591	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_010087	CGGGC	2	10	478826	478835	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_010087	GCGCG	2	10	481678	481687	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010087	GCGCG	2	10	493779	493788	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010087	TCGAT	2	10	502985	502994	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010087	GGTCG	2	10	510511	510520	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010087	CCCAT	2	10	521451	521460	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_010087	GCGCC	2	10	529367	529376	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_010087	TGCAA	2	10	532778	532787	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010087	TTCAA	2	10	535233	535242	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010087	AGCGC	2	10	543406	543415	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010087	GCCGT	2	10	544515	544524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010087	AGCGC	2	10	544590	544599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010087	GCATC	2	10	552912	552921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010087	CACCG	2	10	562594	562603	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_010087	CGACG	2	10	573614	573623	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010087	TTGCT	2	10	574175	574184	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010087	GCAAG	2	10	631871	631880	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010087	CGCCC	2	10	631886	631895	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_010087	CGGCC	2	10	639695	639704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_010087	GCGCG	2	10	650971	650980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010087	ACCGG	2	10	652854	652863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010087	TTGCC	2	10	664678	664687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010087	TCATC	2	10	668026	668035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010087	TCCAG	2	10	674457	674466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010087	GCCCG	2	10	678221	678230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_010087	CGCGG	2	10	692489	692498	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010087	GCATG	2	10	696901	696910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010087	TCAGT	2	10	696921	696930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010087	CGCGA	2	10	699273	699282	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010087	GCGAC	2	10	699387	699396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010087	CGACG	2	10	702917	702926	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010087	CCGGC	2	10	703319	703328	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_010087	CGCTT	2	10	714095	714104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_010087	TGCAT	2	10	736158	736167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010087	CGTGT	2	10	754328	754337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010087	CGCGC	2	10	758374	758383	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_010087	GCGCG	2	10	764880	764889	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010087	CCCAC	2	10	769114	769123	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
143	NC_010087	CGCTT	2	10	784220	784229	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010087	CGGCG	2	10	794508	794517	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_010087	CGCAA	2	10	795497	795506	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010087	GCGCC	2	10	800127	800136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_010087	CCCTG	2	10	811982	811991	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_010087	TGCGA	2	10	820294	820303	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010087	CACCC	2	10	838894	838903	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
150	NC_010087	TCCCT	2	10	840770	840779	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
151	NC_010087	GCCGC	2	10	851221	851230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_010087	ATCGA	2	10	855322	855331	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010087	ACAAA	2	10	867146	867155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_010087	GCCGC	2	10	883166	883175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
155	NC_010087	TCGCG	2	10	885722	885731	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_010087	CGCTG	2	10	889380	889389	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_010087	CGCGG	2	10	889697	889706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
158	NC_010087	TCACT	2	10	891004	891013	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
159	NC_010087	ACGGT	2	10	891238	891247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_010087	CAGTG	2	10	891888	891897	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_010087	ACCGG	2	10	901739	901748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_010087	GCGTC	2	10	908954	908963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_010087	TGCGT	2	10	913860	913869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_010087	CCACC	2	10	914883	914892	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
165	NC_010087	CGGAA	2	10	918448	918457	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_010087	AGCCG	2	10	919473	919482	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.