MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	TCATAT	2	12	12308	12319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010085	CCTAAA	2	12	23661	23672	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010085	ATCTCT	2	12	60031	60042	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010085	AAAATT	2	12	62669	62680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010085	TTCCAT	2	12	88145	88156	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010085	CTAATC	2	12	147804	147815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010085	ATTTTT	2	12	148331	148342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010085	TTTAGT	2	12	152920	152931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010085	ATTTTT	2	12	210020	210031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010085	TTAAAT	2	12	288888	288899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010085	TAATTC	2	12	294230	294241	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010085	TGGTCT	2	12	324693	324704	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010085	CTAATT	2	12	369498	369509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010085	GATATA	2	12	416190	416201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010085	TTATAT	2	12	417256	417267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010085	CTTCCT	2	12	419911	419922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010085	CTTAGC	2	12	510028	510039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010085	TGACTA	2	12	530605	530616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010085	TTATTT	2	12	539071	539082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010085	TTATTT	2	12	539162	539173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010085	TTGAAT	2	12	569688	569699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010085	CAGAAC	2	12	582863	582874	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010085	GAACCA	2	12	582883	582894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010085	GAACCA	2	12	582901	582912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010085	GAACCA	2	12	582919	582930	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010085	GAACCA	2	12	582937	582948	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010085	GAACCA	2	12	582955	582966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010085	GAACCA	2	12	582973	582984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010085	GAACCA	2	12	582991	583002	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010085	GAACCA	2	12	583009	583020	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010085	GAACCA	2	12	583027	583038	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010085	GAACCA	2	12	583045	583056	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010085	GAACCA	2	12	583063	583074	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010085	GAACCA	2	12	583081	583092	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010085	GAACCA	2	12	583099	583110	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010085	GAACCA	2	12	583117	583128	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010085	GAACCA	2	12	583135	583146	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010085	GAACCA	2	12	583153	583164	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010085	GAACCA	2	12	583171	583182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010085	GAACCA	2	12	583189	583200	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010085	ATTAGT	2	12	606440	606451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010085	ACTAAA	2	12	639478	639489	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010085	TTTTTA	2	12	666025	666036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010085	GTTTTA	2	12	666075	666086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010085	AATACA	2	12	670533	670544	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010085	TTTTGT	2	12	688732	688743	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010085	TTTTGA	2	12	705745	705756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010085	ATTGTA	2	12	715462	715473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010085	CAACTA	2	12	725302	725313	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010085	TATTGT	2	12	727883	727894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010085	TCTAAT	2	12	757471	757482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010085	AAAACA	2	12	856040	856051	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010085	ACAAAA	2	12	859592	859603	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010085	AAACAA	2	12	860146	860157	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010085	TAAGAT	2	12	875974	875985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010085	CCCATT	2	12	888980	888991	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010085	CACAAG	2	12	893900	893911	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010085	ACCGGC	2	12	894135	894146	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010085	TTATTT	2	12	906564	906575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010085	TAATCA	2	12	1033238	1033249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010085	ATGGGA	2	12	1036620	1036631	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010085	ACAAAC	2	12	1090048	1090059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010085	ATAGCA	2	12	1091930	1091941	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010085	AAAAGA	2	12	1154561	1154572	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010085	TGTGTT	2	12	1226099	1226110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010085	ATGGGA	2	12	1237778	1237789	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010085	ATTTTC	2	12	1247717	1247728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010085	ACATTC	2	12	1260005	1260016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010085	TAGAAA	2	12	1281935	1281946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010085	GAAAAG	2	12	1367219	1367230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010085	CCTTTT	2	12	1369906	1369917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010085	AATGAA	2	12	1370942	1370953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010085	GATTTT	2	12	1486933	1486944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010085	ATTGTG	2	12	1519966	1519977	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010085	GTTTTT	2	12	1539248	1539259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010085	ATTCCA	2	12	1569058	1569069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010085	TGCATA	2	12	1569072	1569083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010085	TTCACC	2	12	1571583	1571594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010085	TTTCTT	2	12	1612136	1612147	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.