MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 1625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	AAACT	2	10	57	66	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010085	CTATT	2	10	74	83	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010085	AGAGG	2	10	826	835	40 %	0 %	60 %	0 %	161527513
4	NC_010085	TTGTG	2	10	2838	2847	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010085	ATTTT	2	10	3148	3157	20 %	80 %	0 %	0 %	161527515
6	NC_010085	CAAAT	2	10	3595	3604	60 %	20 %	0 %	20 %	161527516
7	NC_010085	TTAGG	2	10	4043	4052	20 %	40 %	40 %	0 %	161527516
8	NC_010085	GAAAA	2	10	4142	4151	80 %	0 %	20 %	0 %	161527516
9	NC_010085	ACATT	2	10	4229	4238	40 %	40 %	0 %	20 %	161527516
10	NC_010085	AAACT	2	10	7157	7166	60 %	20 %	0 %	20 %	161527519
11	NC_010085	TGTCT	2	10	8337	8346	0 %	60 %	20 %	20 %	161527520
12	NC_010085	AGATA	2	10	11109	11118	60 %	20 %	20 %	0 %	161527523
13	NC_010085	CAAAA	2	10	12238	12247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010085	GTAAA	2	10	13342	13351	60 %	20 %	20 %	0 %	161527525
15	NC_010085	TTTTG	2	10	13424	13433	0 %	80 %	20 %	0 %	161527525
16	NC_010085	ATAAA	2	10	13742	13751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010085	AAGAT	2	10	15022	15031	60 %	20 %	20 %	0 %	161527529
18	NC_010085	CTTTT	2	10	15238	15247	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010085	CAATA	2	10	15408	15417	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010085	GTGAT	2	10	16126	16135	20 %	40 %	40 %	0 %	161527531
21	NC_010085	AAAAG	2	10	17456	17465	80 %	0 %	20 %	0 %	161527532
22	NC_010085	ATTCA	2	10	17526	17535	40 %	40 %	0 %	20 %	161527532
23	NC_010085	CATTC	2	10	21953	21962	20 %	40 %	0 %	40 %	161527538
24	NC_010085	CTATA	2	10	22714	22723	40 %	40 %	0 %	20 %	161527539
25	NC_010085	TGTTA	2	10	24346	24355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010085	ACTAT	2	10	25316	25325	40 %	40 %	0 %	20 %	161527542
27	NC_010085	GAATT	2	10	25427	25436	40 %	40 %	20 %	0 %	161527542
28	NC_010085	GTTCT	2	10	26733	26742	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010085	TATAC	2	10	26994	27003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010085	AAATT	2	10	27822	27831	60 %	40 %	0 %	0 %	161527546
31	NC_010085	TTTTG	2	10	30590	30599	0 %	80 %	20 %	0 %	161527552
32	NC_010085	TTTTG	2	10	32060	32069	0 %	80 %	20 %	0 %	161527553
33	NC_010085	CCAAA	2	10	32104	32113	60 %	0 %	0 %	40 %	161527553
34	NC_010085	AATCA	2	10	32698	32707	60 %	20 %	0 %	20 %	161527554
35	NC_010085	AAAAC	2	10	34166	34175	80 %	0 %	0 %	20 %	161527556
36	NC_010085	AAAAG	2	10	34269	34278	80 %	0 %	20 %	0 %	161527556
37	NC_010085	CAAAT	2	10	36730	36739	60 %	20 %	0 %	20 %	161527559
38	NC_010085	ATTCT	2	10	37111	37120	20 %	60 %	0 %	20 %	161527560
39	NC_010085	GTATC	2	10	37622	37631	20 %	40 %	20 %	20 %	161527560
40	NC_010085	TGTTC	2	10	37802	37811	0 %	60 %	20 %	20 %	161527560
41	NC_010085	ATTTT	2	10	38165	38174	20 %	80 %	0 %	0 %	161527560
42	NC_010085	CTCAA	2	10	38338	38347	40 %	20 %	0 %	40 %	161527561
43	NC_010085	ATGGA	2	10	40702	40711	40 %	20 %	40 %	0 %	161527563
44	NC_010085	TTGAT	2	10	41259	41268	20 %	60 %	20 %	0 %	161527564
45	NC_010085	ATCAA	2	10	42913	42922	60 %	20 %	0 %	20 %	161527566
46	NC_010085	TGTTT	2	10	43787	43796	0 %	80 %	20 %	0 %	161527567
47	NC_010085	ATCAT	2	10	44046	44055	40 %	40 %	0 %	20 %	161527567
48	NC_010085	AATTC	2	10	45000	45009	40 %	40 %	0 %	20 %	161527567
49	NC_010085	ATGCC	2	10	45016	45025	20 %	20 %	20 %	40 %	161527567
50	NC_010085	GATTT	2	10	47962	47971	20 %	60 %	20 %	0 %	161527572
51	NC_010085	TTTTA	2	10	49256	49265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010085	TCTCT	2	10	49689	49698	0 %	60 %	0 %	40 %	161527574
53	NC_010085	AGAAT	2	10	50625	50634	60 %	20 %	20 %	0 %	161527575
54	NC_010085	ATTTC	2	10	51468	51477	20 %	60 %	0 %	20 %	161527575
55	NC_010085	TTCTC	2	10	51905	51914	0 %	60 %	0 %	40 %	161527575
56	NC_010085	CAGAT	2	10	57133	57142	40 %	20 %	20 %	20 %	161527579
57	NC_010085	TTTTA	2	10	58194	58203	20 %	80 %	0 %	0 %	161527580
58	NC_010085	AAATC	2	10	59150	59159	60 %	20 %	0 %	20 %	161527581
59	NC_010085	ACTAA	2	10	59661	59670	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010085	GAAAA	2	10	61356	61365	80 %	0 %	20 %	0 %	161527584
61	NC_010085	AACTA	2	10	61460	61469	60 %	20 %	0 %	20 %	161527584
62	NC_010085	GATAA	2	10	62146	62155	60 %	20 %	20 %	0 %	161527585
63	NC_010085	GAATG	2	10	62936	62945	40 %	20 %	40 %	0 %	161527587
64	NC_010085	TCTAA	2	10	64049	64058	40 %	40 %	0 %	20 %	161527587
65	NC_010085	TATCA	2	10	64686	64695	40 %	40 %	0 %	20 %	161527587
66	NC_010085	AAATA	2	10	68615	68624	80 %	20 %	0 %	0 %	161527593
67	NC_010085	GTAAT	2	10	68823	68832	40 %	40 %	20 %	0 %	161527593
68	NC_010085	AGGTA	2	10	71242	71251	40 %	20 %	40 %	0 %	161527595
69	NC_010085	TAAAA	2	10	71432	71441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010085	TCAAG	2	10	75008	75017	40 %	20 %	20 %	20 %	161527600
71	NC_010085	ATTTG	2	10	75818	75827	20 %	60 %	20 %	0 %	161527600
72	NC_010085	TCTCT	2	10	77155	77164	0 %	60 %	0 %	40 %	161527600
73	NC_010085	AATTT	2	10	78645	78654	40 %	60 %	0 %	0 %	161527601
74	NC_010085	TTGAC	2	10	78871	78880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010085	GAAAA	2	10	79620	79629	80 %	0 %	20 %	0 %	161527602
76	NC_010085	ACTAA	2	10	81567	81576	60 %	20 %	0 %	20 %	161527605
77	NC_010085	AAAAT	2	10	84149	84158	80 %	20 %	0 %	0 %	161527607
78	NC_010085	ACAAT	2	10	84305	84314	60 %	20 %	0 %	20 %	161527607
79	NC_010085	AATCC	2	10	88658	88667	40 %	20 %	0 %	40 %	161527611
80	NC_010085	TATTC	2	10	89017	89026	20 %	60 %	0 %	20 %	161527611
81	NC_010085	TTTTG	2	10	90812	90821	0 %	80 %	20 %	0 %	161527612
82	NC_010085	TACTT	2	10	91187	91196	20 %	60 %	0 %	20 %	161527612
83	NC_010085	TCCAT	2	10	91964	91973	20 %	40 %	0 %	40 %	161527613
84	NC_010085	GTAAT	2	10	94093	94102	40 %	40 %	20 %	0 %	161527614
85	NC_010085	TTGGA	2	10	95140	95149	20 %	40 %	40 %	0 %	161527616
86	NC_010085	ATTTC	2	10	95433	95442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010085	TAAAA	2	10	97601	97610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010085	ATCTA	2	10	97635	97644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010085	CATTC	2	10	97895	97904	20 %	40 %	0 %	40 %	161527619
90	NC_010085	ATTTG	2	10	99397	99406	20 %	60 %	20 %	0 %	161527621
91	NC_010085	AAATT	2	10	100220	100229	60 %	40 %	0 %	0 %	161527621
92	NC_010085	AGTTT	2	10	100283	100292	20 %	60 %	20 %	0 %	161527622
93	NC_010085	AATCA	2	10	103610	103619	60 %	20 %	0 %	20 %	161527627
94	NC_010085	TCAAT	2	10	105841	105850	40 %	40 %	0 %	20 %	161527629
95	NC_010085	TAATT	2	10	107702	107711	40 %	60 %	0 %	0 %	161527630
96	NC_010085	CTAAT	2	10	108111	108120	40 %	40 %	0 %	20 %	161527630
97	NC_010085	TTGTA	2	10	108456	108465	20 %	60 %	20 %	0 %	161527631
98	NC_010085	CCTCT	2	10	109836	109845	0 %	40 %	0 %	60 %	161527632
99	NC_010085	AATTT	2	10	109881	109890	40 %	60 %	0 %	0 %	161527632
100	NC_010085	AAATA	2	10	110038	110047	80 %	20 %	0 %	0 %	161527632
101	NC_010085	ATTTT	2	10	110445	110454	20 %	80 %	0 %	0 %	161527632
102	NC_010085	TTTTA	2	10	112067	112076	20 %	80 %	0 %	0 %	161527634
103	NC_010085	TGGGA	2	10	112588	112597	20 %	20 %	60 %	0 %	161527634
104	NC_010085	ATTCC	2	10	112831	112840	20 %	40 %	0 %	40 %	161527635
105	NC_010085	AATAG	2	10	115251	115260	60 %	20 %	20 %	0 %	161527637
106	NC_010085	CCATT	2	10	118058	118067	20 %	40 %	0 %	40 %	161527639
107	NC_010085	AATGT	2	10	119064	119073	40 %	40 %	20 %	0 %	161527639
108	NC_010085	TTAAA	2	10	119855	119864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010085	AAATT	2	10	120378	120387	60 %	40 %	0 %	0 %	161527642
110	NC_010085	AATGC	2	10	121381	121390	40 %	20 %	20 %	20 %	161527643
111	NC_010085	ACTTT	2	10	121551	121560	20 %	60 %	0 %	20 %	161527643
112	NC_010085	TTCAA	2	10	121717	121726	40 %	40 %	0 %	20 %	161527643
113	NC_010085	TTTAA	2	10	123465	123474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010085	TAAAA	2	10	123545	123554	80 %	20 %	0 %	0 %	161527646
115	NC_010085	CCTTT	2	10	124853	124862	0 %	60 %	0 %	40 %	161527648
116	NC_010085	CATCC	2	10	124910	124919	20 %	20 %	0 %	60 %	161527648
117	NC_010085	ATGTG	2	10	125627	125636	20 %	40 %	40 %	0 %	161527648
118	NC_010085	AACAA	2	10	125992	126001	80 %	0 %	0 %	20 %	161527649
119	NC_010085	AATTT	2	10	126011	126020	40 %	60 %	0 %	0 %	161527649
120	NC_010085	TGGTA	2	10	126260	126269	20 %	40 %	40 %	0 %	161527649
121	NC_010085	AATGG	2	10	126856	126865	40 %	20 %	40 %	0 %	161527649
122	NC_010085	ATTTA	2	10	127204	127213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010085	ATTTT	2	10	128226	128235	20 %	80 %	0 %	0 %	161527651
124	NC_010085	AATTA	2	10	128618	128627	60 %	40 %	0 %	0 %	161527651
125	NC_010085	TAAAA	2	10	128759	128768	80 %	20 %	0 %	0 %	161527651
126	NC_010085	AATTA	2	10	129684	129693	60 %	40 %	0 %	0 %	161527652
127	NC_010085	ATTTT	2	10	130683	130692	20 %	80 %	0 %	0 %	161527653
128	NC_010085	GATTG	2	10	131368	131377	20 %	40 %	40 %	0 %	161527653
129	NC_010085	ATTTC	2	10	135430	135439	20 %	60 %	0 %	20 %	161527659
130	NC_010085	TAAAT	2	10	135833	135842	60 %	40 %	0 %	0 %	161527659
131	NC_010085	AAAAT	2	10	136255	136264	80 %	20 %	0 %	0 %	161527659
132	NC_010085	AATTC	2	10	137172	137181	40 %	40 %	0 %	20 %	161527660
133	NC_010085	TGAAG	2	10	138655	138664	40 %	20 %	40 %	0 %	161527661
134	NC_010085	TCAAT	2	10	140316	140325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010085	AATGT	2	10	141265	141274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010085	CAAGA	2	10	141778	141787	60 %	0 %	20 %	20 %	161527663
137	NC_010085	CAATG	2	10	145479	145488	40 %	20 %	20 %	20 %	161527665
138	NC_010085	TCTTT	2	10	145964	145973	0 %	80 %	0 %	20 %	161527666
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