MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 4378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	ACTA	2	8	34	41	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010085	TAAT	2	8	46	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010085	CTTG	2	8	1434	1441	0 %	50 %	25 %	25 %	161527514
4	NC_010085	ATCA	2	8	1892	1899	50 %	25 %	0 %	25 %	161527514
5	NC_010085	AAAT	2	8	2002	2009	75 %	25 %	0 %	0 %	161527514
6	NC_010085	TTGT	2	8	2139	2146	0 %	75 %	25 %	0 %	161527514
7	NC_010085	ACAT	2	8	2367	2374	50 %	25 %	0 %	25 %	161527514
8	NC_010085	GTCT	2	8	2434	2441	0 %	50 %	25 %	25 %	161527514
9	NC_010085	GGAT	2	8	2561	2568	25 %	25 %	50 %	0 %	161527514
10	NC_010085	TTGA	2	8	2603	2610	25 %	50 %	25 %	0 %	161527514
11	NC_010085	TTAA	2	8	2791	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010085	GTTT	2	8	3062	3069	0 %	75 %	25 %	0 %	161527515
13	NC_010085	TTCC	2	8	4442	4449	0 %	50 %	0 %	50 %	161527517
14	NC_010085	ATCA	2	8	4632	4639	50 %	25 %	0 %	25 %	161527517
15	NC_010085	ATCT	2	8	4796	4803	25 %	50 %	0 %	25 %	161527517
16	NC_010085	TCTG	2	8	5089	5096	0 %	50 %	25 %	25 %	161527518
17	NC_010085	ATTA	2	8	5384	5391	50 %	50 %	0 %	0 %	161527518
18	NC_010085	CAAA	2	8	6278	6285	75 %	0 %	0 %	25 %	161527519
19	NC_010085	GGCT	2	8	6356	6363	0 %	25 %	50 %	25 %	161527519
20	NC_010085	TAAC	2	8	6594	6601	50 %	25 %	0 %	25 %	161527519
21	NC_010085	AAAT	2	8	7053	7060	75 %	25 %	0 %	0 %	161527519
22	NC_010085	ATTC	2	8	7367	7374	25 %	50 %	0 %	25 %	161527520
23	NC_010085	TTTG	2	8	7704	7711	0 %	75 %	25 %	0 %	161527520
24	NC_010085	TCAT	2	8	8151	8158	25 %	50 %	0 %	25 %	161527520
25	NC_010085	ACTA	2	8	8405	8412	50 %	25 %	0 %	25 %	161527520
26	NC_010085	CTGA	2	8	8675	8682	25 %	25 %	25 %	25 %	161527521
27	NC_010085	TGAT	2	8	8747	8754	25 %	50 %	25 %	0 %	161527521
28	NC_010085	TTGA	2	8	8964	8971	25 %	50 %	25 %	0 %	161527521
29	NC_010085	TGCT	2	8	9244	9251	0 %	50 %	25 %	25 %	161527521
30	NC_010085	AGTT	2	8	9815	9822	25 %	50 %	25 %	0 %	161527522
31	NC_010085	TCAA	2	8	10676	10683	50 %	25 %	0 %	25 %	161527523
32	NC_010085	GATG	2	8	10800	10807	25 %	25 %	50 %	0 %	161527523
33	NC_010085	CAAA	2	8	10995	11002	75 %	0 %	0 %	25 %	161527523
34	NC_010085	ATTG	2	8	11382	11389	25 %	50 %	25 %	0 %	161527523
35	NC_010085	CTTT	2	8	12279	12286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010085	CAAT	2	8	12298	12305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010085	TGAA	2	8	12659	12666	50 %	25 %	25 %	0 %	161527524
38	NC_010085	GACT	2	8	12892	12899	25 %	25 %	25 %	25 %	161527525
39	NC_010085	TTTC	2	8	13024	13031	0 %	75 %	0 %	25 %	161527525
40	NC_010085	TGAA	2	8	13334	13341	50 %	25 %	25 %	0 %	161527525
41	NC_010085	TCTT	2	8	13372	13379	0 %	75 %	0 %	25 %	161527525
42	NC_010085	CTTG	2	8	13527	13534	0 %	50 %	25 %	25 %	161527525
43	NC_010085	ACAA	2	8	13794	13801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010085	GTTT	2	8	14226	14233	0 %	75 %	25 %	0 %	161527527
45	NC_010085	CATT	2	8	14345	14352	25 %	50 %	0 %	25 %	161527527
46	NC_010085	TCTT	2	8	15865	15872	0 %	75 %	0 %	25 %	161527531
47	NC_010085	CTTC	2	8	16030	16037	0 %	50 %	0 %	50 %	161527531
48	NC_010085	AATG	2	8	16167	16174	50 %	25 %	25 %	0 %	161527531
49	NC_010085	GTAA	2	8	16892	16899	50 %	25 %	25 %	0 %	161527532
50	NC_010085	AGCA	2	8	17439	17446	50 %	0 %	25 %	25 %	161527532
51	NC_010085	CATC	2	8	18286	18293	25 %	25 %	0 %	50 %	161527533
52	NC_010085	ACAA	2	8	18417	18424	75 %	0 %	0 %	25 %	161527533
53	NC_010085	ATAC	2	8	18475	18482	50 %	25 %	0 %	25 %	161527533
54	NC_010085	GAAT	2	8	18595	18602	50 %	25 %	25 %	0 %	161527533
55	NC_010085	AAGA	2	8	19052	19059	75 %	0 %	25 %	0 %	161527533
56	NC_010085	ATTA	2	8	19493	19500	50 %	50 %	0 %	0 %	161527534
57	NC_010085	CAAA	2	8	20416	20423	75 %	0 %	0 %	25 %	161527535
58	NC_010085	ATTA	2	8	21864	21871	50 %	50 %	0 %	0 %	161527538
59	NC_010085	TACA	2	8	22829	22836	50 %	25 %	0 %	25 %	161527539
60	NC_010085	AAAT	2	8	22988	22995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010085	CTCA	2	8	23541	23548	25 %	25 %	0 %	50 %	161527540
62	NC_010085	GATT	2	8	23585	23592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010085	CAAG	2	8	23904	23911	50 %	0 %	25 %	25 %	161527541
64	NC_010085	GCAG	2	8	25035	25042	25 %	0 %	50 %	25 %	161527542
65	NC_010085	GAAA	2	8	25161	25168	75 %	0 %	25 %	0 %	161527542
66	NC_010085	TGGA	2	8	25359	25366	25 %	25 %	50 %	0 %	161527542
67	NC_010085	ACAG	2	8	26720	26727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010085	ATTG	2	8	26986	26993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010085	GAAT	2	8	27780	27787	50 %	25 %	25 %	0 %	161527546
70	NC_010085	AAGA	2	8	28165	28172	75 %	0 %	25 %	0 %	161527546
71	NC_010085	AATA	2	8	28915	28922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010085	TCAA	2	8	29481	29488	50 %	25 %	0 %	25 %	161527549
73	NC_010085	CCAA	2	8	29533	29540	50 %	0 %	0 %	50 %	161527549
74	NC_010085	TATG	2	8	30144	30151	25 %	50 %	25 %	0 %	161527550
75	NC_010085	GATT	2	8	30499	30506	25 %	50 %	25 %	0 %	161527551
76	NC_010085	CTTT	2	8	30718	30725	0 %	75 %	0 %	25 %	161527552
77	NC_010085	CTTT	2	8	30727	30734	0 %	75 %	0 %	25 %	161527552
78	NC_010085	TTGA	2	8	30824	30831	25 %	50 %	25 %	0 %	161527552
79	NC_010085	TCTT	2	8	31009	31016	0 %	75 %	0 %	25 %	161527552
80	NC_010085	TTGA	2	8	31509	31516	25 %	50 %	25 %	0 %	161527553
81	NC_010085	CTGT	2	8	31590	31597	0 %	50 %	25 %	25 %	161527553
82	NC_010085	CTTT	2	8	31606	31613	0 %	75 %	0 %	25 %	161527553
83	NC_010085	TCTG	2	8	32938	32945	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010085	AATT	2	8	33009	33016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010085	TTTC	2	8	33203	33210	0 %	75 %	0 %	25 %	161527555
86	NC_010085	AACA	2	8	33685	33692	75 %	0 %	0 %	25 %	161527555
87	NC_010085	TGGA	2	8	33699	33706	25 %	25 %	50 %	0 %	161527555
88	NC_010085	ATCT	2	8	34454	34461	25 %	50 %	0 %	25 %	161527556
89	NC_010085	ATCT	2	8	35150	35157	25 %	50 %	0 %	25 %	161527557
90	NC_010085	GTAT	2	8	35257	35264	25 %	50 %	25 %	0 %	161527557
91	NC_010085	TTCT	2	8	35445	35452	0 %	75 %	0 %	25 %	161527558
92	NC_010085	ACAA	2	8	35518	35525	75 %	0 %	0 %	25 %	161527558
93	NC_010085	CATC	2	8	35544	35551	25 %	25 %	0 %	50 %	161527558
94	NC_010085	GAAA	2	8	36173	36180	75 %	0 %	25 %	0 %	161527559
95	NC_010085	ATTT	2	8	37498	37505	25 %	75 %	0 %	0 %	161527560
96	NC_010085	TGAT	2	8	37705	37712	25 %	50 %	25 %	0 %	161527560
97	NC_010085	TCAT	2	8	38213	38220	25 %	50 %	0 %	25 %	161527560
98	NC_010085	TCCA	2	8	38678	38685	25 %	25 %	0 %	50 %	161527561
99	NC_010085	GATG	2	8	38710	38717	25 %	25 %	50 %	0 %	161527561
100	NC_010085	TCAA	2	8	39047	39054	50 %	25 %	0 %	25 %	161527562
101	NC_010085	AAAC	2	8	39542	39549	75 %	0 %	0 %	25 %	161527562
102	NC_010085	TGGA	2	8	39571	39578	25 %	25 %	50 %	0 %	161527562
103	NC_010085	GAAA	2	8	39687	39694	75 %	0 %	25 %	0 %	161527562
104	NC_010085	TACA	2	8	40006	40013	50 %	25 %	0 %	25 %	161527562
105	NC_010085	TCAA	2	8	40183	40190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010085	ATTA	2	8	40283	40290	50 %	50 %	0 %	0 %	161527563
107	NC_010085	TTTC	2	8	40761	40768	0 %	75 %	0 %	25 %	161527563
108	NC_010085	CTAA	2	8	40851	40858	50 %	25 %	0 %	25 %	161527563
109	NC_010085	TACA	2	8	40902	40909	50 %	25 %	0 %	25 %	161527564
110	NC_010085	CATA	2	8	40947	40954	50 %	25 %	0 %	25 %	161527564
111	NC_010085	AATC	2	8	41550	41557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010085	ATCT	2	8	41694	41701	25 %	50 %	0 %	25 %	161527565
113	NC_010085	TTTC	2	8	41741	41748	0 %	75 %	0 %	25 %	161527565
114	NC_010085	ACAA	2	8	42014	42021	75 %	0 %	0 %	25 %	161527565
115	NC_010085	CTAG	2	8	42041	42048	25 %	25 %	25 %	25 %	161527565
116	NC_010085	CAAA	2	8	42504	42511	75 %	0 %	0 %	25 %	161527565
117	NC_010085	TTCT	2	8	42552	42559	0 %	75 %	0 %	25 %	161527565
118	NC_010085	TTAA	2	8	42584	42591	50 %	50 %	0 %	0 %	161527565
119	NC_010085	AATT	2	8	42768	42775	50 %	50 %	0 %	0 %	161527566
120	NC_010085	ATCA	2	8	42840	42847	50 %	25 %	0 %	25 %	161527566
121	NC_010085	AATA	2	8	43035	43042	75 %	25 %	0 %	0 %	161527566
122	NC_010085	AAAC	2	8	43521	43528	75 %	0 %	0 %	25 %	161527567
123	NC_010085	TTCA	2	8	43544	43551	25 %	50 %	0 %	25 %	161527567
124	NC_010085	ATTG	2	8	43896	43903	25 %	50 %	25 %	0 %	161527567
125	NC_010085	AAAC	2	8	44698	44705	75 %	0 %	0 %	25 %	161527567
126	NC_010085	TGAG	2	8	45268	45275	25 %	25 %	50 %	0 %	161527568
127	NC_010085	CAGA	2	8	45481	45488	50 %	0 %	25 %	25 %	161527568
128	NC_010085	GTTG	2	8	46986	46993	0 %	50 %	50 %	0 %	161527571
129	NC_010085	AACT	2	8	47335	47342	50 %	25 %	0 %	25 %	161527571
130	NC_010085	TTGT	2	8	47827	47834	0 %	75 %	25 %	0 %	161527572
131	NC_010085	AAAT	2	8	47846	47853	75 %	25 %	0 %	0 %	161527572
132	NC_010085	AAAC	2	8	48693	48700	75 %	0 %	0 %	25 %	161527573
133	NC_010085	TGCA	2	8	49563	49570	25 %	25 %	25 %	25 %	161527574
134	NC_010085	TTGC	2	8	50156	50163	0 %	50 %	25 %	25 %	161527574
135	NC_010085	ATGA	2	8	50211	50218	50 %	25 %	25 %	0 %	161527574
136	NC_010085	TGAG	2	8	50947	50954	25 %	25 %	50 %	0 %	161527575
137	NC_010085	TCCA	2	8	51029	51036	25 %	25 %	0 %	50 %	161527575
138	NC_010085	TGCA	2	8	51100	51107	25 %	25 %	25 %	25 %	161527575
139	NC_010085	AACC	2	8	51117	51124	50 %	0 %	0 %	50 %	161527575
140	NC_010085	GATT	2	8	51557	51564	25 %	50 %	25 %	0 %	161527575
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142	NC_010085	AAAC	2	8	52401	52408	75 %	0 %	0 %	25 %	161527576
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