MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	ACTA	2	8	34	41	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010085	TAAT	2	8	46	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010085	TTAA	2	8	2791	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010085	CTTT	2	8	12279	12286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010085	CAAT	2	8	12298	12305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010085	ACAA	2	8	13794	13801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010085	AAAT	2	8	22988	22995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010085	GATT	2	8	23585	23592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010085	ACAG	2	8	26720	26727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010085	ATTG	2	8	26986	26993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010085	AATA	2	8	28915	28922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010085	TCTG	2	8	32938	32945	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010085	AATT	2	8	33009	33016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010085	TCAA	2	8	40183	40190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010085	AATC	2	8	41550	41557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010085	ATTA	2	8	59690	59697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010085	CTAA	2	8	66408	66415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010085	TAAA	2	8	66447	66454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010085	TATT	2	8	74559	74566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010085	TTTA	2	8	78784	78791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010085	AGTT	2	8	82618	82625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010085	TGAT	2	8	88159	88166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010085	TTAA	2	8	91533	91540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010085	CTCC	2	8	95342	95349	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_010085	TGAA	2	8	100702	100709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010085	GCCT	2	8	100830	100837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010085	TTGT	2	8	108225	108232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010085	TAAT	2	8	113726	113733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010085	ATCT	2	8	116039	116046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010085	ATTC	2	8	116225	116232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010085	GAAT	2	8	140339	140346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010085	GTTT	2	8	140350	140357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010085	ACTA	2	8	140365	140372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010085	TCAT	2	8	141100	141107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010085	CAAT	2	8	141128	141135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010085	AATT	2	8	141468	141475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010085	TGAT	2	8	141502	141509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010085	CAAA	2	8	147879	147886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010085	GTTT	2	8	151973	151980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010085	ATTA	2	8	152006	152013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010085	CATT	2	8	166054	166061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010085	CAAT	2	8	178059	178066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010085	CATT	2	8	181272	181279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010085	CAAA	2	8	188675	188682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010085	TCCC	2	8	188783	188790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_010085	ATTA	2	8	189783	189790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010085	AATA	2	8	190653	190660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010085	AACT	2	8	203725	203732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010085	AATT	2	8	207052	207059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010085	AATC	2	8	207148	207155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010085	GATC	2	8	211918	211925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010085	TTTG	2	8	217697	217704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010085	CTAA	2	8	217857	217864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010085	TGAT	2	8	223918	223925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010085	TAAA	2	8	225527	225534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010085	GAAA	2	8	235123	235130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010085	ATAA	2	8	236923	236930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010085	AAAT	2	8	239595	239602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010085	TTAA	2	8	255078	255085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010085	GATT	2	8	255115	255122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010085	ATTT	2	8	256748	256755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010085	GAAT	2	8	256769	256776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010085	AATA	2	8	259538	259545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010085	ATGG	2	8	262737	262744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010085	GTAT	2	8	264263	264270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010085	TTGA	2	8	264588	264595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010085	CGAT	2	8	265227	265234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010085	CTAT	2	8	278359	278366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010085	TTTC	2	8	297387	297394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010085	GCGT	2	8	319834	319841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010085	GAAA	2	8	321895	321902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010085	ATTT	2	8	324729	324736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010085	AACT	2	8	326450	326457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010085	AAAT	2	8	328415	328422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010085	ACTA	2	8	328626	328633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010085	AACA	2	8	329516	329523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010085	TTGA	2	8	329627	329634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010085	TGTA	2	8	329659	329666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010085	TGCC	2	8	336322	336329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010085	CATT	2	8	337366	337373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010085	ATCA	2	8	343725	343732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010085	AATT	2	8	347172	347179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010085	CAAA	2	8	347728	347735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010085	AATA	2	8	352116	352123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010085	ATCC	2	8	352311	352318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010085	AAAT	2	8	355941	355948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010085	ATGA	2	8	356614	356621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010085	TCCC	2	8	366479	366486	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_010085	CTAG	2	8	383013	383020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010085	TCTT	2	8	383443	383450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010085	AATT	2	8	389882	389889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010085	TAAA	2	8	391081	391088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010085	ATAA	2	8	412340	412347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010085	ATTG	2	8	414226	414233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010085	ATTA	2	8	414460	414467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010085	ATTA	2	8	414477	414484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010085	TTGT	2	8	414634	414641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010085	ATTG	2	8	414838	414845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010085	TCAA	2	8	418069	418076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010085	AATC	2	8	425593	425600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010085	TTCC	2	8	427250	427257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010085	TTTG	2	8	432813	432820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010085	TTTG	2	8	454494	454501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010085	TGAT	2	8	454612	454619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010085	TCTA	2	8	468668	468675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010085	TTCT	2	8	469278	469285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010085	GATT	2	8	471385	471392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010085	ACAA	2	8	473414	473421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010085	TTGA	2	8	476101	476108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010085	CAAA	2	8	482379	482386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010085	TAAT	2	8	482550	482557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010085	TGAT	2	8	491261	491268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010085	ATGT	2	8	500546	500553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010085	TAAA	2	8	500672	500679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010085	TAAT	2	8	502207	502214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010085	GTTC	2	8	504854	504861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010085	TCCA	2	8	510717	510724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010085	TTGA	2	8	510950	510957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010085	ATTA	2	8	511830	511837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010085	TCTT	2	8	513088	513095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010085	TCAT	2	8	520265	520272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010085	GATG	2	8	525606	525613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010085	TGTA	2	8	526796	526803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010085	TCAA	2	8	533575	533582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010085	GAAA	2	8	533588	533595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010085	AATT	2	8	539148	539155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010085	TTGT	2	8	539259	539266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010085	TAAT	2	8	552872	552879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010085	ATTA	2	8	552931	552938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010085	ATCT	2	8	563124	563131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010085	TCTA	2	8	563594	563601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010085	GGAG	2	8	569619	569626	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010085	ATGA	2	8	570381	570388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010085	TTGT	2	8	570751	570758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010085	GTTT	2	8	578954	578961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010085	TATT	2	8	580381	580388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010085	TAGG	2	8	588062	588069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010085	TTTG	2	8	594474	594481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010085	TAAT	2	8	595199	595206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010085	TGTA	2	8	599740	599747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010085	ATTA	2	8	606413	606420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010085	TAAT	2	8	606570	606577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010085	AGTT	2	8	610686	610693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010085	ATTA	2	8	614230	614237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010085	GATT	2	8	616733	616740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010085	CAAA	2	8	617727	617734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010085	CAAC	2	8	623893	623900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010085	TTGT	2	8	625239	625246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010085	CTGA	2	8	625254	625261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010085	AGTG	2	8	628071	628078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010085	GCTG	2	8	628091	628098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.