MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 1869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	TAG	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010085	AGA	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010085	ATT	2	6	9264	9269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010085	AAT	2	6	9318	9323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010085	ATG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010085	TAG	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010085	TGA	2	6	12143	12148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010085	AGT	2	6	12209	12214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010085	GAT	2	6	12228	12233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010085	ACA	2	6	13846	13851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010085	TAA	2	6	14184	14189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010085	ATA	2	6	15163	15168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010085	AAT	2	6	15203	15208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010085	ACA	2	6	15286	15291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010085	CAT	2	6	15306	15311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010085	AAT	2	6	15330	15335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010085	TCA	2	6	15420	15425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010085	ATT	2	6	15438	15443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010085	TTC	2	6	15487	15492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010085	TTG	2	6	16843	16848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010085	ACC	2	6	16859	16864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010085	TGA	2	6	19299	19304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010085	GTG	2	6	19316	19321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010085	ATT	2	6	22342	22347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010085	TTA	2	6	22354	22359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010085	TAA	2	6	22389	22394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010085	ATT	2	6	22964	22969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010085	ATT	2	6	24325	24330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010085	TAC	2	6	24363	24368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010085	ATA	2	6	24440	24445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010085	TCC	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010085	ACA	2	6	27013	27018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010085	TTA	2	6	28680	28685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010085	ATT	2	6	28938	28943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010085	ACC	2	6	29662	29667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010085	ATC	2	6	29714	29719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010085	TGA	2	6	35686	35691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010085	CAT	2	6	35767	35772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010085	TAT	2	6	41531	41536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010085	TAC	2	6	45605	45610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010085	AAT	2	6	48497	48502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010085	AGT	2	6	50457	50462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010085	ATT	2	6	50475	50480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010085	TTA	2	6	52938	52943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010085	CAT	2	6	59650	59655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010085	AAT	2	6	59909	59914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010085	TTA	2	6	59989	59994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010085	AAT	2	6	60054	60059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010085	TCA	2	6	62194	62199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010085	TAA	2	6	62694	62699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010085	TCT	2	6	65820	65825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010085	ATT	2	6	66463	66468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010085	TTG	2	6	70261	70266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010085	TAA	2	6	70270	70275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010085	ACT	2	6	71442	71447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010085	CCT	2	6	73780	73785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010085	GAA	2	6	73788	73793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010085	CTT	2	6	73816	73821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010085	TAA	3	9	73826	73834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010085	TAA	2	6	78756	78761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010085	TAG	2	6	78920	78925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010085	GAT	2	6	78926	78931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010085	TGA	2	6	88037	88042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010085	ATC	3	9	88073	88081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010085	CTT	2	6	88135	88140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010085	TAA	2	6	88182	88187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010085	TCT	2	6	88267	88272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010085	TGA	2	6	94595	94600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010085	TAA	3	9	95228	95236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010085	AGC	2	6	95242	95247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010085	ACC	2	6	95415	95420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010085	ATT	2	6	96554	96559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010085	TAA	2	6	96566	96571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010085	TAT	2	6	97582	97587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010085	AAT	2	6	97622	97627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010085	CTT	2	6	100733	100738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010085	GGT	2	6	100778	100783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010085	ATG	3	9	100804	100812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010085	GAT	2	6	101478	101483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010085	TTA	2	6	105599	105604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010085	ATG	2	6	108309	108314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010085	TAT	2	6	109485	109490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010085	ATT	2	6	110680	110685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010085	TAT	2	6	110700	110705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010085	ATA	2	6	110717	110722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010085	TTA	2	6	111682	111687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010085	TTA	2	6	111701	111706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010085	ATT	2	6	113702	113707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010085	TAT	2	6	115859	115864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010085	TCT	2	6	115938	115943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010085	ACA	2	6	116187	116192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010085	TAC	2	6	116200	116205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010085	GTA	2	6	116280	116285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010085	AAT	2	6	119875	119880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010085	TTA	2	6	119908	119913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010085	ATT	2	6	119927	119932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010085	TGA	2	6	120743	120748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010085	AAT	2	6	123393	123398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010085	TCT	2	6	123407	123412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010085	AAT	2	6	127264	127269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010085	TTC	2	6	129451	129456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010085	TAA	2	6	129478	129483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010085	ATT	2	6	132075	132080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010085	TGA	2	6	135262	135267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010085	GAT	2	6	135343	135348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010085	CCA	2	6	139784	139789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010085	ATT	2	6	139837	139842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010085	AAT	2	6	139852	139857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010085	ATC	2	6	139909	139914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010085	TCC	2	6	140098	140103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010085	TCT	2	6	140207	140212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010085	TCC	2	6	140236	140241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010085	CAA	2	6	140377	140382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010085	ATC	2	6	140506	140511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010085	ATC	3	9	140550	140558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010085	ATA	3	9	140613	140621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010085	ATT	2	6	140661	140666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010085	ATG	2	6	140834	140839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010085	CAA	2	6	140888	140893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010085	CAT	3	9	141311	141319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010085	AGA	2	6	141346	141351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010085	TCT	2	6	141394	141399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010085	GTT	2	6	141484	141489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010085	ATT	2	6	141608	141613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010085	TAT	2	6	144081	144086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010085	ATA	2	6	144109	144114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010085	ATT	2	6	144122	144127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010085	CTT	2	6	147482	147487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010085	CAA	2	6	147511	147516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010085	TGT	2	6	147589	147594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010085	GAA	2	6	147635	147640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010085	ACT	2	6	147670	147675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010085	TAC	2	6	147714	147719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010085	TCA	2	6	147744	147749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010085	TGA	2	6	147820	147825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010085	CTT	2	6	147957	147962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_010085	TGT	2	6	148006	148011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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