MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 1860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	CT	3	6	89	94	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010085	GT	3	6	136	141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010085	AG	3	6	391	396	50 %	0 %	50 %	0 %	161527513
4	NC_010085	CA	3	6	1189	1194	50 %	0 %	0 %	50 %	161527513
5	NC_010085	TC	3	6	2333	2338	0 %	50 %	0 %	50 %	161527514
6	NC_010085	AT	3	6	3510	3515	50 %	50 %	0 %	0 %	161527516
7	NC_010085	AT	3	6	5103	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	161527518
8	NC_010085	TC	3	6	5517	5522	0 %	50 %	0 %	50 %	161527518
9	NC_010085	TC	3	6	7975	7980	0 %	50 %	0 %	50 %	161527520
10	NC_010085	CT	3	6	8221	8226	0 %	50 %	0 %	50 %	161527520
11	NC_010085	AT	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010085	CT	3	6	8810	8815	0 %	50 %	0 %	50 %	161527521
13	NC_010085	TC	3	6	9217	9222	0 %	50 %	0 %	50 %	161527521
14	NC_010085	TA	3	6	9327	9332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010085	AG	3	6	10666	10671	50 %	0 %	50 %	0 %	161527523
16	NC_010085	CA	3	6	10957	10962	50 %	0 %	0 %	50 %	161527523
17	NC_010085	AG	3	6	11595	11600	50 %	0 %	50 %	0 %	161527523
18	NC_010085	CT	3	6	12898	12903	0 %	50 %	0 %	50 %	161527525
19	NC_010085	TC	3	6	13139	13144	0 %	50 %	0 %	50 %	161527525
20	NC_010085	GT	3	6	14357	14362	0 %	50 %	50 %	0 %	161527527
21	NC_010085	CT	3	6	14533	14538	0 %	50 %	0 %	50 %	161527527
22	NC_010085	TC	3	6	16180	16185	0 %	50 %	0 %	50 %	161527531
23	NC_010085	TG	3	6	16310	16315	0 %	50 %	50 %	0 %	161527531
24	NC_010085	GA	3	6	17180	17185	50 %	0 %	50 %	0 %	161527532
25	NC_010085	AT	3	6	18441	18446	50 %	50 %	0 %	0 %	161527533
26	NC_010085	CT	3	6	18744	18749	0 %	50 %	0 %	50 %	161527533
27	NC_010085	TC	3	6	22494	22499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010085	AC	3	6	23615	23620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010085	CT	3	6	24076	24081	0 %	50 %	0 %	50 %	161527541
30	NC_010085	TC	3	6	25556	25561	0 %	50 %	0 %	50 %	161527543
31	NC_010085	TC	3	6	25896	25901	0 %	50 %	0 %	50 %	161527543
32	NC_010085	CT	3	6	26305	26310	0 %	50 %	0 %	50 %	161527544
33	NC_010085	AG	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	161527544
34	NC_010085	TA	3	6	26744	26749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010085	AT	3	6	27834	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	161527546
36	NC_010085	GA	3	6	28096	28101	50 %	0 %	50 %	0 %	161527546
37	NC_010085	TG	3	6	29934	29939	0 %	50 %	50 %	0 %	161527550
38	NC_010085	AG	3	6	30229	30234	50 %	0 %	50 %	0 %	161527550
39	NC_010085	AT	3	6	30344	30349	50 %	50 %	0 %	0 %	161527551
40	NC_010085	GA	3	6	30951	30956	50 %	0 %	50 %	0 %	161527552
41	NC_010085	AC	3	6	31674	31679	50 %	0 %	0 %	50 %	161527553
42	NC_010085	AC	3	6	32544	32549	50 %	0 %	0 %	50 %	161527554
43	NC_010085	GT	3	6	32628	32633	0 %	50 %	50 %	0 %	161527554
44	NC_010085	TA	3	6	33678	33683	50 %	50 %	0 %	0 %	161527555
45	NC_010085	GT	3	6	33711	33716	0 %	50 %	50 %	0 %	161527555
46	NC_010085	CT	3	6	35593	35598	0 %	50 %	0 %	50 %	161527558
47	NC_010085	CT	4	8	35651	35658	0 %	50 %	0 %	50 %	161527558
48	NC_010085	GT	3	6	35659	35664	0 %	50 %	50 %	0 %	161527558
49	NC_010085	CT	3	6	35927	35932	0 %	50 %	0 %	50 %	161527559
50	NC_010085	TC	3	6	35938	35943	0 %	50 %	0 %	50 %	161527559
51	NC_010085	CA	3	6	36528	36533	50 %	0 %	0 %	50 %	161527559
52	NC_010085	TC	3	6	36760	36765	0 %	50 %	0 %	50 %	161527559
53	NC_010085	TC	3	6	36903	36908	0 %	50 %	0 %	50 %	161527559
54	NC_010085	TC	3	6	37270	37275	0 %	50 %	0 %	50 %	161527560
55	NC_010085	TC	3	6	38085	38090	0 %	50 %	0 %	50 %	161527560
56	NC_010085	TC	3	6	38093	38098	0 %	50 %	0 %	50 %	161527560
57	NC_010085	AG	3	6	38734	38739	50 %	0 %	50 %	0 %	161527561
58	NC_010085	CA	3	6	40911	40916	50 %	0 %	0 %	50 %	161527564
59	NC_010085	CA	3	6	41119	41124	50 %	0 %	0 %	50 %	161527564
60	NC_010085	CT	3	6	41861	41866	0 %	50 %	0 %	50 %	161527565
61	NC_010085	TG	3	6	42240	42245	0 %	50 %	50 %	0 %	161527565
62	NC_010085	TC	3	6	43503	43508	0 %	50 %	0 %	50 %	161527567
63	NC_010085	CT	3	6	44091	44096	0 %	50 %	0 %	50 %	161527567
64	NC_010085	TC	3	6	44254	44259	0 %	50 %	0 %	50 %	161527567
65	NC_010085	GA	3	6	45669	45674	50 %	0 %	50 %	0 %	161527569
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68	NC_010085	AG	3	6	48770	48775	50 %	0 %	50 %	0 %	161527573
69	NC_010085	CT	3	6	52018	52023	0 %	50 %	0 %	50 %	161527575
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71	NC_010085	TC	3	6	52640	52645	0 %	50 %	0 %	50 %	161527576
72	NC_010085	GA	3	6	53151	53156	50 %	0 %	50 %	0 %	161527577
73	NC_010085	CT	3	6	55373	55378	0 %	50 %	0 %	50 %	161527579
74	NC_010085	AC	3	6	55382	55387	50 %	0 %	0 %	50 %	161527579
75	NC_010085	AG	3	6	56087	56092	50 %	0 %	50 %	0 %	161527579
76	NC_010085	AC	3	6	56264	56269	50 %	0 %	0 %	50 %	161527579
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78	NC_010085	TA	3	6	56534	56539	50 %	50 %	0 %	0 %	161527579
79	NC_010085	AT	3	6	57357	57362	50 %	50 %	0 %	0 %	161527579
80	NC_010085	AT	3	6	58003	58008	50 %	50 %	0 %	0 %	161527579
81	NC_010085	CT	3	6	59682	59687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010085	CT	3	6	60180	60185	0 %	50 %	0 %	50 %	161527583
83	NC_010085	GA	4	8	60554	60561	50 %	0 %	50 %	0 %	161527584
84	NC_010085	TC	3	6	65026	65031	0 %	50 %	0 %	50 %	161527589
85	NC_010085	CT	3	6	65071	65076	0 %	50 %	0 %	50 %	161527589
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87	NC_010085	AT	3	6	67443	67448	50 %	50 %	0 %	0 %	161527591
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89	NC_010085	TA	3	6	68746	68751	50 %	50 %	0 %	0 %	161527593
90	NC_010085	TG	3	6	69764	69769	0 %	50 %	50 %	0 %	161527594
91	NC_010085	TG	3	6	71138	71143	0 %	50 %	50 %	0 %	161527595
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95	NC_010085	TC	3	6	73873	73878	0 %	50 %	0 %	50 %	161527599
96	NC_010085	AC	3	6	74365	74370	50 %	0 %	0 %	50 %	161527599
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99	NC_010085	AT	3	6	78855	78860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_010085	AT	3	6	84336	84341	50 %	50 %	0 %	0 %	161527607
103	NC_010085	TC	4	8	85085	85092	0 %	50 %	0 %	50 %	161527608
104	NC_010085	AT	3	6	86642	86647	50 %	50 %	0 %	0 %	161527609
105	NC_010085	CA	3	6	87332	87337	50 %	0 %	0 %	50 %	161527609
106	NC_010085	GT	3	6	88043	88048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010085	CT	3	6	88480	88485	0 %	50 %	0 %	50 %	161527611
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109	NC_010085	TC	3	6	92694	92699	0 %	50 %	0 %	50 %	161527613
110	NC_010085	TC	3	6	92928	92933	0 %	50 %	0 %	50 %	161527613
111	NC_010085	GA	3	6	93688	93693	50 %	0 %	50 %	0 %	161527613
112	NC_010085	TC	3	6	94207	94212	0 %	50 %	0 %	50 %	161527614
113	NC_010085	CA	3	6	95634	95639	50 %	0 %	0 %	50 %	161527617
114	NC_010085	AT	3	6	95882	95887	50 %	50 %	0 %	0 %	161527617
115	NC_010085	TA	3	6	96602	96607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010085	TC	3	6	97942	97947	0 %	50 %	0 %	50 %	161527619
117	NC_010085	TC	3	6	98048	98053	0 %	50 %	0 %	50 %	161527619
118	NC_010085	AT	3	6	98993	98998	50 %	50 %	0 %	0 %	161527620
119	NC_010085	AT	3	6	99051	99056	50 %	50 %	0 %	0 %	161527620
120	NC_010085	CA	3	6	101394	101399	50 %	0 %	0 %	50 %	161527624
121	NC_010085	AT	3	6	101482	101487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010085	TA	3	6	102803	102808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010085	AG	4	8	104372	104379	50 %	0 %	50 %	0 %	161527627
124	NC_010085	AG	3	6	105474	105479	50 %	0 %	50 %	0 %	161527628
125	NC_010085	TC	3	6	106818	106823	0 %	50 %	0 %	50 %	161527630
126	NC_010085	AT	3	6	106835	106840	50 %	50 %	0 %	0 %	161527630
127	NC_010085	AT	3	6	106979	106984	50 %	50 %	0 %	0 %	161527630
128	NC_010085	TG	3	6	107461	107466	0 %	50 %	50 %	0 %	161527630
129	NC_010085	AT	3	6	108468	108473	50 %	50 %	0 %	0 %	161527631
130	NC_010085	TC	3	6	109908	109913	0 %	50 %	0 %	50 %	161527632
131	NC_010085	TA	3	6	110559	110564	50 %	50 %	0 %	0 %	161527632
132	NC_010085	GA	3	6	112613	112618	50 %	0 %	50 %	0 %	161527634
133	NC_010085	AT	3	6	112719	112724	50 %	50 %	0 %	0 %	161527635
134	NC_010085	CA	3	6	113061	113066	50 %	0 %	0 %	50 %	161527635
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136	NC_010085	AT	3	6	116287	116292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010085	AT	3	6	116513	116518	50 %	50 %	0 %	0 %	161527638
138	NC_010085	TA	3	6	120756	120761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010085	CA	3	6	120796	120801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010085	TG	3	6	120828	120833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010085	TA	3	6	122706	122711	50 %	50 %	0 %	0 %	161527644
142	NC_010085	AT	3	6	123205	123210	50 %	50 %	0 %	0 %	161527645
143	NC_010085	TA	3	6	123428	123433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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