MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus DPC 4571

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010080	AGATAA	2	12	12566	12577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010080	TAAATC	2	12	15741	15752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010080	AAATAC	2	12	48537	48548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010080	AAAAAG	2	12	50404	50415	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010080	ACCTTA	2	12	56667	56678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010080	AGACAA	2	12	66431	66442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010080	CTTTTT	2	12	69331	69342	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010080	ATTGCA	2	12	70978	70989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010080	CGGAGC	2	12	78882	78893	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010080	TACTTT	2	12	82034	82045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010080	CACGGT	2	12	82574	82585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010080	CAGTTA	2	12	88669	88680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010080	TTCTTT	2	12	120809	120820	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010080	AATTTT	2	12	124499	124510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010080	TTATTT	2	12	139049	139060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010080	TAAATT	2	12	178169	178180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010080	CAAATG	2	12	183999	184010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010080	ATCAAC	2	12	200587	200598	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010080	ATAGAC	2	12	242391	242402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010080	TTTTAG	2	12	244363	244374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010080	TCAAGT	2	12	245443	245454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010080	AAAAGA	2	12	247970	247981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010080	TAATTT	2	12	270278	270289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010080	ACTACA	2	12	275708	275719	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010080	GAAAAG	2	12	279034	279045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010080	TTAAAG	2	12	291884	291895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010080	ATATTA	2	12	292215	292226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010080	TTTTTA	2	12	306896	306907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010080	CTTAAG	2	12	360701	360712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010080	GCCTTT	2	12	373396	373407	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010080	TGGATT	2	12	385462	385473	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010080	TTCTTT	2	12	405078	405089	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010080	ATCTAA	2	12	431775	431786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010080	CGGAGC	2	12	453356	453367	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010080	TATTAA	2	12	457811	457822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010080	GAAAAA	2	12	467719	467730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010080	CGGAGC	2	12	470616	470627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010080	ATTTTG	2	12	474828	474839	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010080	AGTTAA	2	12	475217	475228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010080	GAAGTA	2	12	496150	496161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010080	TAAGTA	2	12	499491	499502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010080	TGATGG	2	12	511497	511508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010080	TAAAAA	2	12	518426	518437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010080	AGATGG	2	12	531095	531106	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010080	ATAAAA	2	12	540482	540493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010080	CTTTAA	2	12	549587	549598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010080	TAGTTA	2	12	560589	560600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010080	GTTTTT	2	12	566808	566819	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010080	ATGAAT	2	12	582921	582932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010080	TCATTA	2	12	604190	604201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010080	CTTAAG	2	12	607301	607312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010080	AGGGGA	2	12	619071	619082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010080	ATGAAA	2	12	620969	620980	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010080	GAGATA	2	12	621252	621263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010080	AATGAC	2	12	625775	625786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010080	TCCAAT	2	12	628395	628406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010080	GCTTAA	2	12	645914	645925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010080	AGAGCC	2	12	646047	646058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010080	GCCGAT	2	12	660181	660192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010080	GCTTAA	2	12	667940	667951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010080	TTTAAA	2	12	668408	668419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010080	GTAAAA	2	12	677373	677384	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010080	AAAAAG	2	12	678481	678492	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010080	ATTTTT	2	12	722876	722887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010080	TTTTGG	2	12	723166	723177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010080	CTTTTC	2	12	723380	723391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010080	ATCTAT	2	12	731700	731711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010080	TATTTA	2	12	755570	755581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010080	TTTTAT	2	12	766707	766718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010080	ATTTTT	2	12	775358	775369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010080	TTTTAA	2	12	776135	776146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010080	ATTTTT	2	12	780706	780717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010080	GCGTTT	2	12	810118	810129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010080	TTTCTT	2	12	833016	833027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010080	GTTCAG	2	12	837848	837859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010080	AGCTAA	2	12	838648	838659	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010080	GTTAAT	2	12	852274	852285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010080	TTCCTG	2	12	861793	861804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010080	TGAACG	2	12	866967	866978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010080	TAAGGT	2	12	867517	867528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010080	ACGTGA	2	12	868414	868425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010080	CAAACT	3	18	881406	881423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010080	TAGATT	2	12	903804	903815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010080	AAAATG	2	12	927613	927624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010080	TGAAAA	2	12	931179	931190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010080	TCAAGG	2	12	934765	934776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010080	ATTATG	2	12	946497	946508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010080	CTTAAG	2	12	948063	948074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010080	CTTATA	2	12	950532	950543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010080	CCTAAG	2	12	954594	954605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010080	AATGAA	2	12	966844	966855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010080	TTTAAT	2	12	975087	975098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010080	AAATCA	2	12	982842	982853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010080	AAAGAA	2	12	987783	987794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010080	ATTGAT	2	12	1003130	1003141	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010080	AGTTTT	2	12	1003996	1004007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010080	CTTAAG	2	12	1007263	1007274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010080	TATGAA	2	12	1009534	1009545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010080	CTAAGA	2	12	1009848	1009859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010080	CTTAAG	2	12	1014394	1014405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010080	TCTAGA	2	12	1041882	1041893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010080	GAAAGC	2	12	1067839	1067850	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010080	AATAAA	2	12	1071945	1071956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010080	AGCTGA	2	12	1076481	1076492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010080	TTCTTT	2	12	1078161	1078172	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010080	TTCCTA	2	12	1078535	1078546	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010080	AAAAGT	2	12	1091526	1091537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010080	GATTGG	2	12	1092258	1092269	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010080	CGCAAA	2	12	1098139	1098150	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010080	TGCATT	2	12	1104021	1104032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010080	CTGGTT	2	12	1104154	1104165	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010080	GTTCTA	2	12	1108424	1108435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010080	AAGCCA	2	12	1131815	1131826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010080	ATTTTT	2	12	1135981	1135992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010080	TCTATA	2	12	1144966	1144977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010080	AAAAGA	2	12	1147964	1147975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010080	TTTGGA	2	12	1159688	1159699	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010080	CTTTTT	2	12	1196661	1196672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010080	AAAATA	2	12	1196673	1196684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010080	TTAATT	2	12	1199480	1199491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010080	ATTTTT	2	12	1201565	1201576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010080	AAAAGC	2	12	1203761	1203772	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010080	AATTGC	2	12	1206159	1206170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010080	AGGATG	2	12	1206888	1206899	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010080	TATAGG	2	12	1216055	1216066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010080	CTTAAG	2	12	1217647	1217658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010080	AAATAA	2	12	1220917	1220928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010080	TCTAAT	2	12	1224153	1224164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010080	GCTGAT	2	12	1224371	1224382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010080	TAAGAC	2	12	1241823	1241834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010080	AATAAA	2	12	1278536	1278547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010080	TTATTT	2	12	1292808	1292819	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010080	ATTTTT	2	12	1294500	1294511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_010080	CCAGCG	2	12	1355146	1355157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010080	TAATTA	2	12	1359803	1359814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010080	TAATTT	2	12	1373645	1373656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_010080	CTTAAG	2	12	1425180	1425191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_010080	TCTTTT	2	12	1437499	1437510	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_010080	AATATA	2	12	1437815	1437826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010080	TTGCTA	2	12	1441528	1441539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_010080	TTATTT	2	12	1465533	1465544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_010080	TTATTT	2	12	1487874	1487885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_010080	TATTTT	2	12	1619555	1619566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010080	ATTTTT	2	12	1640881	1640892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.