MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus DPC 4571

Total Repeats: 698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010080	GCAGAA	2	12	1075	1086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161506635
2	NC_010080	GATGCA	2	12	6291	6302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506639
3	NC_010080	GCAAGG	2	12	8678	8689	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	161506640
4	NC_010080	GATCAA	2	12	8839	8850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506640
5	NC_010080	TAATTT	2	12	9399	9410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161506641
6	NC_010080	AGCTGA	2	12	19158	19169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506647
7	NC_010080	TGAAGT	2	12	20727	20738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506648
8	NC_010080	TTCTTT	2	12	22163	22174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161506650
9	NC_010080	TGCTTG	2	12	22499	22510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	161506650
10	NC_010080	ATGAAT	2	12	28684	28695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161506656
11	NC_010080	TGAAGA	2	12	28830	28841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506656
12	NC_010080	TTTGAA	2	12	37628	37639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161506660
13	NC_010080	TAAAGT	2	12	45602	45613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161506664
14	NC_010080	GGAATA	2	12	45651	45662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506664
15	NC_010080	TCATGA	2	12	49481	49492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506667
16	NC_010080	AACGCC	2	12	54064	54075	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	161506671
17	NC_010080	GAATAT	2	12	59741	59752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161506675
18	NC_010080	TCACCG	2	12	61634	61645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161506676
19	NC_010080	ATACTT	2	12	62837	62848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161506679
20	NC_010080	CTTTGA	2	12	63576	63587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506679
21	NC_010080	CTTGTT	2	12	66955	66966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161506681
22	NC_010080	CTTCGT	2	12	67167	67178	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161506681
23	NC_010080	TTACAA	2	12	67266	67277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161506681
24	NC_010080	ATAAAA	2	12	72104	72115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161506684
25	NC_010080	AACGTT	2	12	86544	86555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506691
26	NC_010080	ATTTTA	2	12	87827	87838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161506693
27	NC_010080	TATTTT	2	12	88403	88414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161506693
28	NC_010080	GGCAAA	2	12	95184	95195	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161506701
29	NC_010080	ATAAAA	2	12	99584	99595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161506704
30	NC_010080	ACTGCT	2	12	99736	99747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506704
31	NC_010080	GATTCA	2	12	102356	102367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506706
32	NC_010080	AAATTC	2	12	104053	104064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161506706
33	NC_010080	TAAGGA	2	12	109026	109037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506711
34	NC_010080	CTTGAT	2	12	111226	111237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506713
35	NC_010080	TAACTG	2	12	111735	111746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506714
36	NC_010080	AACTTG	2	12	125318	125329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506724
37	NC_010080	ATAAAT	2	12	127634	127645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506725
38	NC_010080	GCTTCA	2	12	127734	127745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506725
39	NC_010080	TTCCGA	2	12	128869	128880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506727
40	NC_010080	CTTTTT	2	12	129149	129160	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161506728
41	NC_010080	CATAAT	2	12	129590	129601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161506728
42	NC_010080	TTATTT	2	12	130595	130606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161506730
43	NC_010080	ATAAAT	2	12	131206	131217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161506731
44	NC_010080	ACTTCT	2	12	132507	132518	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161506732
45	NC_010080	GTTTTG	2	12	136427	136438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506736
46	NC_010080	TGGCAA	2	12	137515	137526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506738
47	NC_010080	TGTTGA	2	12	139560	139571	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	161506740
48	NC_010080	CTAAGG	2	12	141330	141341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506742
49	NC_010080	TTCTGG	2	12	142379	142390	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	161506743
50	NC_010080	TAAAGA	2	12	147468	147479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161506747
51	NC_010080	TTGCAG	2	12	147898	147909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161506748
52	NC_010080	TTCTTT	2	12	150600	150611	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161506750
53	NC_010080	AACGCA	2	12	152521	152532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161506751
54	NC_010080	CAATTT	2	12	152770	152781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161506751
55	NC_010080	ATTGCC	2	12	153356	153367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506751
56	NC_010080	TAACTT	2	12	157843	157854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161506755
57	NC_010080	CTAAGG	2	12	159618	159629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506757
58	NC_010080	TAAAGA	2	12	163518	163529	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161506762
59	NC_010080	GTCATC	2	12	164255	164266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506762
60	NC_010080	CTAAGA	2	12	166984	166995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506764
61	NC_010080	TATTGA	2	12	171599	171610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161506767
62	NC_010080	CTGAAG	2	12	175231	175242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506770
63	NC_010080	TGTGGT	2	12	178509	178520	0 %	50 %	50 %	0 %	161506771
64	NC_010080	CAATAG	2	12	179173	179184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506771
65	NC_010080	GTAACA	2	12	179889	179900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506771
66	NC_010080	GATGAA	2	12	184443	184454	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506774
67	NC_010080	CTAGAA	2	12	184527	184538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506774
68	NC_010080	GCGCCA	2	12	184671	184682	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506774
69	NC_010080	TACTGC	2	12	186879	186890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506776
70	NC_010080	ATATAG	2	12	190714	190725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161508241
71	NC_010080	TTGAAA	2	12	190759	190770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161508241
72	NC_010080	CATACC	2	12	193550	193561	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	161506778
73	NC_010080	TTGATT	2	12	194281	194292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	161506779
74	NC_010080	TTTGCA	2	12	196526	196537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506780
75	NC_010080	TTTCTT	2	12	198072	198083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161506782
76	NC_010080	CGTTGC	2	12	204973	204984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506787
77	NC_010080	ATTCTT	2	12	206058	206069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	161506788
78	NC_010080	GTAATT	2	12	206794	206805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161506788
79	NC_010080	AATAGT	2	12	217187	217198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161506796
80	NC_010080	CCAAGC	2	12	220836	220847	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	161506798
81	NC_010080	ATCGGT	2	12	223698	223709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161506800
82	NC_010080	TATTGC	2	12	224396	224407	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506801
83	NC_010080	GATAAG	2	12	230995	231006	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506808
84	NC_010080	AAGATG	2	12	231131	231142	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506808
85	NC_010080	ATGACG	2	12	231791	231802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506810
86	NC_010080	TCCGGT	2	12	233330	233341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506811
87	NC_010080	TTGCCA	2	12	236203	236214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506812
88	NC_010080	GTCTAA	2	12	236262	236273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506812
89	NC_010080	CCTGTT	2	12	236488	236499	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161506812
90	NC_010080	GGCTAA	2	12	236931	236942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506812
91	NC_010080	GAAGCT	2	12	239809	239820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506816
92	NC_010080	AAAGAT	2	12	242184	242195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161506818
93	NC_010080	TTAGTT	2	12	243145	243156	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	161506820
94	NC_010080	GAAACT	2	12	249861	249872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506824
95	NC_010080	ACGATG	2	12	250790	250801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506825
96	NC_010080	CGTCAC	2	12	252316	252327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161506826
97	NC_010080	GTATTC	2	12	253436	253447	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506827
98	NC_010080	TTGATC	2	12	255389	255400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506829
99	NC_010080	CCTAAT	2	12	257339	257350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506831
100	NC_010080	ACCCAT	2	12	257515	257526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	161506831
101	NC_010080	CAGGTC	2	12	263893	263904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506835
102	NC_010080	ATAAAA	2	12	264462	264473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161506836
103	NC_010080	CAAAAA	2	12	264707	264718	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	161506836
104	NC_010080	AGTAAA	2	12	265899	265910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161506837
105	NC_010080	CAAGAA	2	12	266993	267004	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	161506837
106	NC_010080	AGGAAA	2	12	268631	268642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506837
107	NC_010080	TTCTTT	2	12	276441	276452	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161506841
108	NC_010080	AAATTG	2	12	279880	279891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161506842
109	NC_010080	ATAGAG	2	12	280384	280395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161506842
110	NC_010080	CAGATT	2	12	283590	283601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506844
111	NC_010080	CGTTAT	2	12	285810	285821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161506846
112	NC_010080	TCGCCA	2	12	285920	285931	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161506846
113	NC_010080	AAGCTA	2	12	287853	287864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506848
114	NC_010080	ACTGGT	2	12	288668	288679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161506849
115	NC_010080	TGGACG	2	12	289879	289890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161506849
116	NC_010080	TTTTGG	2	12	290730	290741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506851
117	NC_010080	TGGAAT	2	12	291148	291159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506851
118	NC_010080	TTGAAC	2	12	291213	291224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161506851
119	NC_010080	AGACAA	2	12	294508	294519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	161506854
120	NC_010080	ATTAGA	2	12	294695	294706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161506854
121	NC_010080	GAAAAT	2	12	295122	295133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161506855
122	NC_010080	TGCACC	2	12	295697	295708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161506855
123	NC_010080	ATCAAA	2	12	300756	300767	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	161506859
124	NC_010080	TCTGCT	2	12	303232	303243	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161506861
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140	NC_010080	AACTGA	2	12	341942	341953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506905
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229	NC_010080	TAAATT	2	12	614223	614234	50 %	50 %	0 %	0 %	161507131
230	NC_010080	ATTCCT	2	12	616098	616109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161507132
231	NC_010080	AACTGA	2	12	617051	617062	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161507132
232	NC_010080	AATGGA	2	12	617521	617532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161507132
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343	NC_010080	TCCATC	2	12	896676	896687	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161507358
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454	NC_010080	TGTACG	2	12	1279756	1279767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161507646
455	NC_010080	TTATTT	2	12	1282617	1282628	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161507648
456	NC_010080	CAACTG	2	12	1286859	1286870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161507651
457	NC_010080	CAATAC	2	12	1287027	1287038	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	161507651
458	NC_010080	AGTAAT	2	12	1288856	1288867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161507653
459	NC_010080	CATTTA	2	12	1291519	1291530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161507657
460	NC_010080	ATTGCT	2	12	1291951	1291962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161507658
461	NC_010080	ATATCC	2	12	1296355	1296366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161507662
462	NC_010080	TTTTGC	2	12	1312081	1312092	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161507672
463	NC_010080	ATTAGC	2	12	1312236	1312247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161507672
464	NC_010080	TTGCTT	2	12	1318897	1318908	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161507676
465	NC_010080	ACCATT	2	12	1318957	1318968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161507676
466	NC_010080	ACCTTG	2	12	1319218	1319229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161507676
467	NC_010080	AACTGC	2	12	1321807	1321818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161507677
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471	NC_010080	TTCTTG	2	12	1327823	1327834	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161507681
472	NC_010080	ACCTGA	2	12	1328260	1328271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161507681
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474	NC_010080	ATTTTT	2	12	1331588	1331599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161507686
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479	NC_010080	CCTTAG	2	12	1341599	1341610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161508234
480	NC_010080	TGGATC	2	12	1342563	1342574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161507691
481	NC_010080	ATGAAA	2	12	1344929	1344940	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161507693
482	NC_010080	AAAGAA	2	12	1349779	1349790	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	161507696
483	NC_010080	AGCTTG	2	12	1351583	1351594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161507700
484	NC_010080	CAACAC	2	12	1354898	1354909	50 %	0 %	0 %	50 %	161507703
485	NC_010080	AACAGT	2	12	1355025	1355036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161507703
486	NC_010080	TCAGCT	2	12	1357766	1357777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161507707
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488	NC_010080	ATTTTT	2	12	1364600	1364611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161507713
489	NC_010080	TCGTAT	2	12	1373121	1373132	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161508230
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491	NC_010080	ACCAGA	2	12	1376478	1376489	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161508233
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500	NC_010080	TTGCTT	2	12	1393050	1393061	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161507730

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