MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus DPC 4571

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010080	CACAA	2	10	12	21	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010080	AGGAA	2	10	9427	9436	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010080	TAATA	2	10	12238	12247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010080	TAACT	2	10	12629	12638	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010080	CAATA	2	10	13548	13557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010080	TATAA	2	10	20975	20984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010080	CATTG	2	10	22021	22030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010080	TTGAT	2	10	28254	28263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010080	ATTGA	2	10	28655	28664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010080	CCGCG	2	10	41044	41053	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010080	AAATT	2	10	42145	42154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010080	GTTTT	2	10	42213	42222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010080	AATTT	2	10	51664	51673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010080	AAAAT	2	10	56201	56210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010080	GATCA	2	10	66209	66218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010080	TTAAA	2	10	70242	70251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010080	TTTTG	2	10	75332	75341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010080	GGTAA	2	10	76490	76499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010080	TCGTG	2	10	77307	77316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010080	GGCAG	2	10	77706	77715	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010080	GAGAA	2	10	78210	78219	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010080	AAGGC	2	10	79608	79617	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010080	TTGAA	2	10	80118	80127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010080	GCCAG	2	10	80450	80459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010080	ACTTA	2	10	83503	83512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010080	TTGTT	2	10	99307	99316	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010080	GAATA	2	10	109414	109423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010080	TTTAA	2	10	112848	112857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010080	TTTTC	2	10	113923	113932	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010080	TAATG	2	10	120453	120462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010080	TGAAG	2	10	122499	122508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010080	CAATA	2	10	126931	126940	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010080	TTTTG	2	10	129638	129647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010080	AAAAG	2	10	155226	155235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010080	ATTTT	2	10	162479	162488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010080	GAACA	2	10	167931	167940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010080	AATAA	2	10	176591	176600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010080	AAATT	2	10	184942	184951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010080	AAAAT	2	10	185228	185237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010080	ATTAG	2	10	190455	190464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010080	TCATA	2	10	200381	200390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010080	TTAGA	2	10	200394	200403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010080	TTATT	2	10	211441	211450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010080	CCGCG	2	10	214766	214775	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010080	TGAAT	2	10	214943	214952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010080	ATAAA	2	10	221880	221889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010080	AAATA	2	10	230176	230185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010080	TAAAA	2	10	230201	230210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010080	AACTC	2	10	245230	245239	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010080	CAATT	2	10	245678	245687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010080	AAATA	2	10	245797	245806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010080	TAATT	2	10	249718	249727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010080	AAAAG	2	10	252664	252673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010080	ATAAA	2	10	254041	254050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010080	ATCTG	2	10	270068	270077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010080	ATTAG	2	10	270380	270389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010080	ATGAA	2	10	272694	272703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010080	ATTTT	2	10	274884	274893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010080	TGGTT	2	10	275653	275662	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010080	TCACA	2	10	276055	276064	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010080	CATAC	2	10	278230	278239	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010080	GGCTT	2	10	284238	284247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010080	AAAAC	2	10	292035	292044	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010080	GAAAA	2	10	306713	306722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010080	TGTAA	2	10	307311	307320	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010080	TAAAA	2	10	308387	308396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010080	CACTA	2	10	319956	319965	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010080	CTTTT	2	10	320712	320721	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010080	ACGTT	2	10	336390	336399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010080	TTTTA	2	10	357540	357549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010080	ATTTA	2	10	360589	360598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010080	TCTGA	2	10	360682	360691	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010080	TTAAT	2	10	373473	373482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010080	TTAAA	2	10	378271	378280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010080	CTTGA	2	10	378912	378921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010080	TTTAA	2	10	384531	384540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010080	TTTGA	2	10	385144	385153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010080	TAATT	2	10	404904	404913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010080	TAATT	2	10	405255	405264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010080	AATTC	2	10	405459	405468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010080	TTTTC	2	10	410078	410087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010080	CTTTT	2	10	432701	432710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010080	TTAGT	2	10	442379	442388	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010080	TTAAG	2	10	443549	443558	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010080	TAAGT	2	10	450565	450574	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010080	GGTAA	2	10	451213	451222	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010080	TCGTG	2	10	452030	452039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010080	GGCAG	2	10	452429	452438	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010080	GAGAA	2	10	452684	452693	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010080	AAGGC	2	10	454082	454091	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010080	TTGAA	2	10	454592	454601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010080	GCCAG	2	10	454924	454933	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010080	GAAAA	2	10	457285	457294	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010080	TAGCT	2	10	457515	457524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010080	TAATT	2	10	464492	464501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010080	GGTAA	2	10	468473	468482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010080	TCGTG	2	10	469290	469299	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010080	GGCAG	2	10	469689	469698	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010080	GAGAA	2	10	469944	469953	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010080	AAGGC	2	10	471342	471351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010080	TTGAA	2	10	471852	471861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010080	GCCAG	2	10	472184	472193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010080	GAAGA	2	10	483354	483363	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010080	ATGGT	2	10	484084	484093	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010080	TTAAA	2	10	484564	484573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010080	CTTGA	2	10	485206	485215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010080	GGTGA	2	10	488865	488874	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010080	CAAGT	2	10	501383	501392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010080	ATCAC	2	10	503083	503092	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010080	TTAAA	2	10	503383	503392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010080	TTTTG	2	10	509328	509337	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010080	GTCAT	2	10	509623	509632	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010080	GAATT	2	10	511547	511556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010080	TTCTT	2	10	511825	511834	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010080	AATTA	2	10	513148	513157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010080	ATTAA	2	10	514252	514261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010080	ATTTT	2	10	519701	519710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010080	ACAAA	2	10	523067	523076	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010080	GTATT	2	10	531169	531178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010080	GCTTA	2	10	532225	532234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010080	GATTT	2	10	532287	532296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010080	GCTGG	2	10	532856	532865	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010080	TACTT	2	10	537463	537472	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010080	ACTAG	2	10	558077	558086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010080	GTATG	2	10	560650	560659	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010080	TTTTG	2	10	561280	561289	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010080	ATTAA	2	10	563864	563873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010080	ATAAA	2	10	564187	564196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010080	ATGAA	2	10	575573	575582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010080	TAAAA	2	10	575616	575625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010080	TAATA	2	10	575670	575679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010080	ATTAT	2	10	575680	575689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010080	ACATA	2	10	587231	587240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010080	TCAAG	2	10	598023	598032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010080	TAGAT	2	10	602506	602515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010080	TCTGA	2	10	607282	607291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010080	GAATC	2	10	607398	607407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010080	ATTCC	2	10	622162	622171	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_010080	CAAAA	2	10	623551	623560	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010080	ATTTT	2	10	629128	629137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010080	ATTAG	2	10	629234	629243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010080	TCCAA	2	10	633240	633249	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_010080	AACAA	2	10	634571	634580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010080	AATGC	2	10	638679	638688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010080	TCAAG	2	10	639920	639929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010080	GATTC	2	10	645738	645747	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010080	ATCAG	2	10	645935	645944	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010080	TAGCA	2	10	647759	647768	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010080	TTAAG	2	10	650821	650830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010080	ATTGA	2	10	654222	654231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010080	TGATA	2	10	654332	654341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010080	TAAAA	2	10	654826	654835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010080	TCACT	2	10	654858	654867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_010080	ATTGA	2	10	656430	656439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_010080	ATTAT	2	10	665539	665548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_010080	TTTTG	2	10	724500	724509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010080	TTTTG	2	10	725297	725306	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_010080	ATTAA	2	10	744984	744993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_010080	TAAAA	2	10	834937	834946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_010080	GAAGA	2	10	1207528	1207537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010080	TTATG	2	10	1212979	1212988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_010080	AAATA	2	10	1215922	1215931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010080	GATTT	2	10	1216551	1216560	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010080	CATGA	2	10	1216638	1216647	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_010080	TCTGA	2	10	1217628	1217637	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_010080	GAATC	2	10	1217744	1217753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
294	NC_010080	TGGCA	2	10	1220820	1220829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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296	NC_010080	ATGAG	2	10	1221310	1221319	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
297	NC_010080	CAATT	2	10	1221850	1221859	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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424	NC_010080	TTAAT	2	10	1674846	1674855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_010080	TTCTC	2	10	1697203	1697212	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
431	NC_010080	CTGCC	2	10	1697458	1697467	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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446	NC_010080	GAAAA	2	10	1781595	1781604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_010080	CTTTA	2	10	1782294	1782303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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452	NC_010080	TCGAA	2	10	1792152	1792161	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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462	NC_010080	TTTCT	2	10	1848502	1848511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
463	NC_010080	CCTAT	2	10	1852824	1852833	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
464	NC_010080	TGCCA	2	10	1858772	1858781	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
465	NC_010080	CTAAA	2	10	1860600	1860609	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
466	NC_010080	TAAGC	2	10	1860820	1860829	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
467	NC_010080	TGATT	2	10	1861358	1861367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
468	NC_010080	TCTTG	2	10	1865460	1865469	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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470	NC_010080	TCAAG	2	10	1878329	1878338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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472	NC_010080	TGATA	2	10	1884129	1884138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
473	NC_010080	ATTAA	2	10	1884154	1884163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_010080	GAAGA	2	10	1884687	1884696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
475	NC_010080	GATAT	2	10	1885037	1885046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_010080	TTACA	2	10	1910301	1910310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
478	NC_010080	ATGCT	2	10	1910448	1910457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
479	NC_010080	CAACC	2	10	1910810	1910819	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
480	NC_010080	GTTCC	2	10	1910995	1911004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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486	NC_010080	CAAAG	2	10	1926779	1926788	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
487	NC_010080	CCACA	2	10	1927054	1927063	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
488	NC_010080	CCAAC	2	10	1930651	1930660	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
489	NC_010080	CGCGC	2	10	1931102	1931111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
490	NC_010080	TGGAA	2	10	1932163	1932172	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_010080	GAAAA	2	10	1941740	1941749	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_010080	CTCTA	2	10	1943207	1943216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
497	NC_010080	ACCAA	2	10	1946650	1946659	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
498	NC_010080	CTCTA	2	10	1951465	1951474	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
499	NC_010080	TGTTT	2	10	1953068	1953077	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
500	NC_010080	TATCA	2	10	1953462	1953471	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

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