MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pBMUL01

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010070	TCGCGG	2	12	7358	7369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161506502
2	NC_010070	GGTGTC	2	12	9142	9153	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161506503
3	NC_010070	CGAACG	2	12	9274	9285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506503
4	NC_010070	GGCGCG	2	12	9410	9421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506503
5	NC_010070	GTGCAG	2	12	10261	10272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161506504
6	NC_010070	CTGTTC	2	12	11200	11211	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161506504
7	NC_010070	TGCGCA	2	12	11391	11402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506504
8	NC_010070	ACCGGC	2	12	13144	13155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506504
9	NC_010070	TGCTCG	2	12	13480	13491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506505
10	NC_010070	TGCGTT	2	12	15703	15714	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	161506507
11	NC_010070	CCGACG	2	12	16761	16772	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506509
12	NC_010070	CCCAGC	2	12	18964	18975	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	161506512
13	NC_010070	GATGGC	2	12	22956	22967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161506517
14	NC_010070	TTCCGC	2	12	24964	24975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	161506518
15	NC_010070	GCGATC	2	12	28825	28836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010070	CGTGGG	2	12	29626	29637	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010070	CGCGGC	2	12	31527	31538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010070	GAAGCG	2	12	31707	31718	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010070	ACTCGC	2	12	34247	34258	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010070	CCGCCC	2	12	34718	34729	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_010070	CGACGC	2	12	40440	40451	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506526
22	NC_010070	GTTGCG	2	12	43193	43204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161506527
23	NC_010070	CTCGAG	2	12	45759	45770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010070	GAGTGG	2	12	48643	48654	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	161506533
25	NC_010070	ATGGAG	2	12	51769	51780	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	161506535
26	NC_010070	GCAGCG	3	18	52849	52866	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161506535
27	NC_010070	TGATCG	2	12	57588	57599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010070	TGCCGA	2	12	57766	57777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506538
29	NC_010070	GAACCA	2	12	67722	67733	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161506544
30	NC_010070	GAGCTT	2	12	67881	67892	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161506544
31	NC_010070	AACCGT	2	12	69290	69301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010070	TCTGGG	2	12	74657	74668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161506547
33	NC_010070	TCGGAC	2	12	76490	76501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506548
34	NC_010070	TGCCGA	2	12	79735	79746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010070	GCTGGC	2	12	85684	85695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161506554
36	NC_010070	GGGCGC	2	12	91761	91772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506559
37	NC_010070	ATCACG	2	12	92013	92024	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161506560
38	NC_010070	GCTTCG	2	12	92779	92790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506560
39	NC_010070	CGGAAA	2	12	97746	97757	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161506567
40	NC_010070	GTTCAC	2	12	98269	98280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506568
41	NC_010070	TTCGAC	2	12	101406	101417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506572
42	NC_010070	ACCGGC	2	12	101508	101519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506572
43	NC_010070	GTGACG	2	12	109182	109193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010070	AGAAGG	2	12	109909	109920	50 %	0 %	50 %	0 %	161506579
45	NC_010070	GCTCGC	2	12	114763	114774	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	161506583
46	NC_010070	TCTCGG	2	12	121753	121764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506593
47	NC_010070	TCGAGA	2	12	127941	127952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010070	TCACGT	2	12	133182	133193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506601
49	NC_010070	GATCGC	2	12	135445	135456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506601
50	NC_010070	ATCTCG	2	12	136175	136186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506602
51	NC_010070	GGCCGC	2	12	142548	142559	0 %	0 %	50 %	50 %	161506606
52	NC_010070	CCGGGC	2	12	143169	143180	0 %	0 %	50 %	50 %	161506606
53	NC_010070	CGTGAA	2	12	146211	146222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506612
54	NC_010070	CAGCGC	2	12	146751	146762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506612
55	NC_010070	GAGCAT	2	12	146979	146990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161506612
56	NC_010070	ACCTTG	2	12	147979	147990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506613
57	NC_010070	GACATA	2	12	148997	149008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161506614
58	NC_010070	CGATCG	2	12	150274	150285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506614
59	NC_010070	ACTCGG	2	12	150790	150801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506614
60	NC_010070	ACGCGC	2	12	152006	152017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161506615
61	NC_010070	GGCCGC	2	12	152887	152898	0 %	0 %	50 %	50 %	161506615
62	NC_010070	CGATGC	2	12	153983	153994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161506616
63	NC_010070	CTTGGC	2	12	154569	154580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506617
64	NC_010070	AGCACG	2	12	156432	156443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506620
65	NC_010070	CATCTC	2	12	158212	158223	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161506623
66	NC_010070	TCGTCA	2	12	158532	158543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506623
67	NC_010070	TGCTGA	2	12	162127	162138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161506627
68	NC_010070	CACCTG	2	12	163505	163516	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161506628

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.