MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pBMUL01

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010070	GCGCC	2	10	2469	2478	0 %	0 %	40 %	60 %	161506499
2	NC_010070	GAAAG	2	10	2813	2822	60 %	0 %	40 %	0 %	161506500
3	NC_010070	TGGTT	2	10	2948	2957	0 %	60 %	40 %	0 %	161506500
4	NC_010070	CGGCA	2	10	4075	4084	20 %	0 %	40 %	40 %	161506501
5	NC_010070	CGTCG	2	10	7563	7572	0 %	20 %	40 %	40 %	161506502
6	NC_010070	GGCGA	2	10	9485	9494	20 %	0 %	60 %	20 %	161506503
7	NC_010070	TGGGC	2	10	11684	11693	0 %	20 %	60 %	20 %	161506504
8	NC_010070	CCCGA	2	10	12043	12052	20 %	0 %	20 %	60 %	161506504
9	NC_010070	GCCCG	2	10	12594	12603	0 %	0 %	40 %	60 %	161506504
10	NC_010070	GTCGC	2	10	13108	13117	0 %	20 %	40 %	40 %	161506504
11	NC_010070	CGCCC	2	10	14386	14395	0 %	0 %	20 %	80 %	161506506
12	NC_010070	CCGGA	2	10	16078	16087	20 %	0 %	40 %	40 %	161506508
13	NC_010070	TCGCC	2	10	16107	16116	0 %	20 %	20 %	60 %	161506508
14	NC_010070	TTGCC	2	10	17394	17403	0 %	40 %	20 %	40 %	161506509
15	NC_010070	CTTGC	2	10	17537	17546	0 %	40 %	20 %	40 %	161506509
16	NC_010070	TTCAC	2	10	21039	21048	20 %	40 %	0 %	40 %	161506514
17	NC_010070	CGAAG	2	10	21466	21475	40 %	0 %	40 %	20 %	161506515
18	NC_010070	CCGTC	2	10	26979	26988	0 %	20 %	20 %	60 %	161506520
19	NC_010070	CGAAG	2	10	27388	27397	40 %	0 %	40 %	20 %	161506520
20	NC_010070	CCCAA	2	10	35607	35616	40 %	0 %	0 %	60 %	161506524
21	NC_010070	AGCCG	2	10	37116	37125	20 %	0 %	40 %	40 %	161506525
22	NC_010070	CGCAC	2	10	39600	39609	20 %	0 %	20 %	60 %	161506526
23	NC_010070	TCCTC	2	10	49815	49824	0 %	40 %	0 %	60 %	161506534
24	NC_010070	GGCGC	2	10	52479	52488	0 %	0 %	60 %	40 %	161506535
25	NC_010070	CGAAG	2	10	54889	54898	40 %	0 %	40 %	20 %	161506536
26	NC_010070	GATTC	2	10	54977	54986	20 %	40 %	20 %	20 %	161506536
27	NC_010070	TGGCG	2	10	55075	55084	0 %	20 %	60 %	20 %	161506536
28	NC_010070	CGCGG	2	10	55558	55567	0 %	0 %	60 %	40 %	161506536
29	NC_010070	ATGGA	2	10	58998	59007	40 %	20 %	40 %	0 %	161506538
30	NC_010070	CTGGC	2	10	59485	59494	0 %	20 %	40 %	40 %	161506539
31	NC_010070	TCGGG	2	10	61858	61867	0 %	20 %	60 %	20 %	161506542
32	NC_010070	GGTCG	2	10	62663	62672	0 %	20 %	60 %	20 %	161506542
33	NC_010070	CACGA	2	10	63407	63416	40 %	0 %	20 %	40 %	161506542
34	NC_010070	CATCG	2	10	63575	63584	20 %	20 %	20 %	40 %	161506542
35	NC_010070	GGTCG	2	10	63860	63869	0 %	20 %	60 %	20 %	161506542
36	NC_010070	TGCAG	2	10	64649	64658	20 %	20 %	40 %	20 %	161506542
37	NC_010070	GCCGC	2	10	65116	65125	0 %	0 %	40 %	60 %	161506542
38	NC_010070	TTGCT	2	10	66661	66670	0 %	60 %	20 %	20 %	161506544
39	NC_010070	GTTTC	2	10	67013	67022	0 %	60 %	20 %	20 %	161506544
40	NC_010070	GTCGA	2	10	67258	67267	20 %	20 %	40 %	20 %	161506544
41	NC_010070	TACGG	2	10	67429	67438	20 %	20 %	40 %	20 %	161506544
42	NC_010070	CTTCG	2	10	70353	70362	0 %	40 %	20 %	40 %	161506545
43	NC_010070	CTGTC	2	10	70523	70532	0 %	40 %	20 %	40 %	161506545
44	NC_010070	GGGAA	2	10	73406	73415	40 %	0 %	60 %	0 %	161506546
45	NC_010070	GCCCA	2	10	74615	74624	20 %	0 %	20 %	60 %	161506547
46	NC_010070	GGTCG	2	10	75934	75943	0 %	20 %	60 %	20 %	161506548
47	NC_010070	CCGTG	2	10	77904	77913	0 %	20 %	40 %	40 %	161506549
48	NC_010070	GAAGT	2	10	78782	78791	40 %	20 %	40 %	0 %	161506550
49	NC_010070	CGTTG	2	10	81363	81372	0 %	40 %	40 %	20 %	161506552
50	NC_010070	TCGCG	2	10	81702	81711	0 %	20 %	40 %	40 %	161506552
51	NC_010070	TGCCC	2	10	84082	84091	0 %	20 %	20 %	60 %	161506553
52	NC_010070	TCGGA	2	10	84172	84181	20 %	20 %	40 %	20 %	161506553
53	NC_010070	TCGAC	2	10	87148	87157	20 %	20 %	20 %	40 %	161506556
54	NC_010070	CTTGG	2	10	88031	88040	0 %	40 %	40 %	20 %	161506556
55	NC_010070	AGCCG	2	10	91104	91113	20 %	0 %	40 %	40 %	161506559
56	NC_010070	TTGCT	2	10	92493	92502	0 %	60 %	20 %	20 %	161506560
57	NC_010070	TTGCA	2	10	93346	93355	20 %	40 %	20 %	20 %	161506561
58	NC_010070	GTCGG	2	10	95445	95454	0 %	20 %	60 %	20 %	161506564
59	NC_010070	GCGCG	2	10	100948	100957	0 %	0 %	60 %	40 %	161506571
60	NC_010070	GAATT	2	10	101199	101208	40 %	40 %	20 %	0 %	161506572
61	NC_010070	GGCAT	2	10	102190	102199	20 %	20 %	40 %	20 %	161506573
62	NC_010070	CGCAG	2	10	105454	105463	20 %	0 %	40 %	40 %	161506576
63	NC_010070	GAACA	2	10	107085	107094	60 %	0 %	20 %	20 %	161506578
64	NC_010070	CCGCC	2	10	107476	107485	0 %	0 %	20 %	80 %	161506578
65	NC_010070	ACGAG	2	10	110977	110986	40 %	0 %	40 %	20 %	161506581
66	NC_010070	CACGC	2	10	111421	111430	20 %	0 %	20 %	60 %	161506581
67	NC_010070	CCTGC	2	10	113065	113074	0 %	20 %	20 %	60 %	161506582
68	NC_010070	TACGG	2	10	117862	117871	20 %	20 %	40 %	20 %	161506587
69	NC_010070	CGCGC	2	10	121711	121720	0 %	0 %	40 %	60 %	161506593
70	NC_010070	AGCGA	2	10	122769	122778	40 %	0 %	40 %	20 %	161506594
71	NC_010070	GTCGC	2	10	123840	123849	0 %	20 %	40 %	40 %	161506594
72	NC_010070	AGCGC	2	10	129522	129531	20 %	0 %	40 %	40 %	161506598
73	NC_010070	AAGCG	2	10	129999	130008	40 %	0 %	40 %	20 %	161506598
74	NC_010070	ACTTG	2	10	131080	131089	20 %	40 %	20 %	20 %	161506600
75	NC_010070	CGAGC	2	10	132466	132475	20 %	0 %	40 %	40 %	161506601
76	NC_010070	GCGCG	2	10	132942	132951	0 %	0 %	60 %	40 %	161506601
77	NC_010070	TGCGC	2	10	134281	134290	0 %	20 %	40 %	40 %	161506601
78	NC_010070	AGTTC	2	10	134592	134601	20 %	40 %	20 %	20 %	161506601
79	NC_010070	CTTCG	2	10	135394	135403	0 %	40 %	20 %	40 %	161506601
80	NC_010070	TCGCG	2	10	136197	136206	0 %	20 %	40 %	40 %	161506602
81	NC_010070	CGACG	2	10	136645	136654	20 %	0 %	40 %	40 %	161506602
82	NC_010070	CGCGT	2	10	137207	137216	0 %	20 %	40 %	40 %	161506603
83	NC_010070	TCAGC	2	10	137599	137608	20 %	20 %	20 %	40 %	161506603
84	NC_010070	GCAGC	2	10	138720	138729	20 %	0 %	40 %	40 %	161506604
85	NC_010070	CGGCG	2	10	139886	139895	0 %	0 %	60 %	40 %	161506605
86	NC_010070	CCGCT	2	10	140188	140197	0 %	20 %	20 %	60 %	161506605
87	NC_010070	ATCAA	2	10	140212	140221	60 %	20 %	0 %	20 %	161506605
88	NC_010070	GGCGC	2	10	143100	143109	0 %	0 %	60 %	40 %	161506606
89	NC_010070	AGTCC	2	10	145251	145260	20 %	20 %	20 %	40 %	161506610
90	NC_010070	TGACG	2	10	147459	147468	20 %	20 %	40 %	20 %	161506612
91	NC_010070	CGAAG	2	10	147770	147779	40 %	0 %	40 %	20 %	161506612
92	NC_010070	CGGCG	2	10	148436	148445	0 %	0 %	60 %	40 %	161506614
93	NC_010070	ACGGT	2	10	148759	148768	20 %	20 %	40 %	20 %	161506614
94	NC_010070	CGTCG	2	10	152155	152164	0 %	20 %	40 %	40 %	161506615
95	NC_010070	AGACG	2	10	154397	154406	40 %	0 %	40 %	20 %	161506617
96	NC_010070	TCGCT	2	10	155703	155712	0 %	40 %	20 %	40 %	161506619
97	NC_010070	GAGCA	2	10	156986	156995	40 %	0 %	40 %	20 %	161506620
98	NC_010070	CTTTG	2	10	157842	157851	0 %	60 %	20 %	20 %	161506622
99	NC_010070	TGCGG	2	10	159399	159408	0 %	20 %	60 %	20 %	161506624
100	NC_010070	TTCGC	2	10	160627	160636	0 %	40 %	20 %	40 %	161506624
101	NC_010070	GTCGG	2	10	161042	161051	0 %	20 %	60 %	20 %	161506625
102	NC_010070	GACAC	2	10	161264	161273	40 %	0 %	20 %	40 %	161506626
103	NC_010070	CGTCA	2	10	163827	163836	20 %	20 %	20 %	40 %	161506628
104	NC_010070	TGAGA	2	10	164423	164432	40 %	20 %	40 %	0 %	161506629
105	NC_010070	GGCGG	2	10	165017	165026	0 %	0 %	80 %	20 %	161506630
106	NC_010070	CTTTC	2	10	165099	165108	0 %	60 %	0 %	40 %	161506631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.