MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pBMUL01

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010070	GAAA	2	8	2998	3005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010070	TGAT	2	8	3396	3403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010070	AAGG	2	8	6280	6287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010070	AGCG	2	8	6970	6977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010070	GCGG	2	8	15432	15439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010070	CGTG	2	8	15858	15865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010070	GGAC	2	8	15918	15925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010070	TGCG	2	8	17841	17848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010070	TCAA	2	8	19794	19801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010070	ACGC	2	8	21692	21699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010070	GAAG	2	8	21715	21722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010070	AGGC	2	8	22692	22699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010070	TTCG	2	8	23406	23413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010070	CTGT	2	8	23498	23505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010070	TACC	2	8	23724	23731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010070	TCAA	2	8	28392	28399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010070	TCAA	2	8	28540	28547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010070	TCAA	2	8	28581	28588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010070	TTGG	2	8	29281	29288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010070	GTCG	2	8	29393	29400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010070	CGGT	2	8	29856	29863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010070	CGAT	2	8	30148	30155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010070	CACC	2	8	30748	30755	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_010070	TCGC	2	8	31129	31136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010070	CGAT	2	8	31205	31212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010070	AAAC	2	8	34497	34504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010070	TGCT	2	8	36208	36215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010070	CTCG	2	8	36424	36431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010070	GCCG	2	8	36539	36546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010070	GCCG	2	8	36552	36559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010070	AGCA	2	8	36733	36740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010070	TCGT	2	8	36762	36769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010070	CTCC	2	8	36842	36849	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_010070	TCGA	2	8	37432	37439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010070	TTAG	2	8	37513	37520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010070	AGCC	2	8	37701	37708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010070	CGGC	2	8	37730	37737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010070	CTCC	2	8	38030	38037	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_010070	CCCT	2	8	40688	40695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_010070	CATA	2	8	40712	40719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010070	CCGA	2	8	41003	41010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010070	GTTG	2	8	41152	41159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010070	CGGG	2	8	41510	41517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010070	GCCG	2	8	41532	41539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010070	GCCC	2	8	41854	41861	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_010070	CTGC	2	8	42112	42119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010070	CCGG	2	8	44173	44180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010070	AAAC	2	8	45301	45308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010070	AGCC	2	8	45785	45792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010070	CGTG	2	8	47389	47396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010070	GGGT	2	8	47556	47563	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010070	GACG	2	8	47589	47596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010070	AAAC	2	8	48107	48114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010070	CGCC	2	8	48825	48832	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_010070	TGAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010070	CGGC	2	8	49342	49349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010070	CCGT	2	8	49536	49543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010070	TGCG	2	8	49926	49933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010070	GGAA	2	8	50297	50304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010070	GTCC	2	8	50739	50746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010070	TTCA	2	8	53684	53691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010070	GCGG	2	8	53700	53707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010070	GCTC	2	8	57127	57134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010070	CGTG	2	8	66167	66174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010070	AGTC	2	8	68597	68604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010070	CCGA	2	8	68663	68670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010070	CGAA	2	8	68744	68751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010070	GGTC	2	8	68802	68809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010070	AGCG	2	8	68881	68888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010070	CTTT	2	8	68967	68974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010070	CGAC	2	8	69304	69311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010070	ATCG	2	8	69353	69360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010070	CTCA	2	8	69441	69448	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010070	ATTC	2	8	69811	69818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010070	AGTC	2	8	70789	70796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010070	CGGT	2	8	71178	71185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010070	CGCA	2	8	71740	71747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010070	TTGG	2	8	71801	71808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010070	AGAC	2	8	71852	71859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010070	GGCA	2	8	74807	74814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010070	ATCG	2	8	78146	78153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010070	TAAA	2	8	78409	78416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010070	ATTC	2	8	79703	79710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010070	CGGA	2	8	86684	86691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010070	CGAG	2	8	97182	97189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010070	CGTG	2	8	99085	99092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010070	CCGA	2	8	99122	99129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010070	CCGC	2	8	101726	101733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_010070	TCGC	2	8	101734	101741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010070	CGAG	2	8	106788	106795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010070	CGGC	2	8	108197	108204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010070	GGAT	2	8	109148	109155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010070	TGGT	2	8	110475	110482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010070	GCCC	2	8	112289	112296	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_010070	CGGC	2	8	112560	112567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010070	GGTC	2	8	113502	113509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010070	CATC	2	8	113819	113826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010070	TCAA	2	8	115926	115933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010070	TCGC	2	8	116099	116106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010070	GCCA	2	8	116140	116147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010070	GCCG	2	8	117398	117405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010070	CCGG	2	8	118188	118195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010070	GAGC	2	8	120531	120538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010070	CGGC	2	8	124325	124332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010070	GCCC	2	8	124667	124674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_010070	GGGC	2	8	124681	124688	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010070	TTGA	2	8	124730	124737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010070	ATCG	2	8	126603	126610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010070	GCGA	2	8	127584	127591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010070	GCCA	2	8	137867	137874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010070	GACA	2	8	137950	137957	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010070	CGCA	2	8	155303	155310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010070	CATC	2	8	155463	155470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010070	GTGC	2	8	155632	155639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.