MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 14

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	TTTTTG	2	12	3627	3638	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010063	TAATTT	2	12	4941	4952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161510930
3	NC_010063	ATCCAC	2	12	6546	6557	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010063	ATTTTT	2	12	8173	8184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161510933
5	NC_010063	CAATTA	2	12	8730	8741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161510933
6	NC_010063	ATTATA	2	12	9873	9884	50 %	50 %	0 %	0 %	161510934
7	NC_010063	ACAGGT	2	12	10445	10456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161510934
8	NC_010063	TTAAAC	2	12	12951	12962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161510938
9	NC_010063	GTTTAA	2	12	16604	16615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161510941
10	NC_010063	CTGATA	2	12	18258	18269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161510943
11	NC_010063	ATGTAG	2	12	19120	19131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010063	GTTTAA	2	12	20613	20624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161510944
13	NC_010063	AAAAGA	2	12	24735	24746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	161510947
14	NC_010063	TTTTTC	2	12	26397	26408	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161510950

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.