MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA300HOUMR

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010063	AATAT	2	10	1192	1201	60 %	40 %	0 %	0 %	161510925
2	NC_010063	TTAAA	2	10	1739	1748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010063	TAGAT	2	10	3446	3455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010063	TGTGA	2	10	5153	5162	20 %	40 %	40 %	0 %	161510931
5	NC_010063	GCTGT	2	10	5682	5691	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010063	CTTTT	2	10	6320	6329	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010063	ATGAT	2	10	6921	6930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010063	AGAAA	2	10	7281	7290	80 %	0 %	20 %	0 %	161510932
9	NC_010063	TAGCT	2	10	7445	7454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010063	TAATT	2	10	8276	8285	40 %	60 %	0 %	0 %	161510933
11	NC_010063	CATAA	2	10	9101	9110	60 %	20 %	0 %	20 %	161510934
12	NC_010063	GATAC	2	10	9305	9314	40 %	20 %	20 %	20 %	161510934
13	NC_010063	CTCAA	2	10	10233	10242	40 %	20 %	0 %	40 %	161510934
14	NC_010063	AATTA	2	10	10245	10254	60 %	40 %	0 %	0 %	161510934
15	NC_010063	AATAT	2	10	10662	10671	60 %	40 %	0 %	0 %	161510935
16	NC_010063	TAATT	2	10	11611	11620	40 %	60 %	0 %	0 %	161510936
17	NC_010063	ATTGA	2	10	13450	13459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010063	GATTT	2	10	13602	13611	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010063	ATTAT	2	10	17084	17093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010063	ATTAT	2	10	18944	18953	40 %	60 %	0 %	0 %	161510943
21	NC_010063	TTGAT	2	10	19665	19674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010063	AATAC	2	10	19836	19845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010063	ATTAT	2	10	21093	21102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010063	CAAAA	2	10	22237	22246	80 %	0 %	0 %	20 %	161510945
25	NC_010063	CAAAA	2	10	22282	22291	80 %	0 %	0 %	20 %	161510945
26	NC_010063	AAAAT	2	10	22402	22411	80 %	20 %	0 %	0 %	161510945
27	NC_010063	GACTG	2	10	23756	23765	20 %	20 %	40 %	20 %	161510946
28	NC_010063	CTTTA	2	10	24938	24947	20 %	60 %	0 %	20 %	161510947
29	NC_010063	TACTA	2	10	25647	25656	40 %	40 %	0 %	20 %	161510948

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.